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张增辉

作品数:52 被引量:5H指数:1
供职机构:华东师范大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金上海市浦江人才计划项目上海市青年科技启明星计划更多>>
相关领域:理学自动化与计算机技术医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 31篇专利
  • 11篇会议论文
  • 9篇期刊文章
  • 1篇科技成果

领域

  • 17篇理学
  • 7篇自动化与计算...
  • 5篇医药卫生
  • 2篇生物学
  • 2篇轻工技术与工...
  • 2篇农业科学
  • 1篇天文地球
  • 1篇建筑科学
  • 1篇交通运输工程

主题

  • 20篇分子
  • 18篇蛋白
  • 9篇小分子
  • 7篇药物
  • 7篇配体
  • 7篇相互作用
  • 6篇抑制剂
  • 6篇指纹
  • 6篇制剂
  • 6篇片段
  • 5篇药物分子
  • 5篇残基
  • 4篇蛋白A
  • 4篇亚基
  • 4篇药物分子设计
  • 4篇原子
  • 4篇微管
  • 4篇杆菌
  • 4篇肠杆菌
  • 4篇大肠杆菌表达

机构

  • 50篇华东师范大学
  • 11篇纽约大学
  • 2篇南洋理工大学
  • 2篇中国科学院
  • 1篇大连理工大学
  • 1篇华东理工大学
  • 1篇厦门大学
  • 1篇浙江工业大学
  • 1篇山东师范大学
  • 1篇美国纽约大学

作者

  • 52篇张增辉
  • 12篇何晓
  • 4篇董素珍
  • 3篇梅晔
  • 3篇郑磊
  • 3篇刘金峰
  • 2篇韩克利
  • 2篇张大为
  • 2篇李晓琳
  • 2篇宋佳宁
  • 1篇姚丽
  • 1篇段莉莉
  • 1篇林世鹰
  • 1篇夏威
  • 1篇宋鹤山
  • 1篇王昊
  • 1篇高蓓
  • 1篇张庆刚
  • 1篇朱通
  • 1篇王雅倩

传媒

  • 2篇Chines...
  • 2篇中国科学:化...
  • 1篇高等学校化学...
  • 1篇北京大学学报...
  • 1篇化学进展
  • 1篇生物加工过程
  • 1篇中国科技论文
  • 1篇第十一届全国...
  • 1篇中国化学会第...
  • 1篇中国化学会第...
  • 1篇第十三届全国...

年份

  • 2篇2024
  • 5篇2023
  • 6篇2022
  • 4篇2021
  • 10篇2020
  • 2篇2019
  • 3篇2018
  • 4篇2017
  • 4篇2016
  • 1篇2015
  • 3篇2014
  • 1篇2013
  • 2篇2012
  • 1篇2011
  • 2篇2010
  • 1篇2004
  • 1篇2001
52 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
O(~1D)+HCl反应的精确含时量子波包计算
2001年
利用BLRS势能面 (SchinkeR .JChemPhys ,1984 ,80 :5510~ 5517)首次对O(1D) +HCl反应进行了精确的三维含时量子波包计算。反应截面的计算结果与经典轨线结果符合得很好 。
林世鹰韩克利张增辉
关键词:势能面反应截面反应速率量子力学计算
Free energy analysis in protein-substrate binding
<正>Accurate calculation of protein-substrate binding free energies is a grand challenge. Prediction of critica...
张增辉
文献传递
膜蛋白的微观转运机理的计算模拟研究(英文)
Multidrug transporters(MDR),which mediate export of a broad range of chemically unrelated substrates across th...
宋佳宁季长鸽张增辉
文献传递
一种基于图卷积神经网络预测小分子化合物解离常数的方法
本发明涉及一种基于图卷积神经网络预测小分子化合物解离常数的方法,该方法不同于传统的基于分子指纹的预测方法,通过图卷积神经网络自动学习与解离常数有关的化学模式构建预测模型。ChEMBL数据库中160万种化合物的解离常数用于...
潘肖林王昊张增辉季长鸽
一种基于酵母二肽基肽酶Ⅲ的抗体模拟物及其应用
本发明提供了一种基于酵母二肽基肽酶Ⅲ的抗体模拟物及其应用,通过理性设计改造获得DPPⅢ突变菌株,获得AFB1抗体模拟物,使其与黄曲霉毒素高效亲和,解决了抗体生产加工过程中的稳定性问题,并实现抗体模拟物对小分子的富集作用和...
潘月张鲁嘉张增辉何晓张传玺方波欢
文献传递
一种基于蛋白环境描述小分子片段属性的指纹设计方法
本发明公开了一种基于蛋白环境描述小分子片段属性的指纹设计方法,其特点是该方法通过识别蛋白的口袋表层氨基酸原子,计算蛋白口袋原子和对接后的小分子的相互作用关系,及其对应的蛋白原子和小分子原子,设计两种不同描述小分子片段属性...
季长鸽单金文张增辉
基于丙氨酸扫描与相互作用熵方法的PARP1与配体的结合自由能计算
2018年
PARP1蛋白是真核细胞DNA损伤修复的关键因子,也是近年来肿瘤治疗的新热靶标之一.本文运用本课题组发展的基于相互作用熵方法并结合MM/GBSA方法对蛋白-配体进行丙氨酸扫描,计算了10个抑制剂小分子与PARP1蛋白及与PARP1蛋白各残基间的相互作用结合自由能并由此获得总的结合自由能.计算结果表明,相比传统MM/GBSA方法,新的计算方法可以显著提高蛋白-配体结合自由能计算的精度,缩小与实验值的误差.
张右梓刘笑周一凡张增辉
关键词:PARP1抑制剂分子动力学
基于图卷积神经网络预测小分子化合物溶剂化能的方法
本发明公开了一种基于图卷积神经网络预测小分子化合物溶剂化能的方法,该方法引入含有三维结构信息和二维拓扑信息的原子特征描述符,基于图卷积神经网络自动提取化合物中与溶剂化能相关的化学模式构建预测模型。此外,为了提高预测模型的...
潘肖林张跃庆张增辉季长鸽
基于相互作用能项和机器学习的蛋白-配体亲和力预测方法
本发明涉及一种基于相互作用能项和机器学习的蛋白‑配体亲和力预测方法,该方法通过分散配体与蛋白口袋的各种相互作用能项到20种氨基酸残基的主侧链上,并用机器学习的方法对PDB库中已知活性的蛋白‑配体相互作用能信息进行训练得到...
季长鸽王卫军张增辉闫玉娜段观福单金文
文献传递
基于相互作用指纹和机器学习的药物靶标的虚拟筛选方法
本发明涉及一种基于相互作用指纹和机器学习的药物靶标的虚拟筛选方法,该方法在传统的分子对接的基础上,通过机器学习对已知活性及非活性小分子与靶标蛋白的相互作用指纹进行训练得出靶标的筛选模型,利用所得模型进行虚拟筛选。本发明针...
季长鸽闫玉娜张增辉
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