赵爽
- 作品数：10 被引量：81H指数：7
- 供职机构：暨南大学生命科学技术学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 中国近海鯻科鱼类系统发育初探被引量：7
- 2010年
- 分析了中国鯻科鱼类4属6种17尾鱼的线粒体16S rRNA基因3′端部分序列特征。结果表明,在鯻科鱼类507 bp的碱基序列中有变异位点57个,简约信息位点55个,A+T含量(50.3%)高于G+C含量(49.8%),转换/颠换比为2.7。在邻接树和最大似然树上,鯻科鱼类聚类为2个分支,其中鯻属细鳞鯻独立为一支,其余属种组成另一分支,不支持Vari(1978)关于鯻科15个属中匀鯻属为最早分化类群的结论;鯻属的细鳞鯻和鯻鱼并未聚类在一起,表明二者亲缘关系较远,或为不同属,与Lee等报道相一致。由于鯻科鱼类属种较多,本文所分析的样品有限,且鯻科系统分类长期存在争议,因而需要采用多个线粒体和核基因联合分析更多属种,才能确定可否另立新属,并进一步明确鯻科鱼类的系统发育关系。
- 周佳怡章群唐优良余帆洋赵爽
- 关键词：线粒体16SRRNA系统发育
- 中国近海5个黑鲷地理群体的遗传变异被引量：16
- 2010年
- 为有效保护和利用黑鲷(Acanthopagrus schlegeli)资源,本研究测定了中国近海5个群体(北方海域的营口与崂山群体,南方海域的闽清、大亚湾、东兴群体)各10尾黑鲷线粒体控制区5′端722bp序列以分析其遗传多样性和遗传结构。结果发现42个单倍型,56个多态位点;群体单倍型多样性为0.978～1.000,群体核苷酸多样性为0.0067～0.0116。中性检测和核苷酸不对称分布分析表明,中国近海黑鲷在晚更新世(165～41kaBP)曾经历过种群的快速扩张。北方群体与南方群体之间的Fst值为0.1145(P=0.00),表明存在中等程度的分化,建议将中国近海黑鲷作为两个管理单位。
- 赵爽章群乐小亮彭博许忠能韦桂峰李贵生
- 关键词：线粒体控制区群体遗传结构
- 基于线粒体细胞色素b基因全序列的海南长臀鮠南渡江种群遗传变异分析被引量：9
- 2010年
- 测定了海南南渡江15尾海南长臀鮠（Cranoglanis bouderius multiradiatus）的cytb基因全序列1138bp，发现3个可变位点和1个简约信息位点，共检测到4种单倍型。海南长臀鮠Cytb基因具有典型的起始密码子（ATG）和不完全终止密码子（T＊＊），共编码379个氨基酸，密码子第三位点G的含量仅2.9%，而C和A的含量分别为39.1%和38.5%，在第二位点上T的使用频繁高达41.3%，表明cytb基因在密码子碱基的使用具有偏倚性。海南长臀鮠基于Kimura-2-parameter模型的单倍型间遗传距离为0.0009~0.0017，在NJ系统树中没有明显的谱系结构，单倍型多样性（0.600）和核苷酸多样性（0.0006）都较低，表明海南长臀鮠遗传多样性非常贫乏，应及时采取有效措施保护海南南渡江种群。
- 乐小亮赵爽刘海林章群
- 关键词：细胞色素B
- 基于线粒体控制区全序列的长江中下游鳊的遗传多样性研究被引量：8
- 2010年
- 测定了湖南岳阳、江西都昌、上海崇明3个群体42尾鳊线粒体控制区全序列940bp,发现26个变异位点和15个简约信息位点,共检出28个单倍型。转换/颠换比为45.8。在邻接树上,来自不同地点的鳊混杂分布于各分支,没有出现明显的谱系结构和地理聚群。3个群体间的遗传距离为0.004～0.005,Fst值为0～0.05,表明3个群体间没有显著遗传分化,隶属同一种群。岳阳、都昌和崇明群体的核苷酸多样性分别为0.00501、0.00414、0.00409,单倍型多样性分别为1.00000、0.93407、0.97802,其中岳阳群体的核苷酸多态性与单倍型多样性在3个群体中最丰富,建议优先保护。
- 杨凡彭博赵爽章群
- 关键词：线粒体控制区
- 中国近海小黄鱼遗传变异的细胞色素b序列分析被引量：7
- 2010年
- 分析了中国近海丹东、营口、舟山、温州和福州32尾小黄鱼线粒体Cytb基因的862bp序列,共检测到31个变异位点,13个简约信息位点,26个单倍型;单倍型多样性为0.984±0.013,核苷酸多样性为0.00395。高单倍型多样性和低核苷酸多样性,Tajima’s中性检验为负值且显著,核苷酸不配对分析呈单峰曲线,在简约性网络图中单倍型呈星状分布,表明小黄鱼经历过种群扩张,扩张年代约为0.14MY前。群体间较低的Fst值和较高的Nm值,在NJ系统树和简约性网络图中不同地理来源的单倍型交错分布,分子方差分析都表明群体间未出现明显的遗传分化,与传统的地理群体划分并不一致。推测小黄鱼产浮性卵、生活史中出现大规模的洄游以及扩张后的群体尚未在迁移与漂变间达到平衡可能是未检测到显著地理和谱系结构的主要原因。
- 彭博章群赵爽乐小亮
- 关键词：小黄鱼细胞色素B
- 中国近海真鲷遗传变异的线粒体控制区序列分析被引量：13
- 2010年
- 测定了辽宁东港、广东大亚湾和广西东兴3个海域各15尾真鲷的线粒体控制区5′端660bp的核苷酸序列,发现91个可变位点,64个简约信息位点。在45尾样品中共检测到43个单倍型,3个群体的平均单倍型多样性和核苷酸多样性分别为(0.99～1)和(0.02522～0.02579),表现出较高的单倍型多样性和核苷酸多样性。在真鲷个体NJ树上出现3个谱系,各谱系中不同地理来源的个体比例相当,不呈现明显的地理聚群,推测各谱系大约形成于晚更新世的末期。Tajima’sD呈负值但不显著(P>0.08),表明真鲷历史上没有发生快速扩张,种群大小稳定。群体间遗传分化指数Fst都为负值(-0.0001～-0.0188)但不显著(P>0.1);AMOVA分析显示遗传变异主要集中在群体内的个体间(100.49%),而群体间的遗传变异很小(-0.49%);表明我国近海真鲷群体有可能是同一种群。
- 乐小亮章群赵爽范凤娟
- 关键词：真鲷线粒体控制区
- 福建东张水库陆封型香鱼的遗传变异被引量：3
- 2009年
- 测定了福建东张水库18尾陆封型香鱼的ND4-tRNASer基因533 bp序列,发现2个可变位点和2个简约信息位点,共检测到4种单倍型。基于Kimura 2-parameter模型的遗传距离在0.001 9～0.003 9之间,在NJ系统树上无明显谱系结构;单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.627和0.001 37,平均核苷酸差异数为0.732,远低于两侧洄游型日本香鱼指名亚种(Hd为0.793,Pi为0.002 94),与被列为IUCN濒危物种名录的日本琉球香鱼亚种(Hd=0.519,Pi=0.001 11)相当。东张水库香鱼遗传多样性如此贫乏到底是历史原因还是近期陆封的结果,仍需进一步研究。目前亟待采取有效措施保护东张水库陆封香鱼。
- 鲁延付乐小亮赵爽陈泉梅章群
- 关键词：香鱼
- 一种高效快速的鱼类标本基因组DNA提取方法被引量：17
- 2010年
- 以95%酒精保存的黄鳝(M onopterus albus)和斑鳢(Channa maculates)标本为材料,采用先沉降DNA再去除杂质的方法从鱼类标本中提取基因组DNA。基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度法检测以及PCR扩增结果显示,本方法提取的鱼类基因组DNA的电泳主带清晰明亮;A260/A280值在1.7830-2.0144之间;PCR扩增产物条带清晰明亮,且单一整齐没有拖带,表明本方法可从酒精保存的鱼类标本中提取比较纯净的DNA,能够满足一般分子生物学试验需要。与传统苯酚/氯仿法相比,本方法操作简单快速,避免了苯酚等物质对后续实验的影响,可作为一种常规动物组织DNA提取方法。
- 乐小亮章群赵爽范凤娟
- 关键词：鱼类动物组织基因组DNA提取
- 珠江水系特有卷口鱼遗传变异的线粒体Cytb基因序列分析被引量：6
- 2010年
- 测定了广西合山、柳州、桂平和广东郁南等4个地理群体43尾卷口鱼线粒体Cytb基因1041bp,结果检测到8个单倍型,7个多态位点。4个地理群体的单倍型多样性为0.248～0.700,核苷酸多样性为0.00022～0.00070,表明所分析的卷口鱼群体单倍型多样性和核苷酸多样性低。在分子系统树上,不同地理来源的卷口鱼混杂分布在一起,没有形成明显的谱系结构和地理聚群;4个群体两两间的Fst值为-0.028～0.116,但均不显著(P>0.08);AMOVA分析表明1.70%(P=0.21)的分子差异来自群体间,而98.3%的分子差异位于群体内部;表明4个地理群体间没有显著遗传分化。单倍型网络图呈星状结构,中性检测Tajima’sD和Fu’sFS均为显著负值,核苷酸不对称分布分析呈单峰模式,表明珠江卷口鱼可能曾经历过种群的快速扩张,推测在晚更新世(1.5～3.9万年前)出现种群扩张。
- 范凤娟章群赵爽李名立周佳怡余帆洋唐优良
- 关键词：细胞色素B基因珠江水系
- 华南3个赤眼鳟群体Cytb基因的遗传变异被引量：3
- 2009年
- 测定了珠江和韩江3个群体21尾赤眼鳟线粒体细胞色素b基因1 029 bp序列片段,发现11个单倍型,14个变异位点。韩江群体单倍型多样度h(0.464)和核苷酸多样度π(0.000 97)较低,珠江水系左江和郁江群体较高(h=0.929-1,π=0.023 6-0.036 9)。在邻接树上不同地理来源的个体混杂,没有明显的谱系结构和地理聚群。Fst值和AMOVA分析亦显示珠江与韩江群体之间没有显著遗传分化。单倍型网络图呈星状结构,中性检测Tajima’s D和Fu’s Fs均为显著负值,核苷酸不对称分布分析呈单峰模式,说明华南赤眼鳟群体可能在晚更新世(164-66KaBP)曾经历过种群的快速扩张。
- 赵爽乐小亮章群
- 关键词：细胞色素B基因
