车燕飞
- 作品数：7 被引量：17H指数：3
- 供职机构：重庆师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金重庆市科技攻关计划美国国立卫生研究院基金更多>>
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- 葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析被引量：5
- 2014年
- 过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录组unigene序列信息,设计特异性引物并首次通过PCR技术克隆了葱蝇过氧化氢酶基因全长cDNA,命名为DaCAT,其全长为2 073bp,开放阅读框1 518bp,编码505个氨基酸,推测其相对分子质量为5.68×104,等电点为7.72.该研究对其进行了生物信息学分析并建立了系统发育树,分析表明该基因编码的氨基酸序列具有2个保守结构域及多个酶活性位点,与其他物种CAT具有较高的同源性,其中和拟果蝇Drosophila simulans亲缘关系最近,相似率为89.3%,采用SWISS-MODEL对其进行了蛋白质同源建模及3D结构预测分析,为进一步研究DaCAT基因在葱蝇滞育期间的代谢表达、酶活力测定以及具体功能奠定了基础.
- 胡甘雨司风玲车燕飞张玉娟陈斌
- 关键词：葱蝇过氧化氢酶克隆生物信息学分析
- 二次内共生质体蛋白质转运
- 2013年
- 目前有关质体蛋白质转运的认识主要集中在具有典型叶绿体结构的生物中,在具有二次内共生质体的低等的单细胞真核生物中尚缺乏认识。二次内共生质体具有特殊的质体结构,其质体蛋白质转运系统也相对复杂。本文将对二次内共生质体蛋白质转运系统的研究进行概述。
- 石云英车燕飞张玉娟
- 关键词：叶绿体转运肽信号肽内共生
- 葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析
- 过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录...
- 胡甘雨司风玲车燕飞陈斌
- 关键词：葱蝇过氧化氢酶基因克隆生物信息
- 文献传递
- 中华按蚊CYP6P5基因的生物信息学鉴定及特征分析被引量：6
- 2014年
- 目的鉴定中华按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征，为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据。方法以催命按蚊基因CYP6P5为询问基因，基于中华按蚊转录组测序数据，采用双向Blast方法搜寻中华按蚊CYP6P5cDNA序列。利用生物信息学相关软件对该基因编码蛋白序列的一级结构、疏水区、跨膜区、结构域、3D结构等进行预测分析，并采用最大似然法（maximumlikelihood，ML）建立代表性蚊种的系统发育关系。结果搜索获得1条中华按蚊CYP6P5全长cDNA序列。该cDNA序列具备P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列，命名为CYP6P5（GenBank登录号：KF358704）。该cDNA全长为1583bp，开放阅读框为1527bp，编码508个氨基酸，推测其相对分子质量为58．32×10-3，等电点为7．17。分析表明该基因编码的蛋白序列第5～21位氨基酸是疏水区，第5～22位氨基酸是跨膜区，第36～505位氨基酸是P450保守结构域，并具有多个酶活性位点。系统发育关系和相似性分析表明，中华按蚊CYP6P5与催命按蚊CYP6P5和冈比亚按蚊CYP6P5亲缘关系最近，形成一个单系，相似率分别为89．4％和89．0％。结论为进一步研究中华按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子机制奠定了基础。
- 车燕飞张玉娟唐尧洪瑞陈斌
- 关键词：细胞色素P450中华按蚊生物信息学分析
- 中华按蚊CYP6Y亚家族基因的鉴定和生物信息学分析被引量：8
- 2014年
- 【目的】鉴定中华按蚊Anopheles sinensis CYP6Y亚家族基因,分析它们的结构和特征,推测其可能的功能。【方法】以冈比亚按蚊An.gambiae CYP6Y1作为询问序列,通过双向Blast方法检索中华按蚊转录组中CYP6Y亚家族基因,并通过生物信息学方法分析基因结构、特征及可能的功能。【结果】从中华按蚊转录组测序数据中鉴定出2条CYP6Y亚家族基因,分别命名为AsCYP6Y1(GenBank登录号:KF709397)和AsCYP6Y2(GenBank登录号:KF709398)。序列分析显示,AsCYP6Y1和AsCYP6Y2全长分别为1 713 bp和1 815 bp,分别编码502和526个氨基酸。基因结构分析显示,该亚家族基因仅含有1个相位1型内含子并与其他P450基因形成保守的共线性分布。蛋白结构分析显示,这2个基因编码的蛋白含P450特有的5个特征序列和6个底物结合位点,且均不存在信号肽,其亚细胞定位为细胞质。3D结构分析显示,AsCYP6Y1有18条α螺旋和13股反向平行的β折叠,AsCYP6Y2有19条α螺旋和11股反向平行的β折叠。通过同样的方法,在达林按蚊An.darlingi中也鉴定出2个CYP6Y亚家族基因。系统进化分析显示,AsCYP6Y1和AsCYP6Y2分别与其他3种按蚊的CYP6Y1和CYP6Y2聚成一支,Bootstrap值均大于90%。替换率分析显示,中华按蚊AsCYP6Y1和AsCYP6Y2与其他3种按蚊同源基因的Ka/Ks均小于1。相对进化速率分析显示,中华按蚊CYP6Y和CYP6M亚家族的相对进化速率均显著快于CYP6P亚家族,而CYP6Y和CYP6M亚家族之间没有显著差异。【结论】在中华按蚊和达林按蚊中存在2个CYP6Y亚家族基因,之前在冈比亚按蚊和不吉按蚊An.funestus中也发现2个CYP6Y亚家族基因,表明CYP6Y亚家族基因可能在按蚊属广泛存在,且可能为按蚊属昆虫所特有。
- 唐尧乔梁张玉娟车燕飞洪瑞陈斌
- 关键词：中华按蚊基因序列生物信息学分析基因结构
- 中华按蚊(Anopheles sinensis)P450超家族基因的鉴定和分析
- 细胞色素P450（Cytochrome P450，简称P450）是昆虫体内广泛存在的一类解毒酶。细胞色素P450超家族是最古老和最庞大的超基因家族之一，在生命过程中，它对内源物质的代谢与转化，外源化合物的活化与降解等进行...
- 车燕飞
- 关键词：中华按蚊细胞色素P450
- 中华按蚊CYP6Y亚家族的生物信息学分析
- 疟疾是一种高致死率的传染性疾病。在我国疟疾的传播媒介主要是中华按蚊(Anopheles sinensis),P450是一种血红素结合蛋白，广泛分布于生物体中,并参与重要的生理活动，在昆虫中P450能参与蜕皮激素和保幼激素...
- 唐尧车燕飞陈斌
- 关键词：疟疾中华按蚊生物信息疾病防治
- 文献传递
