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沈明辉

作品数：1 被引量：3H指数：1
供职机构：兰州大学第二医院更多>>
发文基金：甘肃省卫生行业科研计划项目博士科研启动基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇荧光
  • 1篇荧光染料
  • 1篇熔解曲线
  • 1篇基因
  • 1篇基因分
  • 1篇基因分型
  • 1篇基因分型技术
  • 1篇分型技术
  • 1篇高分辨率熔解...
  • 1篇SNP

机构

  • 1篇兰州大学第二...

作者

  • 1篇尤崇革
  • 1篇郜莉娜
  • 1篇马克君
  • 1篇王倩
  • 1篇闫雯
  • 1篇沈明辉

传媒

  • 1篇中华检验医学...

年份

  • 1篇2017
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
荧光染料 SYTO13用于高分辨熔解曲线技术 SNP 基因分型的评价被引量：3
2017年
目的：评价荧光染料SYTO13在高分辨熔解曲线技术（ HRM）检测单核苷酸多态性（ SNP）位点的基因分型能力和临床适用性。方法实验性能验证。选择经测序确认rs3125734 C＞T （Ⅰ类SNP ）、rs255758 A＞C（Ⅱ类SNP）和rs688C＞T三个位点基因型的样本36例，以商业化HRM染料LCGreen Plus为对照，进行SYTO13对Ⅰ类和Ⅱ类SNP以及rs688C＞T位点的长片段扩增（107 bp）与短片段扩增（52 bp）基因分型能力的评价。基因分型能力以野生型与纯合突变型的Tm差值ΔTm表示，独立样本t检验比较野生型和纯合突变型的Tm均值，两种染料之间检测能力的比较分析采用配对t检验。临床适用性以随机选取已测序分型的35例样本进行批量均相检测来评价。结果SYTO13能够清楚直观地对Ⅰ类和Ⅱ类SNP进行基因分型（ΔTmclas Ⅰ＝0．36±0．05，tclas Ⅰ＝14．827， Pclas Ⅰ＝0．000；ΔTmclas Ⅱ＝0．42±0．110，tclas Ⅱ＝9．539，Pclas Ⅱ＝0．000）。均相检测时SYTO13对Ⅰ类SNP的基因分型直观性更好（ΔTmSYTO13＝0．39±0．027），而对短片段扩增产物基因分型效果不佳。临床适用性评价结果显示SYTO13对长片段扩增的Ⅰ类和Ⅱ类SNP除个别离群样本外均能准确基因分型，离群样本经复查后也能准确分型。结论 SYTO13可作为HRM染料准确地对长片段扩增的Ⅰ类和Ⅱ类SNP位点进行基因分型，适合于临床常规应用。（中华检验医学杂志，2017，40：88－94）
王倩闫雯沈明辉马克君郜莉娜尤崇革
关键词：基因分型技术荧光染料高分辨率熔解曲线
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