刘莉铭
- 作品数：52 被引量：45H指数：5
- 供职机构：中国农业科学院郑州果树研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 一种携带增强型绿色荧光蛋白报告基因的南瓜花叶病毒重组载体及其构建方法
- 本发明涉及一种携带增强型绿色荧光蛋白报告基因的南瓜花叶病毒重组载体及其构建方法，以南瓜花叶病毒基因组RNA2所对应的侵染性克隆pSqMV‑RNA2为模板，将增强型绿色荧光蛋白报告基因插入到MP和LCP之间，获得pSqMV...
- 刘莉铭古勤生
- 文献传递
- 携带eGFP的ZYMV侵染性克隆的构建及其侵染性被引量：5
- 2021年
- 小西葫芦黄花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)是瓜类作物主要病毒之一,严重威胁瓜类产业的可持续发展。本研究在ZYMV甜瓜分离物CH-87侵染性克隆基础上,利用同源重组策略在NIb和CP编码序列之间插入了eGFP,命名为pXT1-ZYMV-eGFP。将pXT1-ZYMV-eGFP转化农杆菌并接种西瓜和甜瓜,结果发现pXT1-ZYMV-eGFP可以系统侵染西瓜和甜瓜,引起典型的花叶症状,在紫外灯下发病植株呈现绿色荧光。经摩擦接种证实,该克隆接种后所产生的病毒子代可以稳定的传播繁殖。研究表明携带eGFP的ZYMV侵染性克隆成功构建,可用于该病毒致病性及病毒与寄主互作的相关研究。
- 刘莉铭康保珊彭斌吴会杰苏芽冬古勤生
- 关键词：甜瓜小西葫芦黄花叶病毒侵染性克隆
- 瓜类褪绿黄化病毒新疆分离物基因组分析被引量：12
- 2017年
- 2016年秋季,新疆维吾尔自治区吐鲁番市哈密瓜大面积发生叶片黄化和褪绿的病害,症状呈瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)引起的典型特征。通过CCYV的特异性引物对该疑似样本进行了RT-PCR检测,获得了预期大小的扩增片段。随后,对新疆的CCYV分离物(CCYV-Xinjiang)全长基因组进行克隆并测序,获得了CCYV-Xinjiang分离物的RNA1和RNA2全长序列信息。对CCYV-Xinjiang和来自Gen Bank数据库的其他CCYV分离物的基因组序列分析,不同分离物RNA1和RNA2两条链的一致性分别是99.65%~99.93%和99.68%~99.89%。单独对基因组的各个非翻译区(UTRs)和编码区的核苷酸变异分析,数据表明不同区域其变异程度不同,其中RNA2的3'UTR区域变异最大,而RNA1的2个UTRs区域变异最小。对已登录Gen Bank的所有CCYV分离物基因组系统进化树分析结果表明,所有分离物聚在同一个组。另外,对来自Gen Bank的18个分离物的外壳蛋白(CP)氨基酸序列进行系统进化树分析,表明来自伊朗的3个分离物分在组2(GroupⅡ),而来自亚洲其他地区的分离物均被分到组1(GroupⅠ)。基于CCYV基因组的信息,发现来自亚洲地区的CCYV的群体遗传变异很小。
- 彭斌刘莉铭刘珊珊张以和吉艳玲吴洋张学军古勤生
- 关键词：甜瓜基因组
- 一种南瓜花叶病毒侵染性克隆载体及其构建方法
- 本发明涉及一种南瓜花叶病毒侵染性克隆载体及其构建方法，以南瓜花叶病毒为材料，将基因组5.8Kb RNA1和3.3Kb RNA2构建到植物表达载体pXT1中，获得以农杆菌介导的对寄主植物有高效侵染能力的病毒载体pSqMV‑...
- 刘莉铭古勤生
- 文献传递
- 一株贝莱斯芽孢杆菌NBT78-2及其应用
- 本发明属于微生物领域，涉及贝莱斯芽孢杆菌，特别是指一株贝莱斯芽孢杆菌NBT78‑2及其应用。其分类名为Bacillus velezensis，保藏于中国典型培养物保藏中心，保藏编号为CCTCC M 2023872，保藏地...
- 吴会杰郭婷婷杨士兵古勤生康保珊刘莉铭
- 一种快速检测瓜类病毒的RNA-RP RT-PCR方法
- 本发明涉及一种快速检测瓜类病毒的RNA‑RP RT‑PCR方法，将感染病毒的瓜类植物叶片采用PBST+2%PVP溶液或0.5%Triton X‑405 PBS溶液匀浆，提取样品病毒RNA于上清液中，以此上清液用于一步RT...
- 刘莉铭古勤生
- 文献传递
- 南瓜蚜传黄化病毒侵染性克隆的构建被引量：1
- 2022年
- 为明确南瓜蚜传黄化病毒(cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)丝瓜分离物CABYVQY的分子变异情况并获得其侵染性克隆,通过反转录PCR(reverse transcription-PCR,RT-PCR)方法扩增获得该分离物的全基因组序列,利用NCBI Blast和Mega X软件对其进行序列一致性分析和系统发育分析,利用同源重组策略构建该分离物的全长基因组cDNA克隆,并通过根癌农杆菌Agrobacterium tumefacieas介导的方法对其侵染性进行接种检测。序列分析结果显示,该分离物基因组全长为5682 nt,与其他分离物的核苷酸序列一致性为84.9%~99.2%,氨基酸序列一致性为87.2%~96.8%。系统发育分析结果显示,该分离物与中国分离物(GenBank登录号:EU000535)、美国分离物(GenBank登录号:MK055337)的亲缘关系较近。经接种试验证实,构建的侵染性cDNA克隆可以系统侵染丝瓜、甜瓜、黄瓜和西瓜4种作物,说明分离物CABYV-QY的侵染性克隆构建成功。
- 刘莉铭任倩彭斌吴会杰康保珊古勤生
- 关键词：瓜类作物全基因组系统进化分析侵染性克隆
- 新疆、甘肃和河南部分地区甜瓜瓜类蚜传黄化病毒分子变异初步分析被引量：9
- 2017年
- 从新疆鄯善县、甘肃瓜州县和河南通许县采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)症状的甜瓜叶片样品63份,利用反转录PCR(RT-PCR)检测,从阳性样品中选取25个分离物扩增出1.4 kb的片段,并对其序列进行分析。结果表明:63份样品中,36份为CABYV阳性;获得的序列包括部分3′端的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)基因、非编码区(NCR)和全长外壳蛋白(CP)基因。随机选取25个分离物的CP基因与GenBank中的序列进行比对,其序列相似性为93.2%~100%。通许分离物间序列相似性为98.8%~99.8%,瓜州分离物间序列相似性为98.2%~100%,鄯善分离物间序列相似性为99.2%~100%,组内表现出极高的同源性。基于其部分RdRp基因、NCR及CP基因序列构建的系统进化树表明:25个CABYV分离物与中国及周边地区(泰国、韩国等)的分离物聚为一簇,而与欧洲地区分离物距离较远,说明了该病毒分子变异与分离物的地理分布有关。
- 吴洋刘莉铭彭斌古勤生
- 关键词：甜瓜分子多样性
- 河南省济源市西瓜病毒检测及和西瓜花叶病毒基因组分析
- 2024年
- 本研究调查了2022年济源市3块西瓜种植地块西瓜病毒病害平均发病率约为97%,并收集20份疑似病毒病样品,包括西瓜14份、甜瓜4份、南瓜1份和杂草反枝苋(Amaranthaceae retroflexus L.)1份。选取3份西瓜和1份杂草反枝苋病样分别进行小RNA测序共检测出7种病毒。同时采用16种侵染西瓜的病毒特异性引物对所有的20份病样进行RT-PCR检测,与小RNA测序检测结果一致。西瓜花叶病毒(watermelon mosaic virus,WMV)和小西葫芦黄花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)是济源病毒病样中发生率前二的病毒,检出率分别是100%和85%。在一份反枝苋杂草样本中检测出WMV,表明反枝苋可能是WMV的中间寄主。从小RNA测序数据,获得了来自济源的4个WMV分离物的全长基因组。对WMV的全长基因组核苷酸序列进行一致性比较和系统进化分析,发现来自济源的WMV分离物具有较高的遗传多样性,表明该病毒在济源地区可能存在多个初始侵染源。本研究明确了济源地区西瓜病毒病种类,为该地区西瓜病毒病的防控策略制定及进一步的流行学研究奠定了理论基础。
- 贾宝华李秀启刘莉铭康保珊古勤生吴会杰彭斌
- 关键词：西瓜西瓜花叶病毒系统进化
- 黄瓜绿斑驳花叶病毒的分子致病性
- 黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)属于帚状病毒科(Virgaviridae)烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的成员。该病毒系种子传播,对葫芦科作...
- 刘莉铭古勤生
- 关键词：侵染性克隆黄瓜绿斑驳花叶病毒定点突变回复突变
- 文献传递
