王佳华
- 作品数：6 被引量：3H指数：1
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生环境科学与工程更多>>
- 康氏菌科海洋细菌的系统发育与代谢潜能研究进展
- 2021年
- 康氏菌科(Kangillaceae)是海洋螺杆菌目(Oceanosprillales)下的科级分类单元,包含康氏菌属(Kangiella)、异康氏菌属(Aliikangiella)和Pleionea三个属。在康氏菌属高度精简的基因组中存在异常丰富的胞外蛋白酶编码基因,暗示此类海洋细菌对海洋颗粒有机物中的蛋白质成分降解具有重要贡献。鉴于已分离鉴定的康氏菌属模式菌株专一性利用蛋白类营养物质,我们建议将该属译为"食朊菌属"。本文将结合本实验室的研究进展,对康氏菌科细菌的分离培养过程、系统发育关系、代谢特点和潜在生态功能进行综述,为研究此类海洋细菌的生理生态功能提供思路。
- 王佳华弋伊徐俊
- 关键词：胞外蛋白酶海洋细菌
- 漳江口红树林放线菌资源勘探和生物活性天然产物的基因组挖掘
- 红树林为分布在热带、亚热带海岸潮间带的高生产力生态系统,其中蕴藏有丰富的微生物资源。研究了来自于漳江口红树林沉积物样本的放线菌的多样性,以天然产物生物合成相关的卤化酶编码基因为突破口,锁定了3个类群深入研究：①发现了糖肽...
- 徐岷涓步旭亮高都余河霖王佳华胡晓艳徐俊
- 关键词：红树林放线菌资源勘探
- 海水中主要金属盐对4株Kangiella属细菌的生长及其蛋白酶相关基因表达的影响被引量：1
- 2018年
- 【背景】Kangiella是海洋专属的、营异养生长的革兰氏阴性菌。按16S rRNA基因系统发育分析,Kangiella属归属于γ-变形杆菌纲,但此类细菌的生理生态功能未知。推测该类海洋细菌产生的胞外丝氨酸蛋白酶在其利用有机氮源生长的过程中起重要作用。【目的】研究海水盐中主要金属离子Na盐、Mg盐、Ca盐、K盐对海洋来源的4株Kangiella菌株(K.aquimarina DSM16071、K.geojedonensis YCS-5、K.koreensis DSM 16069和K.profundi FT102)的生长及胞外蛋白酶表达的影响。【方法】测定Kangiella属4个不同种的模式菌株在2216E培养基及不添加Na盐、Mg盐、Ca盐和K盐的2216E培养基中的生长情况。以2%的酪蛋白为底物,采用福林酚法分别检测4株菌株的胞外蛋白酶酶活。克隆K.profundi FT102菌株中的3个丝氨酸蛋白酶编码基因以及phoP和phoQ基因,使用实时荧光定量PCR技术检测Mg盐对这些基因表达的影响。【结果】4株Kangiella菌株在不添加Na盐的2216E培养基中均不能生长;在不添加Mg盐、Ca盐和K盐的2216E培养基中,K.aquimarina DSM 16071、K.geojedonensis YCS-5和K.profundi FT102这3个菌株的生长差异较小;而K.koreensis DSM 16069菌株的生物量在不添加上述3类主要金属盐的2216E培养基中反而增高。各个菌株在对数期时的胞外蛋白酶活差异较大,最高可以达到11.23 U/mL,最低仅为0.99 U/mL。2216E培养基中不添加Mg盐时,K.aquimarina DSM 16071、K.geojedonensis YCS-5和K.profundi FT102这3株菌中的丝氨酸蛋白酶编码基因asp1、asp2和asp3以及phoP和phoQ基因的转录水平无显著差异,而在K.koreensis DSM 16069菌株中这5个基因的表达却显著上调。【结论】Na盐是4株海洋Kangiella菌株生长所必需的金属离子,Mg盐和Ca盐对4株菌株的生长及其中3个保守的丝氨酸蛋白酶基因表达的影响不同。在不添加Mg盐的2216E培养基中,K.koreensis DSM 16069菌株的生物量、胞外蛋白酶活和3个保守的丝氨酸�
- 徐蕾徐蕾卢烨王佳华
- 关键词：海洋细菌丝氨酸蛋白酶金属盐
- 厦门链霉菌在作为斑鸠霉素产生菌中的用途
- 本发明涉及一种厦门链霉菌在作为斑鸠霉素产生菌中的用途。本发明利用红树林土壤来源的厦门链霉菌(Streptomyces xiamenensis)CGMCC No.5675，进行基因组探矿分析和化合物靶向分离，获得多环稠合的...
- 徐岷涓徐俊余河霖王佳华
- 文献传递
- 南海北部陆坡真光层海水中古菌的多样性被引量：2
- 2017年
- 选取中国南海北部陆坡真光层水柱中3个不同深度海水样本,采用荧光实时定量PCR技术、16S rRNA基因克隆文库方法以及系统发育分析,对近表层(SCS-S,水深30 m)、叶绿素最大层(SCS-M,水深65 m)、真光层和暮光层分界点(SCS-B,水深200 m)水层中古菌的多样性组成进行调查.结果表明,3个水层中的古菌16S r RNA基因拷贝数的数量关系为SCS-M层>SCS-B层>SCS-S层,分别为(4.49±0.01)×10~5、(3.37±0.02)×10~4、(9.70±0.10)×10~3copies/L.3个水层中的古菌由广古菌门(Euryarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)两个门构成.在30 m水层和65 m水层中,广古菌门的古菌占大多数;在200 m水层,奇古菌门约占85%.30 m和65 m水层中的广古菌门以Marine GroupⅡ为主,200 m水层中的奇古菌门以Marine GroupⅠ为主.南海北部陆坡真光层海水中不同深度古菌的丰度相差较大,群落组成略有差异,这种差异可能是由深度不同所引起的.其中比例较高的奇古菌门Marine GroupⅠ类群多为氨氧化古菌,可能参与南海中的氮循环.丰度较高的广古菌门Marine GroupⅡ则在系统发育树中表现出和Thermoplasmata有较近的亲缘关系.本研究以南海北部陆坡真光层水柱中16S rRNA基因的丰度及其系统发育关系确定其中古菌的多样性,可为进一步评估古菌参与该海区真光层中碳氮元素循环的作用提供基础数据.
- 谢丽飒徐蕾何莹张宇王佳华徐俊
- 关键词：真光层RRNA基因古菌多样性氨氧化古菌
- 厦门链霉菌在作为斑鸠霉素新产生菌中的用途
- 本发明涉及一种厦门链霉菌在作为斑鸠霉素新产生菌中的用途。本发明利用红树林土壤来源的厦门链霉菌(Streptomyces？xiamenensis)CGMCC？No.5675，进行基因组探矿分析和化合物靶向分离，获得多环稠合...
- 徐岷涓徐俊余河霖王佳华
