纪晓峰
- 作品数：35 被引量：11H指数：2
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国际科技合作与交流专项项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学轻工技术与工程农业科学理学更多>>
- 一种蛋白互作阻断多肽的辅助筛选方法
- 本发明提供一种蛋白互作阻断多肽的辅助筛选方法，是以中国对虾蛋白PcRab7和白斑综合症病毒囊膜蛋白VP28相互作用阻断多肽为目标的筛选方法。本发明方法是构建中国对虾Rab7蛋白和白斑综合征病毒WSSV囊膜蛋白VP28的复...
- 纪晓峰盛军郑媛郝建华
- 文献传递
- 一种对虾PcRab7蛋白与WSSV囊膜蛋白VP28互作阻断剂多肽
- 本发明提供一种阻断多肽，该多肽能够阻断中国对虾PcRab7蛋白与WSSV囊膜蛋白VP28的相互作用，具有抗WSSV的作用。本发明所提供的阻断多肽，其氨基酸序列为TAPLAITAIIAVFI。本发明所提供的多肽可以阻断Pc...
- 纪晓峰郑媛盛军
- 文献传递
- 一种壳聚糖酶及其突变体在制备壳寡糖中的应用
- 本发明提供一种壳聚糖酶突变体及其在制备壳寡糖中的应用，所提供的突变体相比于出发壳聚糖酶具有更好的温度耐受性和pH值应用范围，从而使提供的壳聚糖酶突变体能应用于实际生产。本发明首先提供一种壳聚糖酶，其氨基酸序列为SEQ I...
- 郑媛盛军纪晓峰
- 文献传递
- 使用简并引物检测海水中细菌过氧化氢酶多样性的方法
- 本发明涉及使用简并引物检测海水中细菌过氧化氢酶多样性的方法，以细菌过氧化氢酶保守区设计四种简并引物的组合，以聚合酶链式反应扩增海水总DNA中的过氧化氢酶基因片段，再以大肠杆菌构建酶基因片段的文库，使用限制性内切酶对文库中...
- 王伟孙谧纪晓峰袁翠
- 文献传递
- 海洋假单胞杆菌HW08基因组文库的构建及序列功能分析
- 2012年
- 通过超声波处理HW08基因组,将获得的1～2 KB DNA片段与pUC18质粒进行连接后转化,构建文库。随机筛选200个克隆进行序列测定,快速分析了海洋假单胞杆菌HW08基因组。结果表明:构建了HW08菌株的基因组部分文库,获得序列173个,包含7个载体序列和7个重叠群,其中最长重叠群为重叠群4,包含3段基因序列,分别为Chemotaxis Protein、Hypotheticalprotein和LacI family transcription regulator。重叠群3为DNA修复蛋白,其最大相似性为83%。166个序列中酶类占绝大部分,同时也包含37个新基因。
- 郝建华刘均忠王芳纪晓峰孙谧
- 关键词：基因组文库
- 黄杆菌YS-80-122碱性金属蛋白酶小分子可逆抑制剂的虚拟筛选方法
- 黄杆菌YS-80-122碱性金属蛋白酶的小分子可逆抑制剂的虚拟筛选方法，属于海洋生物技术领域，包括以下步骤：根据已知来源于黄杆菌YS-80-122碱性金属蛋白酶的结构数据，确定小分子可逆抑制剂的类别；测试所述类别的小分子...
- 纪晓峰郑媛孙谧郝建华盛军
- 文献传递
- 蛋白质-RNA相互作用界面预测与设计
- 2012年
- 蛋白质-RNA之间的相互作用是蛋白质在细胞里面行使功能的重要方式之一.结构生物学家利用实验手段可以得到蛋白质-RNA复合物的三维结构,通过原子水平的晶体结构来解释蛋白质与RNA的识别过程.但实验取得蛋白质-RNA的复合物结构非常困难,耗钱、耗时,同时受限于其相互作用强度.因而利用理论的方法对蛋白质-RNA相互作用界面进行预测与设计在生物医学研究中十分重要.本文主要综述了近期蛋白质-RNA相互作用界面预测与设计方面的进展,包括以下几个方面:(1)蛋白质-RNA分子对接算法以及对接前后存在的构象变化的处理;(2)蛋白质-RNA识别机制的研究;(3)基于蛋白质-RNA相互作用界面的分子设计.蛋白质-RNA分子对接算法逐步完善将有助于我们对大量未知功能的蛋白质与RNA进行功能注释,而基于生物大分子相互作用界面的分子设计将在药物设计领域中有广阔的应用前景.
- 黄阳玉阳秀凤李昊田纪晓峰程洪礼赵蕴杰郭大川李林刘士勇
- 关键词：分子对接
- 一种壳聚糖酶突变体
- 本发明提供了一种壳聚糖酶EAG1突变体，其氨基酸序列为SEQ ID NO:1。本发明的该突变体与壳聚糖酶EAG1相比，具有更优良的热稳定性与更高的催化效率，对壳聚糖具有快速分解能力。通过对含有突变体基因的酵母工程菌的高效...
- 盛军沙珍霞郑媛纪晓峰王致鹏
- 文献传递
- 4-甲酰苯基硼酸对蛋白酶MP的抑制作用及其抑制机制的分子动力学模拟被引量：2
- 2018年
- 蛋白酶MP(marine protease)是海洋细菌来源的新型碱性金属蛋白酶,在工业中具有良好的应用前景。本文采用酶动力学方法研究4-甲酰苯基硼酸(4-FPBA)对MP的抑制作用,并结合分子模拟的方法,通过水溶液环境下分子力学-玻尔兹曼泊松表面积(MM-PBSA)和量子力学/分子力学混合方法(QM/MM)对其抑制机制进行了研究。结果表明,4-FPBA对蛋白酶MP的抑制过程属可逆的竞争型抑制,抑制常数Ki为0.57 mmol/L。在4-FPBA与蛋白酶MP的结合过程中,范德瓦尔斯相互作用对于其结合发挥了重要作用。明确了Arg59、Leu151、His190和His196的4个残基为蛋白酶MP中与4-FPBA结合的关键残基。该研究结果将为今后进行蛋白酶MP可逆抑制剂的筛选与设计提供理论基础,以提高其液态稳定性,从而拓宽蛋白酶MP在液体洗涤剂中的高效应用。
- 纪晓峰郑媛王致鹏盛军王海英
- 关键词：蛋白酶
- 锌金属蛋白酶家族的结构与催化机理被引量：6
- 2013年
- 锌金属蛋白酶是一类分布广泛,种类繁多的水解酶家族,是近年来人们研究的热点.一般来说,HEXXH保守序列一直都作为锌金属蛋白酶家族分类的依据.除此之外,不同种类的酶还有一些其它的序列特征.谷氨酸锌蛋白(gluzincin)在锌离子配体处共有2组保守区域;甲硫氨酸锌蛋白(metzincin)则拥有1个延长的保守序列HEBXHXBGBXH,里面包含了第3个His配体.大量的金属蛋白酶晶体结构被解析出来,从中可以发现该类酶的活性中心都包含有1个锌离子.锌金属蛋白酶的催化机理通常认为是锌离子与1个水分子结合活化而成.但是,最近的发现证实了并不是所有的锌金属蛋白酶催化都需要水分子参与活化.在本文中,综述了这些已发表的锌金属蛋白酶家族的分类、结构特征、底物特异性识别和催化机理.
- 郑媛盛军纪晓峰郑兰红孙谧
