郭婷
- 作品数:7 被引量:9H指数:2
- 供职机构:上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金:上海市自然科学基金上海市教育发展基金上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 草鱼瘦素受体基因片段序列的克隆及其组织表达分析被引量:2
- 2011年
- 根据斑马鱼、大西洋鲑和人等物种已知的瘦素受体基因核苷酸保守区序列设计一对简并引物,通过RT-PCR法从草鱼肝胰脏中首次克隆获得草鱼瘦素受体基因的片段序列。该片段序列长713 bp,编码237个氨基酸,氨基酸序列分析表明草鱼瘦素受体基因片段氨基酸序列与其他物种的相似性在35%-86%之间。通过邻接法(Neighbor Joining,NJ)构建系统进化树显示,鱼类的瘦素受体独立聚成一支,草鱼与金鱼、斑马鱼聚成一支,再与日本青鳉、黑点青鳉、红鳍东方鲀和大西洋鲑聚成一支。通过实时荧光定量PCR分析草鱼瘦素受体基因的组织差异表达,结果表明,草鱼瘦素受体基因在肝胰脏、肌肉、脑、心脏、脾和肠系膜脂肪组织中均有表达,其中在脾脏组织中表达量最多,显著高于其他组织(P<0.05),其次是心脏、脑、肌肉和肠系膜脂肪组织,在肝胰脏组织中表达量最低,且显著低于其他组织(P<0.05)。
- 吴小凤李小勤冷向军关磊郭婷
- 关键词:草鱼瘦素受体基因克隆实时荧光定量PCR
- 草鱼STAT3基因的全长克隆、生物信息学分析及组织表达分析
- JAK2/STAT3信号转导通路在免疫调节和脂肪代谢等过程中起着重要调控作用。本实验利用cDNA末端快速扩增(RACE)法获得草鱼STAT3基因全长,采用生物信息学对该基因及其编码蛋白12个特征进行分析预测,并应用RT-...
- 郭婷冷向军吴小凤李家乐高建忠李小勤甘甜魏静
- 关键词:草鱼STAT3基因RACE生物信息学分析
- 草鱼PAX7基因片段克隆、序列分析及其功能分析
- PAX7在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色,对细胞更新、分化、凋亡等十分重要的调控作用。本实验参照Genebank中的斑马鱼、线鳍电鳗、虹鳟等物种配对盒基因7(Pairedbox 7 gene,...
- 甘甜郭婷单玲玲郑小淼胡静魏静李小勤冷向军
- 关键词:草鱼功能分析
- 草鱼PAX7基因的克隆、序列分析及组织表达被引量:2
- 2014年
- 配对盒基因7(Paired box 7 gene,PAX7)在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色,对细胞更新、分化、凋亡等起着十分重要的调控作用。参照Gen Bank中斑马鱼、线鳍电鳗和虹鳟等物种PAX7序列的保守区域设计简并引物,进行反转录PCR扩增,获得草鱼PAX7基因的部分序列,长645 bp,编码214个氨基酸,包含编码128个氨基酸的PAX7蛋白配对框(PD)。氨基酸序列比对结果发现,草鱼PAX7基因与其他物种具有高度的相似性,与斑马鱼、线鳍电鳗、日本青鳉、金头鲷、虹鳟、大西洋鲑、北极嘉鱼、人、野牦牛、褐家鼠和小鼠的PAX7氨基酸序列同源性可达90%-97%;各物种PAX7部分氨基酸序列的系统进化树结果显示,草鱼与斑马鱼、日本青鳉、北极嘉鱼、大西洋鲑、虹鳟、线鳍电鳗和金头鲷聚为一大支,小鼠、褐家鼠,野牦牛与人类另聚一支,所得结果符合物种传统分类进化地位。运用实时荧光定量PCR检测草鱼PAX7基因在各组织中的差异表达,结果显示PAX7基因在肌肉中表达量最高;其次是前肠和皮肤,在心、脑、肾和肝中仅少量表达,所得结果与该基因的功能相一致。
- 甘甜冷向军郭婷胡静魏静李小勤
- 关键词:草鱼
- 草鱼PAX7基因片段克隆、序列分析及其功能分析
- PAX7在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色,对细胞更新、分化、凋亡等十分重要的调控作用。本实验参照Genebank中的斑马鱼、线鳍电鳗、虹鳟等物种配对盒基因7(Paired box 7 gene...
- 甘甜郭婷单玲玲郑小淼胡静魏静李小勤冷向军
- 关键词:草鱼功能分析
- 草鱼STAT3基因的全长克隆、生物信息学分析及组织表达分析
- JAK2/STAT3信号转导通路在免疫调节和脂肪代谢等过程中起着重要调控作用.本实验利用cDNA末端快速扩增(RACE)法获得草鱼STAT3基因全长,采用生物信息学对该基因及其编码蛋白12个特征进行分析预测,并应用RT-...
- 郭婷冷向军吴小凤李家乐高建忠李小勤甘甜魏静
- 关键词:草鱼STAT3基因RACE生物信息学分析
- 草鱼JAK2基因片段序列的克隆及其组织表达分析被引量:5
- 2012年
- 通过实时荧光定量PCR(RT-PCR)法从草鱼肝脏中首次克隆获得草鱼JAK2基因的片段序列。该片段序列长671 bp,编码223个氨基酸,氨基酸序列分析表明草鱼JAK2基因片段与其他物种的相似性在70%~91%之间;系统进化树显示,鱼类的JAK2独立聚成一支,草鱼与斑马鱼聚成一支,与鳜鱼和墨绿凹鼻鲀聚成的一支再聚成一支。实时荧光定量PCR分析表明,草鱼JAK2基因在肝脏、肌肉、脑、心脏、脾脏和肠系膜脂肪组织中均有表达,其中在肝脏组织中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05),其次是肌肉、脑、脾脏和肠系膜脂肪组织,在心脏组织中表达量最低,且显著低于其他组织(P<0.05)。本研究为进一步研究草鱼JAK2基因的结构和功能奠定了基础。研究亮点:JAK2基因在鱼类上的研究报道甚少。本研究首次克隆了草鱼JAK2基因片段序列;且发现JAK2基因在肝脏组织中表达量最高,心脏组织中表达量最低,为草鱼JAK2基因的结构及其信号转导等生理功能的深入研究奠定了基础。
- 吴小凤李小勤冷向军关磊郭婷
- 关键词:草鱼JAK2基因克隆实时荧光定量PCR