目的:试验主要对红茶菌进行优势菌种的分离鉴定,并根据鉴定结果对其进行发育树分析。方法:将红茶菌原液进行分菌培养,得到的菌种进行纯化。对纯化后的单菌落进行扩大培养,提取DNA。分别采用16S r DNA和ITS进行基因扩增,细菌采用通用引物27F和1492R,真菌采用通用引物ITS1和ITS4进行扩增并对扩增产物进行BLAST分析。在数据库中对比基因相似度并通过Mega6.0分析,构建菌种发育树。结果:经过单菌落纯化,得到单一外表的醋酸菌和酵母菌。通过PCR扩增和凝胶电泳得出醋酸菌1500bp左右,酵母菌500bp左右。通过测序,将测序结果在BLAST中进行比对,将相似性基因通过Mega6.0分析,分别得到菌种发育树。结论:在生物学鉴定和系统发育树分析后,初步确定C1为醋酸杆菌Acetobacter sp.M1T5B1,1406bp。A1为异酒香酵母Brettanomyces anomalus,486bp。