李旭凯
- 作品数:5 被引量:7H指数:2
- 供职机构:华中农业大学更多>>
- 发文基金:中央高校基本科研业务费专项资金中国博士后科学基金湖北省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- 棉花GhPME1和GhPME2基因的克隆及表达分析被引量:2
- 2012年
- 本研究旨在对棉花来源的果胶甲酯酶基因进行克隆和功能分析。通过RACE技术克隆了2个棉花果胶甲酯酶基因的cDNA,命名为GhPME1和GhPME2。序列分析发现:GhPME1和GhPME2的最大开放阅读框分别为1 704和1 752bp,分别编码含有567和582个氨基酸的蛋白质。蛋白质结构预测显示这2个蛋白结构相似,包含PMEI和Pectinesterase结构域。RT-PCR和实时荧光定量PCR结果显示在陆地棉的纤维发育过程中,GhPME1和GhPME2的表达峰值分别在9和4DPA(开花后天数),然后依次降低。而在海岛棉纤维中,这2个基因的表达均呈现逐渐上升的趋势,表达峰值分别出现在开花后24和29DPA。GhPME1和GhPME2在海岛棉和陆地棉棉纤维中的表达差异初步证明该基因家族的功能可能与棉纤维品质相关。
- 陈婷婷李旭凯王如意彭良才夏涛
- 关键词:棉纤维果胶甲酯酶基因表达
- 水稻半纤维素支链合酶基因GT61家族的结构特征和组织表达分析被引量:1
- 2015年
- 从生物信息学和基因表达的角度,鉴定OsGT61家族成员的结构特征和组织表达特性。结果表明,OsGT61家族含有25个成员,分为3个亚类。A、B和C亚类分别含有19、3和3个成员,其基因的外显子数介于1~7个。其蛋白质大小为49.1~73.8ku,pI为5.4~10.4。该家族蛋白质的C端motif较为保守。而且,它们含有Ser/Thr激酶的磷酸化位点分别为9~29个和3~13个,Tyr激酶的磷酸化位点小于7个。但是,该家族成员的糖基化位点相对较少,16个成员存在1~4个O-糖基化位点,3个蛋白存在1~2个N-糖基化位点。基因表达芯片聚类分析和半定量RT-PCR检测表明,OsGT61基因家族主要成员在不同组织中表达水平存在明显差异。这些结果暗示OsGT61家族基因在水稻不同组织中细胞壁半纤维素生物合成中发挥不同作用。
- 易晓燕李丰成郭凯张冉李旭凯王友梅彭良才谢国生
- 关键词:水稻半纤维素
- 稻属AA基因组转座子功能解析和中国芒草地理分布与生物质降解效率分析
- 本研究分为二部分: 第一部分、稻属AA基因组转座子比较研究 转座子(transposableelements,TE)是一类可以通过自身编码的酶进行切割、复制、重新整合等一系列生物化学过程,在基因组不同位置间移动的、重...
- 李旭凯
- 关键词:芒草地理分布
- 文献传递
- ChooseMaterials.pl,控制变量挑选实验材料的perl脚本被引量:1
- 2013年
- 用Perl语言编写了一个脚本—ChooseMaterials.pl,通过计算两个材料特定某几列数据之间增加或减少的百分数水平,达到控制变量突出关键因子的作用,方便生物学工作者选取材料,做进一步的实验或分析。
- 李旭凯李旭凯郭凯王令强
- 关键词:PL
- pep_pattern.Pl,搜索蛋白质序列模体的Perl脚本被引量:3
- 2014年
- 用Perl语言编写了一个pep_pattern.pl脚本,可从一组相关序列中搜索非常相似的序列片段,通过匹配所有可能的氨基酸片段的排列,统计每个匹配模体在序列中的出现频率和位置,搜索蛋白质序列中的2~4个多肽的模体。
- 李旭凯李旭凯王令强
- 关键词:PL蛋白质序列