陈芳芳
- 作品数:13 被引量:23H指数:3
- 供职机构:武汉大学中南医院更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 双抗体捕获结合量子点多色成像系统捕获并鉴定异质性循环肿瘤细胞
- 2015年
- 目的 构建一个循环肿瘤细胞(CTCs)捕获和检测系统,实现对上皮和间质表型CTCs的捕获和鉴定.方法 制备基于羟基磷灰石-壳聚糖的透明纳米薄膜芯片,耦联上皮细胞黏附分子(EpCAM)和CD133抗体,利用免疫亲和原理捕获CTCs,采用量子点多色成像技术分别标记CD45(1:100)、角蛋白(CK,1:600)和波形蛋白(Vimentin,1:100),对捕获的CTCs进行识别及表型鉴定.结果 双抗体捕获芯片对EpCAM中表达和低表达细胞株的捕获效率要显著高于单抗体芯片捕获(P<0.05).量子点多色成像证实,32例肿瘤患者血液中存在CK阳性、Vimentin阳性和CK/Vimentin均阳性的CTCs.此外,Vimentin阳性及CK/Vimentin均阳性的CTCs在进展期(Ⅲ/Ⅳ)肿瘤中所占的比例(68.4%,52/76;78.3%,47/60)远高于早期(Ⅰ/Ⅱ)肿瘤(31.6%,24/76;21.7%,13/60).结论 双抗体捕获系统和量子点多色成像技术,可同时捕获并鉴定上皮和间质表型的CTCs,提高CTCs的捕获效率.
- 王林伟程勃然王舒艺陈芳芳王振盟方远熊斌
- 关键词:循环肿瘤细胞双抗体量子点上皮-间充质转化
- 一种乳腺癌预后风险预测的基因标志组合物及应用
- 本发明公开一种乳腺癌预后风险预测的基因标志组合物及应用。所述标志物组合物由AR、LCN2、CIRBP、KIT和SIAH2基因组成。本发明基于GEO数据库转录组数据和EMT数据库中的EMT基因集发掘与乳腺癌预后相关的EMT...
- 张京伟曾祎凡魏蕾陈芳芳田毅浩李俊万慧芳
- 基于血管生成相关基因构建浸润性乳腺癌复发风险预测模型
- 2024年
- 目的:挖掘浸润性乳腺癌复发的独立预后基因并构建浸润性乳腺癌复发风险预测模型。方法:应用公共数据库,使用一致性聚类,根据肿瘤血管生成相关基因表达将样本分组并进行差异分析。通过单因素Cox回归和最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归,以无复发生存期(RFS)为观测指标,结合患者临床特征,建立浸润性乳腺癌复发风险预测模型。结果:鉴定了13个基于肿瘤血管生成的复发独立预后基因(PLS3、IGFBP4、CXCL14、HIST1H2BH、EMC9、H2BFS、S100A9、GJA1、NID2、ID3、PDZD2、GRP、FMO1),并结合患者TNM分期建立了浸润性乳腺癌复发风险预测模型。结论:基于肿瘤血管生成的13个基因复发风险预测模型具有良好的预测性能,可以准确预测浸润性乳腺癌患者的复发风险。
- 陈岩砚魏蕾陈芳芳张京伟
- 关键词:浸润性乳腺癌复发血管生成
- 基于M1/M2型巨噬细胞浸润相关特征基因构建乳腺癌预后风险预测模型
- 2024年
- 目的:基于M1/M2型巨噬细胞浸润特征基因构建乳腺癌预后风险预测模型,识别新的乳腺癌预后标志物,以促进乳腺癌精准治疗策略的发展。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌RNA-seq数据和临床信息,结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)、CIBERSORT、xCell、QUANTISEQ和单因素Cox回归筛选与乳腺癌预后相关的M1/M2型巨噬细胞特征基因。通过LASSO-Cox回归建立预后风险模型,使用ROC曲线、Kaplan-Meier生存曲线和列线图评估模型。同时,使用ESTIMATE算法和TIDE评分分析肿瘤微环境和免疫治疗响应性。结果:识别了91个与乳腺癌预后密切相关的特征基因。基于这些基因,构建了含39个关键基因的预后风险模型,同时计算了风险评分。该模型准确预测了乳腺癌患者1年、3年和5年生存预后,风险评分被证实为预后的独立预测因子。对患者进行风险分层,高风险组生存期显著短于低风险组(P<0.001)。列线图验证了风险评分的临床价值。低风险组患者相对于高风险组表现出更高的免疫分数和ESTIMATE分数,以及较低的肿瘤纯度和TIDE评分,这暗示他们可能更能从免疫治疗中获益。结论:本研究基于M1/M2型巨噬细胞浸润相关特征基因成功构建了乳腺癌预后风险预测模型。该模型不仅能够对乳腺癌患者预后进行有效的评估和精准预测,还能为免疫治疗的临床决策提供参考依据,有助于乳腺癌个体化精准治疗。
- 胡美顺陈芳芳张京伟
- 关键词:乳腺癌
- 食管癌治疗进展——由单一手段走向综合治疗之路
- 食管癌是我国常见的恶性肿瘤之一,中国食管癌发病数约占全球食管癌发病总数的一半以上,目前年调整死亡率为15.02/10万,居恶性肿瘤死亡率第四位。手术是局限性食管癌的主要治疗手段,但是术后5年生存率仍较低,一般报道在25%...
- 胡卫东陈芳芳吴洲清
- 双抗体捕获结合量子点多色成像对异质性循环肿瘤细胞的捕获和鉴定研究
- 目的 构建一个循环肿瘤细胞(Circulating tumor cells,CTCs)捕获和检测系统,实现对上皮和间质表型CTCs的捕获和鉴定.方法 制备基于羟基磷灰石-壳聚糖的透明纳米薄膜芯片,偶联上皮细胞粘附分子(E...
- 陈媛媛程勃然王舒艺陈芳芳王振盟方远熊斌
- 关键词:循环肿瘤细胞双抗体量子点上皮间质转化
- 经颈内静脉输液港植入术中导管置入长度回归方程的建立被引量:5
- 2018年
- 目的建立基于身高、体质量、BMI的经颈内静脉输液港植入术中导管置入长度的回归方程。方法选择93例经颈内静脉输液港植入术的乳腺癌患者,其中41例右乳腺癌患者均经左颈内静脉置入导管,52例左乳腺癌患者均经右颈内静脉置入导管。置入后,C臂机透视下准确测量从颈部穿刺点置入导管的长度。采用Pearson相关性分析法分析身高、体质量及BMI与两侧颈内静脉置入导管长度的相关性,通过多重线性回归分析建立两侧颈内静脉置入导管长度的多元回归方程。结果经左颈内静脉置入导管长度与患者身高呈正相关(r=0. 520,P=0. 001),与BMI呈负相关(r=-0. 326,P=0. 025),与体质量无关(r=0. 009,P=0. 934);经右颈内静脉置入导管长度与患者身高呈正相关(r=0. 290,P=0. 012),与BMI(r=-0. 608,P <0. 001)、体质量(r=-0. 445,P=0. 009)均呈负相关。通过多重线性回归分析得到回归方程:经左颈内静脉置入导管长度(cm)=2. 427+10. 993×身高(m)-0. 169×BMI(kg/m2),经右颈内静脉置入导管长度(cm)=18. 957+0. 133×体质量(kg)-0. 588×BMI(kg/m2)。结论建立了基于身高、体质量、BMI的经颈内静脉输液港植入术中置入导管长度的回归方程;术前通过回归方程,可以更准确地估算导管置入长度。
- 袁泽伟马洪卫韦德飞马青陈芳芳
- 关键词:静脉输液港颈内静脉体质量体质量指数
- 性激素受体阳性乳腺癌辅助化学治疗病理完全反应预后风险预测的基因对标志组合物及应用
- 本发明公开了一种性激素受体阳性乳腺癌辅助化学治疗病理完全反应预后风险预测的基因对标志组合物及应用。所述标志物组合物由19个基因对组成。本发明基于GEO数据库转录组数据和TCGA数据库发掘与性激素受体阳性乳腺癌辅助化学治疗...
- 张京伟魏蕾李俊陈芳芳龚克田毅浩
- 乳腺癌复发相关mRNA组合物及其在制备复发性乳腺癌预后诊断产品中的应用
- 本发明公开了一种乳腺癌复发相关mRNA组合物及其在制备复发性乳腺癌预后诊断产品中的应用,所述乳腺癌复发相关mRNA组合物由FRS2,IGF2BP2,REPS2,XYLT2,ACSL4,EEF1A2和FGFR3组成。本发明...
- 张京伟陈岩砚关晓青魏蕾田毅浩陈芳芳
- 转录因子E2F1与肿瘤预后和肿瘤免疫的泛癌研究被引量:1
- 2021年
- 目的:揭示E2F1在肿瘤中重要的免疫调节因子的地位,为肿瘤的免疫治疗和预后预测提供新的靶点。方法:利用ONCOMINE数据库、UCSC Xena数据库综合分析E2F1在肿瘤组织以及癌旁组织中的表达。在GEPIA数据库中,测试E2F1表达和泛癌分期之间的相关性以及泛癌组织和癌旁组织之间E2F1的表达水平差异。Kaplan-Meier Plotter分析E2F1在泛癌中的差异生存曲线。并综合分析各个肿瘤中E2F1与肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)的相关性。随后使用TISIDB数据库重点研究了每种肿瘤中E2F1与肿瘤免疫浸润细胞之间的相关性。结果:E2F1在多种肿瘤中普遍高表达,且E2F1可以预测多种肿瘤患者的生存率。在多种肿瘤中,E2F1与肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性明显相关。E2F1和ACT-CD4淋巴细胞的关系最为明显,尤其是在乳腺浸润癌(BRCA)、肾透明细胞癌(KIRC)和肝细胞肝癌(LIHC)这三种肿瘤中。结论:E2F1是至关重要的肿瘤预后预测因子,并在一定程度上调节多种肿瘤相关的免疫反应。
- 徐靓婧邵尤城龚鹏举陈芳芳张京伟
- 关键词:E2F1预后肿瘤微环境