肖天霞
- 作品数:3 被引量:36H指数:2
- 供职机构:浙江大学农业与生物技术学院更多>>
- 发文基金:福建省科技重大专项国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 基于PCR的水稻RGA标记开发和利用
- 过去RGA(Resistant gene analogs,RGA)主要是作为RFLP标记的探针,RFLP标记在检测上比较麻烦,因此现在己用的很少。从基因定位和标记辅助育种的实际需要来看,特异PCR标记具有更大的应用价值。...
- 肖天霞
- 关键词:水稻PCR
- 文献传递
- 基于水稻内含子长度多态性开发禾本科扩增共有序列遗传标记被引量:33
- 2006年
- 通过在多态位点两侧的保守编码序列上设计引物,可以开发出在不同物种间通用的基于PCR的分子标记,称为扩增共有序列遗传标记(ACGM)。【目的】探讨利用已公布的水稻籼、粳两亚种的基因组序列开发禾本科ACGM的可行性。【方法】根据水稻两亚种间的内含子长度多态性,开发了38对ACGM引物。用这些引物对玉米、粟、大麦、小麦、竹子、旱稗草和大米草6个属共12个不同材料进行PCR实验。【结果】几乎所有引物都可在至少1种材料中扩增出特异条带,而1/3以上的引物可以在全部供试材料中获得特异扩增产物。在每一种供试材料中,平均大约有2/3的引物可以成功扩增出目的条带。这些引物在各属内不同种、亚种或品种(系)之间的多态性比例在24.1%~90.3%之间,平均为44.6%。【结论】利用水稻基因组序列信息开发禾本科通用型ACGM是可行的。
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- 关键词:禾本科
- 基于PCR的水稻候选RGA标记检验和评估被引量:3
- 2007年
- 在生物信息学方法开发的基于e-PCR、共显性的402个水稻候选RGA标记的基础上,随机挑选40对引物,分别以水稻品种Nipponbare和93-11的DNA为模板进行PCR扩增验证.得到清晰条带占所用标记总数的87.5%(35个标记),其中31对引物为共显性标记,4对引物为显性标记.用这31对RGA引物在24个水稻品种中进行PCR扩增,结果表明标记具有很好的通用性和特异性.RGA引物平均标记多态性指标(PIC)值为0.46,标记具有较好的多态性.
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- 关键词:水稻PCR