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王珺
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
中国科学院
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发文基金:
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
高峰
山东经济学院计算机科学与技术学...
董骝焕
中国科学院
李防震
山东经济学院计算机科学与技术学...
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作者
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李防震
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王珺
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高峰
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中山大学学报...
年份
1篇
2011
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基于置换距离度量的蛋白质多序列比对算法性能评估
被引量:1
2011年
蛋白质多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着重要的应用。各种比对算法在这个领域都取得了很大的成功,但是每种算法都有其固有的缺陷。提出置换距离法,对当前流行的几种蛋白质多序列比对算法进行对比评价。由于置换距离法仅关注于不同蛋白质间进化距离的相对次序,而不考虑这些进化距离之间的细微差异,因而得到的评价结论更具有鲁棒性。另外,采用最长公共子序法度量置换距离可以比较准确的反映不同置换之间的差异性。基于该算法,对Dialign,Tcoffee,ClustalW和Muscle多序列比对算法进行了性能评估。
高峰
李防震
王珺
董骝焕
关键词:
多序列比对
进化距离
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