王晓歌 作品数:21 被引量:17 H指数:3 供职机构: 中国农业科学院棉花研究所 更多>> 发文基金: 转基因生物新品种培育专项 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析 2019年 通过构建棉花GhDMT3的VIGS沉默载体并侵染棉花,探究该基因在棉花和高等植物中的功能。采用生物信息学方法对棉花DNA甲基转移酶基因GhDMT3(CotAD_46796)的DNA序列结构特性、该基因编码的蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等方面进行分析。克隆该基因,并构建pYL156:GhDMT3沉默载体。蛋白质相对分子质量为71 107.02 kD,等电点为4.85,不稳定系数为36.33。不同胁迫处理(冷、干旱)VIGS沉默GhDMT3的棉花幼苗表现出明显的表型差异。qRT-PCR的表达模式分析发现,不同胁迫下p YL156侵染的棉花中不同部位表达量没有变化,用pYL156:GhDMT3侵染过的棉花中GhDMT3转录水平与对照相比明显下降。与未沉默GhDMT3的棉花幼苗相比,沉默GhDMT3的棉花幼苗抗逆性显著增强。 杨笑敏 王俊娟 王德龙 陆许可 陈修贵 郭丽雪 王帅 陈超 王晓歌 韩明格 叶武威关键词:陆地棉 生物信息学分析 陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列分析 被引量:3 2017年 为了筛选棉花抗逆转基因育种的候选启动子,根据陆地棉脱水素基因GhDHN1的cDNA序列和陆地棉基因组序列,利用生物信息学分析方法,获得棉花陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列。结果表明,该启动子上多个位点含有启动子的基本元件TATA-box和CAAT-box,并含有非生物逆境胁迫响应元件、响应植物激素顺式作用元件、多种光调控相关的顺式作用元件以及胚乳表达顺式调控元件等。推测GhDHN1基因的启动子受光诱导,同时受低温和干旱胁迫等非生物逆境的诱导,参与棉花的生长发育。 王俊娟 王德龙 王帅 阴祖军 王晓歌 樊伟莉 郭丽雪 郭晓宁 叶武威关键词:陆地棉 脱水素基因 启动子 蛋白质GhDHN1在调控植物抗逆性中的应用 本发明公开了蛋白质GhDHN1在调控植物抗逆性中的应用。所述蛋白质GhDHN1为a1)或a2)或a3):a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质;a2)在序列表中序列2所示的蛋白质的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋... 王俊娟 叶武威 穆敏 王帅 陆许可 陈修贵 王德龙 阴祖军 樊伟莉 郭丽雪 王晓歌 舒娜文献传递 陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的结构特征和无序性分析 被引量:5 2017年 利用生物信息学对陆地棉脱水素蛋白GhDHN1的氨基酸组成理化性质、保守结构域K片段以及无序性进行分析。结果表明,GhDHN1蛋白无明显跨膜结构,不是分泌蛋白,其2个序列相近的K片段均具有高度亲水性,属于部分无序性蛋白。推测GhDHN1的这些结构特性与其调控棉花响应低温胁迫有关。 王俊娟 阴祖军 王德龙 王帅 王晓歌 樊伟丽 郭丽雪 陈超 叶武威关键词:棉花 结构特征 一种用于目的基因干扰的RNA片段及其应用 本发明公开了一种用于目的基因干扰的RNA片段及其应用。本发明提供了一种用于干扰目的基因的RNA,为将miR160前体序列中的miR160序列替换为干扰目的基因RNA片段甲,且将所述miR160前体序列中的miR160序列... 阴祖军 叶武威 王晓歌 王帅 崔法 王俊娟 王德龙 舒娜 樊伟丽 郭丽雪 崔瑞峰 郭晓宁文献传递 陆地棉焦磷酸酶基因GhVP的启动子序列分析 2017年 为了筛选棉花耐盐转基因育种所需的诱导型候选启动子,本研究根据陆地棉焦磷酸酶基因GhVP的cDNA序列和陆地棉基因组序列,获得陆地棉焦磷酸酶基因GhVP启动子序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该启动子具有多个基本元件TATA-box和CAAT-box,并含有多种逆境胁迫诱导相关的响应元件,含有丰富的光响应元件以及其他多种顺式作用元件。推测GhVP基因的转录同时受光、高温、干旱、创伤、脱落酸诱导,受生物钟控制的顺式元件调控,参与棉花的生长发育。 王俊娟 王帅 阴祖军 王德龙 王晓歌 崔瑞峰 樊伟莉 郭丽雪 郭晓宁 叶武威关键词:棉花 启动子 一种双浓度PEG6000评价陆地棉萌发期抗旱性的方法 本发明涉及植物逆境胁迫技术领域,具体涉及一种双浓度PEG6000评价陆地棉萌发期抗旱性的方法。本发明首次提出采用浓度为12%和16%的PEG6000滤纸进行陆地棉萌发期抗旱性的评价。采用本发明提供的方法,能够在36份陆地... 王俊娟 叶武威 韩迎春 王帅 赵兰杰 马宝玲 阴祖军 王延琴 陆许可 付小琼 王德龙 陈修贵 郭丽雪 陈超 王晓歌 孙亮庆 芮存 王琴琴 范亚朋 张悦新 冯茜贤耐盐相关基因剪切体的克隆、鉴定及其应用 本发明公开了耐盐相关基因剪切体的克隆、鉴定及其应用。本发明首先从耐盐基因中克隆得到两种GhIRE1基因剪切体序列,分别命名为GhIRE1‑s1和GhIRE1‑s2,接下来通过构建原核表达载体进行原核表达,获得了GhIRE... 叶武威 王晓歌 陈修贵 陆许可 王德龙 王俊娟 王帅 郭丽雪 陈超 阴祖军 赵兰杰文献传递 陆地棉耐盐相关SNP筛选和鉴定 2020年 盐胁迫是限制作物产量提高的一个主要非生物因素。棉花是盐碱地的先锋作物,研究棉花的耐盐性,筛选耐盐相关分子标记,对充分利用棉花的耐盐性及棉花耐盐种质鉴定有重要意义。在本研究中,我们对前期筛选到的1281个耐盐相关候选SNP即SNPr(SNP related to salt tolerance)进行分析,利用BEDTools软件获得位于基因上的SNPr,并使用AgriGO(http://bioinfo.cau.edu.cn/agriGO/)和KAAS(http://www.genome.jp/tools/kaas/)网站对这些基因进行GO和KEGG分析。借助perl编程,获得非同义SNPr。分析发现,1281个SNPr中,有353个位于基因上,其中247个位于基因外显子区,且有174个是非同义SNPr。从中选择12个非同义SNPr,使用CAPS/dCAPS引物进行验证,并结合田间耐盐鉴定的结果,最终得到1个与耐盐相关的SNPr。这个SNPr位于CHD3/CHD4家族基因上,可能与盐胁迫过程中的表观修饰有关。 王晓歌 舒娜 王俊娟 陆许可 陈修贵 王德龙 王帅 郭丽雪 陈超 叶武威关键词:耐盐 棉花脱水素蛋白GhDHN1的结构特性研究 脱水素,属胚胎发育晚期丰富蛋白(Late embryogenesis abundantprotein,LEA)第二家族成员,是植物中广泛存在的亲水性蛋白,与植物抗逆性密切相关。脱水素的结构是其行使功能的前提条件。我们在陆... 王俊娟 王晓歌 阴祖军 王德龙 王帅 樊伟莉 郭丽雪 陈超 叶武威关键词:棉花 结构特性 文献传递