姚鹏程
- 作品数：2 被引量：10H指数：2
- 供职机构：华东师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 比较不同DNA条形码对中国海岸带耐盐植物的识别率被引量：7
- 2017年
- 海岸带耐盐植物是一个生态和经济价值独特的庞杂类群,人们对其DNA条形码特性的了解甚少。本文对我国从辽宁到海南10个沿海省(市)大陆及岛屿海岸带耐盐植物广泛采样,从采集获得的样品中筛选出53科97属116个物种共562个样品进行DNA条形码研究。对3个叶绿体片段(mat K、rbc L、trn H-psb A)和1个核基因片段(ITS)进行了扩增和测序,统计各个片段的引物通用性和序列获得率,并检验了物种识别率。从序列获得率来看,mat K和trn H-psb A片段表现最好,ITS较差,ITS和mat K的引物通用性比其他2个片段差。序列相似性分析表明,单个片段ITS物种识别率最高(73.36%),其次为mat K(64.03%)和trn H-psb A(61.21%),rbc L的物种识别率最低,仅为46.41%。系统发育树分析显示mat K的物种识别率最高(82.3%),依据trn H-psb A片段难以获得可靠的系统发育树。多维度非度量分析(non-metric multidimensional scaling,NMDS)表明在进行海岸带区域性植物的DNA条形码研究时,叶绿体片段和核基因片段均应该考虑。综合上述研究结果,推荐联合片段ITS+mat K作为中国海岸带耐盐植物DNA条形码。本文为海岸带耐盐植物研究提供了总计1,939条DNA条形码基础数据,为构建耐盐植物DNA条形码数据库奠定了基础。
- 魏亚男王晓梅姚鹏程陈小勇李宏庆
- 关键词：DNA条形码海岸带耐盐植物MATK
- DNA条形码的研究现状概述被引量：3
- 2016年
- DNA条形码于2003年被提出后一直备受关注。经过各国学者的努力，目前DNA条形码的研究已经逐渐从候选片段的筛选，发展到条形码在容个领域的应用开发。本文概述了DNA条形码的研究现状，并从物种本身遗传及分化特性、物种的形态学与分子鉴定结果的不一致性以及应用范围等方面讨论了DNA条形码的局限性。
- 姚鹏程安梅
- 关键词：DNA条形码
