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马宏辉
作品数:
1
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供职机构:
扬州大学信息工程学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
自动化与计算机技术
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合作作者
王诗佳
扬州大学信息工程学院
张晓斌
扬州大学信息工程学院
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扬州大学信息工程学院
孙磊
扬州大学信息工程学院
胡学龙
扬州大学信息工程学院
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王诗佳
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马宏辉
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2016
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基于Linux的长非编码RNA信息系统
2016年
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)已成为生物信息学研究领域的热点,涉及lncRNA基因注释、结构预测、功能和机制等研究方向。研究也产生了大量分布零散的lncRNA信息(包括lncRNA知识、研究方法和数据库等),而现有的lncRNA信息平台功能单一,缺乏对信息资源的整合。针对这一问题,文章建立基于Linux的lncRNA信息系统。该系统主要由数据库模块、网页服务模块和软件工具模块等3部分构成。基于此架构,系统通过由lncRNA知识、GBrowse浏览器、分析和计算、工具信息和数据库信息等页面向网络用户提供信息服务。测试结果表明,系统能够提供lncRNA知识的展示、数据可视化、预测和转录分析、常用的工具和数据库信息等服务。该系统能有效整合lncRNA研究相关的多源信息,进而提高lncRNA研究的效率。
孙磊
马宏辉
王诗佳
张晓斌
李云
胡学龙
关键词:
信息系统
数据库
数据可视化
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