陈维军
- 作品数：2 被引量：25H指数：2
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：国家科技部专项基金国家自然科学基金中国科学院科研项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析被引量：23
- 2003年
- 严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病。对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定,并与其他已知病毒进行了比较分析。该病毒基因组全长为29.725kb,含11个可读框(ORFs),由1个稳定区和1个可变区组成,其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶,包括两个ORFs;可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs),分别编码病毒的4个结构蛋白(S,E,M,N蛋白)。此外,可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs)。此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致。通过与已知RNA病毒的序列比对,可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae)。与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示,已在30个核苷酸位置上检出序列差异,总体突变率为0.1％,其中15个变异位点在编码区,可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变)。S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异,而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应.与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化。进化分析表明,SARS病毒可能不是来源于人类,但没有证据证明是人为制造的。为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在,仍需进行更深入的研究。
- 秦鄂德祝庆余于曼范宝昌常国辉司炳银杨保安彭文明姜涛刘伯华邓永强刘洪张雨王翠娥李豫川甘永华李晓萸吕富双谭刚曹务春杨瑞馥汪建李蔚徐祖元李彦吴清发林伟陈维军唐琳邓亚军韩玉军李昌峰雷蒙李国庆
- 关键词：冠状病毒基因组系统发生学
- 甲型H1N1流感重症患者病毒血凝素和神经氨酸酶基因特性分析被引量：2
- 2010年
- 目的通过分析2009-11—02～12—04期间北京市6例甲型H1N1流感重症患者咽拭子中病毒的血凝素、神经氨酸酶基因特性，了解其基因进化特点，以期对下一步甲型H1N1流感的防控和重症的治疗提供理论依据。方法使用实时荧光PCR方法，检测重症患者样本为甲型H1N1流感病毒阳性样本，利用测序引物扩增血凝素、神经氨酸酶基因，测定核苷酸序列，利用生物信息软件拼接序列；分析重要基因位点，对其进行基因进化、耐药性分析。结果6件测定样本血凝素、神经氨酸酶基因与疫苗株A／California／07／2009（H1N1）核苷酸、氨基酸的同源性分别为99．2％及99．5％，有8个血凝素基因的氨基酸发生替换，为65、100、145、185、216、220、338及391位，其中145位位于抗原决定簇A区，220位位于抗原决定簇D区，同时是受体结合位点的后壁；有5个神经氨酸酶基因的氨基酸发生了替换，为59、106、232、248及365位，其中106、232、248位位于酶活性区域；未发生神经氨酸酶基因275位H→Y的替换。结论北京市甲型H1N1流感重症患者病毒血凝素和神经氨酸酶基因与疫苗株A／California／07／2009（H1N1）高度同源，部分血凝素基因、神经氨酸酶基因有氨基酸替换，但其作用不清。所有测定样本未发生对达菲类药物的耐药性突变。
- 石伟先卢桂兰陈维军刘建荣张兰荣邓海君吴伟力李洁王全意黄芳
- 关键词：重症血凝素神经氨酸酶基因特性
