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文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学

主题

  • 3篇多样性
  • 2篇RRNA基因
  • 1篇大峡谷
  • 1篇土壤
  • 1篇土壤放线菌
  • 1篇怒江大峡谷
  • 1篇细菌
  • 1篇孟加拉虎
  • 1篇焦磷酸
  • 1篇放线菌
  • 1篇放线菌多样性
  • 1篇粪便
  • 1篇粪便细菌
  • 1篇16S_RD...
  • 1篇哺乳动物
  • 1篇测序
  • 1篇测序分析

机构

  • 3篇云南大学
  • 2篇东北大学
  • 1篇上海交通大学
  • 1篇西北农林科技...

作者

  • 3篇姜怡
  • 3篇陈秀
  • 2篇李沁元
  • 1篇张晓君
  • 1篇赵立平
  • 1篇和文祥
  • 1篇姜成林
  • 1篇靳荣线
  • 1篇曹艳茹

传媒

  • 2篇微生物学报
  • 1篇微生物学通报

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2015
  • 1篇2012
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
怒江大峡谷怒江州段土壤放线菌多样性被引量:8
2018年
【背景】怒江大峡谷怒江州段凭借独特的地理环境、丰富的动植物多样性以及极少的人为干扰,拥有很高的生物多样性调查价值,但对于该生境中的放线菌多样性研究尚未见相关报道。【目的】研究怒江大峡谷怒江州段土壤放线菌多样性情况。【方法】利用Illumina Hi Seq平台对怒江州段土壤样品放线菌免培养多样性进行高通量测序,通过相对丰度、物种聚类、主成分分析对不同样品中放线菌组成及其相似性进行了分析。同时通过9种不同类型培养基结合有效的预处理方法和非目的菌抑制剂进行放线菌的纯培养分离。【结果】高通量测序共获得Tag数目474 203条,OTU数目15 671个,它们分布于细菌域下的47个门90个纲170个目320个科561个属。通过不同样品的比较,发现BS、F-G、F-L、L样品的放线菌免培养多样性普遍优于丙中洛样点的BB、BT、BH样品。纯培养分离共获得351株放线菌,分布于放线菌纲下8个目14个科26个属。所用9种培养基中,YIM171培养基的分离效果最好。通过比较不同样品的放线菌纯培养多样性,丙中洛混合样明显优于其他样品。【结论】怒江大峡谷怒江州段土壤样品中放线菌多样性丰富,应进一步挖掘其放线菌资源潜力,为今后放线菌次生代谢产物的开发提供有效的菌株资源。
徐方继李桂鼎李沁元陈秀陈秀姜成林
关键词:怒江大峡谷土壤放线菌多样性RRNA基因
孟加拉虎粪便放线菌的分离及其多样性被引量:3
2012年
【目的】建立有效分离动物粪便放线菌的方法,认识孟加拉虎粪便放线菌的多样性。【方法】从预处理、抑制剂、培养基三个方面考虑,采用平板稀释的分离方法。用细菌通用引物扩增获得放线菌菌株的16SrRNA基因,根据系统发育分析进行鉴定。【结果】孟加拉虎粪便样品中,可培养放线菌的菌落平均数量为1.10×108cfu/g(粪便湿重);对分离到的110株纯培养放线菌的16S rRNA基因部分序列分析表明:它们分布于10个科、12个属,主要是一些菌丝分化程度低的放线菌,如:Arthrobacter、Dietzia、Kocuria、Corynebacterium、Microbacterium等;产丝的放线菌主要以Streptomyces占优势,约占分离到放线菌总数的64%。【结论】干热处理粪便样品可以大大提高放线菌的出菌率;添加多种抑制剂及不含天然成分的组合培养基较适合粪便放线菌的分离;孟加拉虎粪便中可培养放线菌的多样性较丰富。本研究提供的分离动物粪便放线菌的有效方法,为动物粪便放线菌资源的研究和开发利用提供了借鉴作用。
曹艳茹姜怡李有龙陈秀靳荣线和文祥
关键词:孟加拉虎RRNA基因多样性
454焦磷酸测序分析几种哺乳动物粪便细菌多样性被引量:7
2015年
【目的】分析比较几种哺乳动物粪便细菌群落多样性,了解粪便细菌多样性与动物进化和食物的关系。【方法】采集6种哺乳动物粪便样品;提取总DNA;PCR扩增,获得16S rDNA V3标签片段;用454焦磷酸测序技术进行高通量测序;主要基于QIIME平台分析比较粪便细菌多样性。【结果】分析发现,厚壁菌门和拟杆菌门广泛存在于各样品中,并且占绝对优势。α多样性分析发现,杂食性的长臂猿、黑猩猩和川金丝猴的多样性最高,其次是肉食性的东北虎,来自熊科杂食性的亚洲黑熊和大熊猫的多样性最低。β多样性分析发现,白眉长臂猿、黑猩猩、川金丝猴几种灵长目动物粪便的菌群相似,而大熊猫菌、黑熊、孟加拉虎几种食肉目动物粪便细菌群相似但食肉动物孟加拉虎主要又因含梭杆菌门而区别于其他动物。【结论】动物粪便细菌优势类群明显;同种动物重复样本的相似性最高,各种动物多样性存在差异,但几种灵长类动物粪便细菌多样性更丰富;动物粪便细菌的组成和动物的进化及食物相关。本研究为哺乳动物粪便菌资源及后续研究提供了借鉴。
陈秀张晓君李沁元薛正晟李桂鼎贾鳗赵立平姜怡
关键词:哺乳动物粪便细菌多样性
共1页<1>
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