秦珂
- 作品数：8 被引量：29H指数：3
- 供职机构：中山大学生命科学学院有害生物控制与资源利用国家重点实验室更多>>
- 发文基金：广东省自然科学基金国家科技重大专项国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 陆川猪MC1R和KIT基因型鉴定被引量：3
- 2017年
- 为了检测陆川猪种群的纯度,本研究以4个华南地方猪种(莆田黑猪、粤东黑猪、大花白猪、巴马香猪)和3个外来猪种(杜洛克猪、大白猪、长白猪)作为对照,利用PCR测序法对陆川猪群体56个样本的MC1R和KIT基因进行基因型鉴定。测序结果表明,大白猪和长白猪KIT基因内含子17的第1个碱基发生G>A剪接突变,而陆川猪和4个华南地方猪种,以及杜洛克猪中KIT基因型一样,均为野生型的GG基因型;MC1R基因编码区分析表明,以海南野猪MC1R基因型作为参考序列,陆川猪和4个华南地方猪种在MC1R基因编码区存在95Val>Met和102Leu>Pro两个错义突变;MC1R基因非编码区分析表明,与大白猪、长白猪和杜洛克猪相比,陆川猪和4个华南地方猪种MC1R基因的5′UTR分别存在5~6个SNPs,3′UTR存在1个A碱基的缺失。另外,试验对一窝毛色异常的陆川猪仔猪及其亲本的KIT和MC1R基因进行测序分析,结果表明,仔猪及其亲本的KIT基因型均为GG野生型,仔猪和母本的MC1R基因均存在ED1和Ep两种不同的基因型,父本的MC1R基因型为ED1,因Ep对应于皮特兰猪的斑块表型,所以初步判定母本渗入了外来猪种的血统。本研究通过检测陆川猪等8个猪种的毛色相关基因KIT和MC1R基因的基因型,证实了中外猪种间在毛色遗传上的分子差异,为今后深入研究猪毛色遗传的分子调控机理提供参考。
- 秦珂黄翔曾检华王晨孙冠杰宋德清陈瑶生刘小红何祖勇
- 关键词：陆川猪毛色KIT基因MC1R基因
- 不同地方猪种VRTN基因291bp插入/缺失多态性分布以及与总乳头数的关联分析
- 引言 我国地方猪品种有88个,一些地方猪品种间或品种内的乳头总数均呈现较大差异.猪的乳头数属于中等遗传力性状(0.22～0.41),是度量繁殖性状中一个重要指标.研究表明,VRTN基因启动子区存在291bp的插入/缺失,...
- 王晨李秀金秦珂莫德林陈瑶生刘小红
- 关键词：乳头数
- 基于CYB5A基因的广东小耳花猪群体遗传背景检测被引量：1
- 2016年
- 广东小耳花猪是广东省饲养量最大的地方猪品种,农户自繁自养过程中可能混入外来猪种血缘,实际生产中主要通过表型进行评估和选育。CYB5A基因启动子中的突变位点可以鉴定中外猪种遗传背景,因此可通过分子方法检测广东小耳花猪群体中是否混有外来猪种血缘。采用PCR扩增CYB5A基因启动子并进行单向直接测序,将得到的基因序列进行对比以鉴定变异位点。结果显示,32头种猪和36头后备母猪中均有1头为杂合子AB型,A等位基因频率分别为0.0152和0.0139,其余种猪和后备母猪均为中国猪种纯合子BB型。经卡方检验,种猪和后备母猪群体在检测位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),表明外来猪种该位点在广东小耳花猪群体内没有受到人工选择。该AB型种母猪毛色表型正常,与纯种广东小耳花猪BB型公猪配种生出6头毛色异常仔猪,其中2头为杂合子AB型。该种母猪与杜洛克公猪配种后生出红毛仔猪,该杂交后代的表型也验证其混有外来猪血缘,表明分子鉴定的准确性。研究结果表明,广东小耳花猪群体的血统基本纯正,只有极少数个体混有外来猪种血缘,通过表型选择与分子辅助育种相结合的方法可以准确、快速地提纯该地方品种。
- 王晨曾检华秦珂何祖勇陈瑶生刘小红
- 关键词：外来猪种
- 全基因组选择在猪育种中的应用被引量：23
- 2016年
- 全基因组选择(Genomic selection,GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能够更加准确地早期预测估计育种值,降低近交系数,大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪60kSNP芯片的商业化,全基因组选择已经成为猪育种研究领域的新热点。本文综述了全基因组选择的分析方法、计算方法和影响因素,并阐述了全基因组选择在猪育种中的应用情况和发展趋势。
- 王晨秦珂薛明莫德林陈瑶生刘小红
- 关键词：全基因组选择育种
- 通过基因编辑MC1R基因改变杜洛克猪的毛色
- 引言 黑素皮质素受体1基因(Melanocortin Receptorl,MC1R)作为影响猪毛色的主效基因之一,作为受体蛋白,主要表达在黑色素细胞表面,通过与激活剂α-黑素细胞刺激激素(α-MSH)或拮抗剂刺鼠蛋白(A...
- 石翾秦珂丛佩清刘红波陈清森刘小红陈瑶生何祖勇
- 关键词：杜洛克毛色MC1R基因
- 修复KIT基因突变对大白猪血液参数的影响
- 引言家猪毛色变白主要是由于基因组中包含整个KIT 基因的长达450 kb 的DNA 片段发生串联重复,同时其中某一拷贝的KIT 基因还发生了一个剪接突变,即内含子17 的第一个碱基G突变为A,导致KIT 基因mRNA 成...
- 张楷秦珂梁鑫瑜刘小红陈瑶生何祖勇
- 关键词：血红蛋白红细胞
- 利用基因编辑小鼠模型研究猪KIT基因突变对毛色等性状的影响
- 孙冠杰秦珂陈瑶生何祖勇
- 关键词：小鼠C-KIT毛色生殖免疫
- 杜洛克×陆川猪杂交F_1代MC1R基因型分析被引量：3
- 2017年
- 为了解释杜洛克和陆川猪杂交F_1代毛色分离现象,以5窝黑毛全同胞杜陆仔猪及其母本为对照,利用PCR测序法对4窝毛色异常全同胞杜陆仔猪及其母本的MC1R基因型进行分析。结果表明,5窝黑毛全同胞杜陆仔猪MC1R基因型均为ED1/e,母本MC1R基因型均为ED1/ED1;4窝毛色异常全同胞杜陆仔猪中,黑毛杜陆猪MC1R基因型均为ED1/e,红毛杜陆猪MC1R基因型均为e/e,母本MC1R基因型均为ED1/e。由于纯种杜洛克MC1R基因型为e/e,纯种陆川猪MC1R基因型为ED1/ED1,理论上其杂交F_1代杜陆猪MC1R基因型应该为ED1/e,毛色表现为黑色。研究结果显示,产毛色分离仔猪的母本为杂合子,含有杜洛克血统,因此,杂合子母猪和杜洛克杂交产生MC1R基因型表现为纯种杜洛克所特有的e/e,子代表现为红毛,从分子水平揭示了杜陆猪毛色分离的原因。以MC1R基因为分子标记可以指导猪场快速淘汰杂合子陆川猪母本,迅速纯化基础群。
- 秦珂曾检华薛明宋德清杨红杰何祖勇刘小红
- 关键词：杜洛克陆川猪MC1R基因
