陈永玲
- 作品数:3 被引量:3H指数:1
- 供职机构:南昌大学生命科学与食品工程学院更多>>
- 发文基金:江西省科技支撑计划项目江西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 池蝶蚌铁蛋白ferritin-1基因表达分析
- 铁蛋白(ferritin)是一种含铁的复合蛋白质,参与机体的抗氧化和免疫反应。铁蛋白通过储存和释放铁离子,维持了细胞内铁离子的代谢平衡。有研究表明氧气胁迫、炎症因子、病原微生物感染等胁迫效应可以显著上调铁蛋白基因的表达。...
- 陈永玲何书豪盛军庆彭扣王军花洪一江
- 关键词:池蝶蚌
- 文献传递
- 池蝶蚌HsCTL的分子特征及表达分析被引量:2
- 2018年
- C-型凝集素(C-type lectin,CTL)是存在动、植物及微生物中一类Ca2+依赖性的糖蛋白,能够识别和结合病原微生物表面的多糖物质,在机体免疫防御中起重要作用。为了解淡水育珠贝池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii) CTL的分子特征及潜在作用,结合转录组高通量测序和末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)从池蝶蚌中鉴定了一条与其他物种CTL同源的c DNA序列,命名为HsCTL。该序列全长为1716 bp,包括5'端非编码区92 bp,3'端非编码区898 bp,开放阅读框长726 bp,编码241个氨基酸,预测蛋白质相对分子量为28 ku。其氨基酸序列存在一个由23个氨基酸残基组成的信号肽和一个糖配体识别结构域(carbohydrate recognition domain,CRD),CRD结构域中仅包含1个QPD (Gln-Pro-Asp)基序。序列同源性及进化分析表明,HsCTL与斑节对虾(Penaeus monodon) CTL同源性最高,达36%,而与目前Gen Bank公开的其他贝类CTLs的同源性为9.7%~18.1%。构建的系统进化树显示,HsCTL与斑节对虾和中国明对虾(Fenneropenaeus chinensiss)的同系物聚为一支,与三角帆蚌(Hyriopsis cumingii) perlucin和九孔鲍(Haliotis diversicolor) CTL聚为相邻支。通过实时荧光定量RTPCR检测发现,HsCTL的mRNA广泛分布于池蝶蚌各个组织,其中在血细胞表达量最高,外套膜和肝胰腺次之。且进一步发现,注射脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)后,HsCTL的mRNA表达量在血细胞和肝胰腺组织中显著增加。以上结果表明,HsCTL在池蝶蚌抵抗病原微生物的免疫防御反应中可能起到重要作用,结果为进一步研究HsCTL参与池蝶蚌先天免疫的分子机制打下基础。
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- 关键词:池蝶蚌克隆免疫应答实时荧光定量PCR
- 池蝶蚌致雄性化基因fem-1c及其蛋白分子的结构特征分析被引量:1
- 2014年
- 研究首次获得淡水珍珠贝池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)的致雄性化基因feminization-1C亚型,即fem-1c基因,并进行全长克隆及序列分析。从转录组中Race-PCR扩增fem-1c基因全长cDNA序列,用生物信息学方法对fem-1c基因进行基因组结构分析、多序列同源性比较、跨膜区段、亲疏水性分析、功能结构域预测等。研究结果如下:该cDNA序列全长2328 bp,包含一个1869 bp的最大开放阅读框,编码622个氨基酸,经同源比对和进化树分析,fem-1基因c亚型编码的氨基酸与太平洋牡蛎的同源性最高,为79%;疏水性分析显示该蛋白为亲水性蛋白;二级结构预测发现该蛋白有大量的α螺旋和随机卷曲,形成9个锚蛋白重复序列(Ankyrin repeat,ANK),同时,三级结构预测中可以清楚的看到9个ANK模体,跟SMART预测的结构位点结果相近。从无脊椎动物到脊椎动物fem-1c基因的保守性表明它们有共同的起源,暗示这个基因家族在功能上具备保守性,推测池蝶蚌fem-1c基因可能具备与线虫fem-1基因在性别决定方面上相似的功能。
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- 关键词:池蝶蚌克隆