从CIMMYT引进了60份已鉴定耐渍性的玉米自交系,并在温室重新进行了耐渍性鉴定,从中选择了10份耐渍性较弱、8份耐渍性较强的玉米自交系,分别组成不耐渍池和耐渍池。1叶1心期,对18份材料进行2 d的淹水处理,分别取各材料的根系,用于RNA提取。提取的RNA,18S r RNA、28S r RNA条带清晰,且浓度都在270 ng/μg以上。耐渍池、不耐渍池的RNA,分别进行了等量混合,用于RNA-seq分析。根据RNA-seq结果,选择了4个表达差异的基因,分析了这它们在2个耐渍、2个不耐渍自交系中的表达情况,并与RNA-seq结果进行了比较分析。结果发现,这4个基因在耐渍池、不耐渍池中的表达,与4个自交系中的表达趋势一致,说明本研究中的转录组质量较好。
