张俊亚
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：上海大学生命科学学院上海市能源作物育种及应用重点实验室更多>>
- 发文基金：上海大学创新基金上海市高校选拔培养优秀青年教师科研专项基金上海市科学技术委员会重点实验室专项资金项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- Cupriavidus necator JMP134细菌人工染色体基因组文库的构建与鉴定被引量：1
- 2011年
- Cupriavidus necator JMP134(C.necator JMP134)可以降解60多种芳香族化合物,在环境污染治理方面具有良好的应用前景.该菌株基因组含有两个苯酚降解基因簇,克隆并研究其功能具有重要的理论和应用价值.以pIndigo-BAC 5为载体,构建了C.necator JMP134的细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome,BAC)基因组文库.该文库约有9 600个克隆,插入频率为99%,平均插入片段大小达到65 kb,由此推测该BAC文库覆盖该菌株基因组约860倍.通过PCR筛选该文库的800个单克隆,得到11个含有C.necator JMP134菌株的苯酚羟化酶大亚基基因phlN2的阳性克隆.研究结果表明,该文库是一个高质量、高覆盖率的BAC文库,能有效用于目的基因簇的分离.
- 张俊亚宋任涛许政暟朱晨光
- 关键词：苯酚降解细菌人工染色体文库
- Cupriavidus metallidurans CH34中2个苯酚降解基因簇的筛选与功能鉴定被引量：2
- 2012年
- Cupriavidus metallidurans(C.metallidurans)CH34是一种重金属耐受性细菌,能在以苯酚、甲苯酚、苯甲酸、苯胺等芳香族化合物为唯一碳源和能源的培养基中生长,其基因组中含有2个苯酚降解基因簇.以载体pIndigo-BAC 5构建C.metallidurans CH34的细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome,BAC)文库,获得约3万个克隆,平均插入片段大小为30 kb,插入频率为98%,推测该文库覆盖CH34基因组约1 240倍.用PCR筛选文库中的3 000个单克隆,共获得9个阳性克隆,其中5个克隆含有长基因簇,4个含有短基因簇,并从中得到含有全长苯酚降解基因簇的克隆.利用以苯酚为唯一碳源的无机盐培养基,研究2个基因簇在大肠杆菌中的表达情况.结果显示,两个基因簇均表现出了苯酚降解能力,短簇的降酚能力要优于长簇.
- 李莉张俊亚唐远平宋任涛朱晨光
- 关键词：CH34基因组细菌人工染色体文库苯酚基因簇
