叶远浓
- 作品数：7 被引量：2H指数：1
- 供职机构：贵州医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金贵州省中药现代化科技产业研究开发专项项目贵州省科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术文化科学更多>>
- 利用基因组挖掘技术分析短短芽孢杆菌菌株GZDF3全基因组几丁质酶基因家族被引量：1
- 2016年
- 本研究目的是利用全基因组挖掘技术分析短短芽胞杆菌GZDF3菌株中的几丁质酶基因家族。首先利用Bio Edit软件本地搜索短短芽孢杆菌GZDF3全基因组数据库中几丁质酶基因家族,然后采用在线分析及相应软件分析预测几丁质酶基因氨基酸组成、理化性质、信号肽、疏水性、二级结构等,并构建系统发育树。结果显示,短短芽孢杆菌GZDF3全基因组中预测共存在6个几丁质酶基因,编码6种不同结构类型的几丁质酶。6种几丁质酶均属于糖苷键水解酶第18家族。其中2种几丁质酶N端有信号肽序列和信号肽酶切位点;有2种几丁质酶为碱性蛋白,4种为酸性蛋白,6种均为亲水性蛋白。本研究揭示了短短芽孢杆菌菌株GZDF3基因组中有结构多样的几丁质酶,分析结果将为后续的基因克隆及功能研究提供参考。
- 刘红美李玉权陶小买赵建丽周静张婷婷叶远浓
- 关键词：几丁质酶生物信息学系统发育树
- 能量耗竭诱导红细胞锚蛋白外翻触发巨噬细胞对红细胞的黏附
- 2019年
- 该研究的目的是探讨能量耗竭能否诱使红细胞锚蛋白外翻,且巨噬细胞能否黏附锚蛋白外翻的红细胞。在能量耗竭孵育后,该研究分别检测了红细胞锚蛋白外翻水平、胞内ATP浓度、胞内钙离子水平、胞内蛋白激酶C的激活和巨噬细胞对红细胞的黏附数。结果表明,红细胞经能量耗竭孵育后,胞内ATP水平孵育2 h后显著减少,6 h后ATP基本被耗尽;能量耗竭和胞外钙离子的共同孵育,促使红细胞胞内蛋白激酶C的激活以及红细胞锚蛋白外翻;锚蛋白外翻的红细胞能够被巨噬细胞黏附,且整合素αvβ3明显抑制了巨噬细胞对红细胞的黏附。结果分析表明,能量耗竭和胞外钙离子的共同孵育促使红细胞锚蛋白的外翻,这可能是在能量耗竭情况下红细胞被巨噬细胞清除的一个潜在机制,从而为研究能量代谢异常红细胞的清除提供潜在的分子基理。
- 王玉林隆耀航叶远浓周厚明陈晋黄江涛唐福州
- 关键词：红细胞程序性死亡
- 一种优化外源基因在大肠杆菌中翻译速度的算法
- 本发明公开了一种优化外源基因在大肠杆菌中翻译速度的算法，包括如下步骤：首先，对于SD序列类似结构使基因翻译短暂停顿的效应，将成对的氨基酸的所有密码子组合情况都与大肠杆菌SD序列进行序列比对，使用大肠杆菌SD类似结构效应重...
- 叶远浓张晓娅黄梦雅曾柱
- 文献传递
- DBEncRNA:细菌必需非编码RNA数据库
- 2022年
- 细菌非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是近年来在细菌基因组内新发现的一类基因表达调控因子,与必需基因概念类似,有一部分ncRNA是生物体生存所必不可少的,称之为“必需非编码RNA”。因此,细菌的必需ncRNA可以作为药物开发的潜在靶标,以降低致病菌的耐药性。同时,必需ncRNA也成为最小基因组研究的重要对象之一。目前已经通过湿实验系统地确定了10余种细菌的必需ncRNA,然而还没有一个专门的必需ncRNA数据库,导致对必需ncRNA的研究远远跟不上科学研究和药物设计的需要。因此,该研究构建了一个专门的细菌必需ncRNA数据库DBEncRNA,以帮助研究人员开发高效的必需ncRNA计算机识别方法,用于进一步研究抗菌药物靶标发现和最小基因组。DBEncRNA数据库可以通过http://yeyn.group:86/免费访问使用。
- 叶远浓叶远浓曾柱
- 关键词：数据库致病菌
- 一种优化外源基因在大肠杆菌中翻译速度的方法
- 本发明公开了一种优化外源基因在大肠杆菌中翻译速度的方法，包括如下步骤：首先，对于SD序列类似结构使基因翻译短暂停顿的效应，将成对的氨基酸的所有密码子组合情况都与大肠杆菌SD序列进行序列比对，使用大肠杆菌SD类似结构效应重...
- 叶远浓张晓娅黄梦雅曾柱
- 文献传递
- 一种基于基因序列的智能抗菌药靶基因筛选方法
- 本发明涉及致病菌药物筛选技术领域，具体涉及一种基于基因序列的智能抗菌药靶基因筛选方法。提取目标致病菌的待测基因；计算每个待测基因的蛋白适应性指数作为对应待测基因的必需性；对每个待测基因利用BAST方法进行比对，根据比对结...
- 张晓娅叶远浓
