舒江平
- 作品数：6 被引量：14H指数：3
- 供职机构：上海辰山植物园更多>>
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- 基于系统基因组学分析揭示早期陆生植物的复杂网状进化关系被引量：3
- 2017年
- 植物由水生走向陆生的进化过程中经历了非常复杂的演化,期间产生的大量基因的进化路线可能互不相同,因此仅仅使用系统发育树无法呈现真实的演化关系。系统发育网络图能够清楚地展示包括垂直演化和水平演化在内的复杂网状进化关系。本文选取莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)和4种陆生植物,利用系统基因组学的方法,筛选得到1,668个一对一直系同源基因,重新构建了陆生植物的系统发育网状进化关系。结果发现,使用不同的分析策略所得到的系统发育树不同;对1,668个基因单独分析,发现存在15种不同的拓扑结构;对5个物种筛选得到的直系同源基因进行系统发育网络分析显示,在非常稳健的系统发育网络图中,仅仅5个物种就存在9个不同的分离支,暗示着非常复杂的网状进化关系;而且藻类植物与苔藓植物和石松类植物的分离支之间差异很小,这可能是产生系统发育树冲突的原因之一,也暗示着早期陆生植物发生了复杂的辐射演化。
- 舒江平刘莉沈慧戴锡玲王全喜严岳鸿
- 关键词：系统发育基因组学
- 中国秋海棠属植物的多样性及自然杂交发生特点
- 秋海棠属(Begonia L.)是多样性最丰富的植物类群之一,为第5或6大被子植物属,也是植物界中最近几年种类增加最快的属,目前已知近1900种。中国秋海棠属资源十分丰富,现已超过200种,而且还有很多新物种等待考察和描...
- 田代科肖艳舒江平付乃峰
- 关键词：秋海棠属多样性自然杂交
- 文献传递
- 中国秋海棠属植物的多样性及自然杂交发生特点
- 秋海棠属(Begonia L.)是多样性最丰富的植物类群之一，为第5 或6 大被子植物属，也是植物界中最近几年种类增加最快的属，目前已知近1900 种.中国秋海棠属资源十分丰富，现已超过200 种，而且还有很多新物种等待...
- 田代科肖艳舒江平付乃峰
- 关键词：秋海棠属多样性自然杂交
- 基于模式产地的分子证据澄清南平鳞毛蕨的分类学地位被引量：2
- 2018年
- 地球上有多少物种一直以来都是人们极度关注的问题,而存疑物种是造成该问题难以解决的重要阻碍之一。目前,模式标本是存疑物种得以确定的唯一凭证标准,然而,因其特殊的分类学地位而难以进行有效的观察和研究。因此,前往模式产地寻找存疑物种的原始信息成为最有效的替代途径。随着分子生物学,特别是DNA条形码技术在物种分类与鉴定中的广泛应用,准确而快速鉴定存疑物种成为可能。以存疑物种——南平鳞毛蕨(Dryopteris yenpingensis)为例,利用来自模式产地的分子数据进行DNA条形码分析,并结合形态学特征澄清了南平鳞毛蕨的分类学地位,确定南平鳞毛蕨与荔波鳞毛蕨(D.liboensis)为同一物种,同意将荔波鳞毛蕨作为其异名。研究结果和方法可为今后澄清更多存疑物种的分类学地位提供参考。
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- 关键词：DNA条形码
- 东亚特有珍稀蕨类植物岩穴蕨(碗蕨科)高通量转录组测序及分析被引量：6
- 2016年
- 岩穴蕨(Monachosorum maximowiczii)隶属于碗蕨科稀子蕨属,是东亚中高海拔地区所特有的珍稀濒危植物。为了在分子水平对该物种有进一步的认识,本文首次利用二代高通量测序技术(RNA-seq)对岩穴蕨进行了转录组测序分析。通过Illumina Hiseq 2500测序平台,共计获得4.95 Gb原始数据(raw data),经过滤后得到4.83 Gb有效数据(clean reads),并进行从头组装得到了101,448条unigene。其中,54,106条unigene预测到完整的开放阅读框。我们利用目前已知的51个植物基因组数据,对岩穴蕨的unigene进行了详尽的功能注释,并通过GO、COG、KEGG注释进一步了解了这些编码基因的作用方式、特征以及所参与的代谢通路。同时,转录因子分析结果也为岩穴蕨的环境适应机制研究提供了初步线索。
- 刘莉舒江平韦宏金张锐沈慧严岳鸿
- 关键词：蕨类植物转录组学高通量测序生物多样性
- 海南蕨类植物新记录被引量：3
- 2016年
- 报道了海南省一些蕨类植物新记录,包括1属——龙津蕨属(Mesopteris Ching),1变种——白斑凤尾蕨(Pteris grevilleana var.ornata Alderw.)和7种——假斜方复叶耳蕨(Arachniodes hekiana Sa.Kurata)、疏网凤了蕨(Coniogramme wilsonii Hieron.)、黑叶角蕨[Cornopteris opaca(D.Don)Tagawa]、大羽双盖蕨(Diplazium megaphyllum(Baker)Chris)、龙津蕨[M.tonkinensis(C.Chr.)Ching]、羽叶新月蕨[Pronephrium parishii(Bedd.)Holttum]和光羽毛蕨(Cyclosorus calvescens Ching)。凭证标本均保存于中国科学院上海辰山植物科学研究中心标本馆(CSH)。
- 韦宏金舒江平黄科瑞严岳鸿商辉
- 关键词：蕨类植物
