薛波
- 作品数：4 被引量：4H指数：1
- 供职机构：大理州烟草公司更多>>
- 发文基金：云南省烟草专卖局(公司)科技项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 烟草PPO蛋白序列的生物信息学分析
- 2019年
- 烟草PPO蛋白具有功能多样性。为分析其功能,采用NetPhos、swissmodel和TargetP在线工具分析烟草PPO成员的磷酸化位点、三维结构和亚细胞定位。结果显示:NtPPO1、NtPPO2和Nt PPO3均含有丝氨酸位点、苏氨酸位点和酪氨酸位点,其中NtPPO1和NtPPO2的磷酸化位点数(63和64)及排列规律较为相似,而NtPPO3与其具有较大的差异;NtPPO1和NtPPO2的三维结构模板为4z11.1.A,而NtPPO3模板为4z12.1.A,此外,NtPPO1、NtPPO2和NtPPO3的β-折叠主要集中在序列的N端,具有类似于儿茶酚氧化酶的功能;NtPPO1和NtPPO2主要在线粒体中发挥功能。
- 田熙薛波徐成龙杨彦明王德勋户艳霞苏家恩
- 关键词：烟草生物信息学
- 烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶生物信息学分析被引量：1
- 2019年
- 烟草的抗性与其组织的木质素含量具有一定的关系,而咖啡酸3-O-甲基转移酶影响木质素的合成。为清楚地认识烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶,本研究采用Interpro、NetPhos和TNT工具对烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶成员的结构域、磷酸化位点和进化树进行分析。结果表明,烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶具有相同的植物甲基转移酶二聚化结构域和O-甲基转移酶结构域,前者位于烟草咖啡酸3-O-甲基转移酶序列的第33～85位之间,后者位于序列的第128～358位之间;NtCOMT1和NtCOMT2的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸数目较为相似,而NtCOMT3的磷酸化位点数目明显大于NtCOMT1和NtCOMT2的数目,且三者均以酪氨酸数目最少;NtCOMT3属于进化树的第一类,而NtCOMT1和NtCOMT2属于进化树的第二类,烟草与马铃薯的咖啡酸3-O-甲基转移酶进化程度较为相似。
- 薛波田熙徐成龙杨彦明王德勋户艳霞苏家恩
- 关键词：烟草生物信息
- 生物炭施用量对‘红花大金元’烤烟产量品质的影响被引量：3
- 2016年
- 通过设置不同的生物炭施用量梯度,研究其对红花大金元产量品质的影响。试验于2015年3—9月在云南省剑川县甸南镇连作植烟达12 a的田块上进行。试验结果表明,施用生物炭6000 kg/hm2的处理与空白对照相比,在株高、茎围上有显著的生长优势,同时施用生物炭的处理黑胫病病情指数要明显低于空白对照,且产量、上等烟比例、均价等均优于空白对照。
- 张俊曾彦清杨佑斋杨玉坤薛波洪赐麟
- 关键词：生物炭施用量烟草红花大金元
- 烟草泛素激活酶E1生物信息学分析
- 2019年
- 为从生物信息的角度研究烟草泛素激活酶E1,使用Sopma、Swiss model和Meme工具分析烟草泛素激活酶E1序列的二级结构、空间结构和保守基序。结果表明:烟草泛素激活酶E1的各成员中,以NtUAE2的α-螺旋含量最大,空间结构较为稳定;烟草泛素激活酶E1空间结构的主体结构具有3个分支,功能域位于其间,NtUAE1和NtUAE2空间结构模板为6dc6.2.A;NtUAE3的模板为3cmm.2.A;烟草泛素激活酶E1的保守基序中,Motif 3和Motif 4为泛素激活酶的催化半胱氨酸结构域。
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- 关键词：烟草生物信息学
