何鑫
- 作品数：7 被引量：22H指数：3
- 供职机构：上海市普陀区疾病预防控制中心更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 2015-2018年上海市普陀区手足口病病原谱及柯萨奇病毒基因特征分析被引量：7
- 2020年
- 目的研究2015—2018年上海市普陀区手足口病病原谱,并对鉴定为柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)的VP1基因特征进行分析,以掌握本地区CVA6的分子流行病学特征。方法采用实时荧光定量PCR法对收集的标本进行肠道病毒通用基因和分型基因检测,对鉴定为CVA6型病毒进行VP1基因测序并分析。结果2015—2018年共检测943份手足口标本,肠道病毒通用基因阳性522份(55.36%),其中CVA6阳性332份(63.60%),柯萨奇病毒A16型(coxsackievirus A16,CVA16)阳性110份(21.07%),肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)阳性56份(10.73%),柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CVA10)阳性11份(2.11%),其他肠道病毒13份(2.49%)。20株CVA6型病毒的VP1基因之间核苷酸同源性为92.9%~100.0%,氨基酸同源性为98.4%~100.0%,都属于D3亚型。结论2015—2018年上海市普陀地区引起手足口病的病原体主要有CVA6、CVA16、EV71和CVA10,CVA6已成为上海市普陀地区手足口病的主要病原体,其中优势基因型为D3亚型。
- 李晓君唐海丰何鑫胡焰顾文超
- 关键词：手足口病病原谱VP1基因
- 2016年上海市普陀区手足口病病原谱及EV71和Cox A16病毒分离株VP1基因特征分析被引量：6
- 2018年
- 目的了解上海市普陀区手足口病病原学特点,分析肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16) VP1基因的特征,为手足口病的防治提供科学依据。方法收集2016年上海市普陀区手足口病患者的咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR法(Real-time PCR)进行核酸检测,并用RD细胞对核酸检测结果为EV71和Cox A16的标本进行病毒分离,收获的阳性分离株利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法扩增病毒VP1区核苷酸序列,测序后分析其同源性并构建系统进化树。结果 2016年上海市普陀区共检测234份手足口病标本,阳性标本138份,阳性率为58.97%(138/234)。其中EV71阳性率为11.54%(27/234)、Cox A16阳性率为18.80%(44/234)、Cox A6阳性率为27.78%(65/234)和其他肠道病毒阳性率0.85%(2/234)。病毒分离培养阳性株包括10株EV71和20株Cox A16,10株EV71分离株均为C4a型,VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.6%～99.9%和98.7%～100.0%;20株Cox A16分离株均为B1b亚型,VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.4%～100.0%和98.2%～100.0%。结论 2016年上海市普陀区手足口病呈现Cox A6、EV71和Cox A16共同流行,而EV71流行株属于C4a亚型,Cox A16流行株属于B1b亚型,均与国内大部分地方的流行株基因亚型基本一致。
- 李晓君唐海丰何鑫胡焰顾文超
- 关键词：手足口病病原谱柯萨奇病毒A组16型VP1基因
- 2016年上海市普陀区手足口病病原谱及EV71和Cox A16病毒分离株VP1基因特征分析
- [目的]了解上海市普陀区手足口病病原学特点,分析肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)VP1基因的特征,为手足口病的防治提供科学依据.[方法]收集2016年上海市普陀区手足口病患者的咽拭子标本,...
- 李晓君唐海丰何鑫胡焰顾文超
- 关键词：手足口病EV71COXA16
- 液体MGIT培养法联合MPB64胶体金法快速检测结核分枝杆菌被引量：2
- 2015年
- 目的观察液体分枝杆菌培养管(MGIT)培养法联合MPB64胶体金法快速检测结核分枝杆菌的应用价值。方法收集上海市某区级医院2013年4月至2013年10月肺结核门诊抗酸染色涂片阳性痰标本80例,分别用液体MGIT培养法与固体(L—J)培养法进行培养阳性率和报阳时间比较分析;应用75株液体MGIT培养法与固体罗氏(L—J)培养法双阳菌株进行MPB64胶体金法和传统菌型鉴定比较分析。结果 80例抗酸染色涂片阳性痰标本,液体MGIT培养法阳性率97.5%,固体L-J培养法阳性率93.8.%,符合率96.3%(77/80);液体MGIT培养法平均报阳时间13.2天,固体L-J培养法平均报阳时间26.5天,二者间差异有统计学意义(P<0.05)。分枝杆菌MPB64抗原胶体金法有较高的特异性和灵敏性,方法简便、快速,是分枝杆菌菌种鉴别的有效方法。结论液体MGIT培养法培养联合MPB64免疫肢体金法可作为较为敏感和特异的检测MTB感染的方法,并可以快速有效地区分MTB和NTM。
- 孙黎萍何鑫
- 关键词：结核分枝杆菌非结核分枝杆菌MPB64胶体金法
- 上海市普陀区监测点医院697例急性上呼吸道感染病例监测结果研究被引量：2
- 2020年
- 目的了解上海市普陀区急性呼吸道感染病原谱构成和流行病学特征,为制定和完善呼吸道传染病防控策略提供科学依据。方法依托上海市急性呼吸道感染监测网络,对普陀区哨点监测医院发热门诊的急性呼吸道感染病例,按5∶1抽样间隔进行调查,并采集鼻咽拭子进行病原学检测。结果共登记3431例病例,采集697例病例样本,其中阳性病例519例,阳性率为74.46%。病毒阳性率为45.05%,主要为甲型流感病毒(阳性率为30.42%)、乙型流感病毒(阳性率为6.89%)、鼻病毒/肠道病毒(阳性率为3.30%);细菌阳性率为10.62%,主要为肺炎克雷伯菌(阳性率为5.74%)、金黄色葡萄球菌(阳性率为3.59%);混合感染阳性率为18.79%。每年的冬春季和夏秋季出现阳性检出率的双流行峰。不同年龄阳性检出率比较差异无统计学意义(P>0.05),男女性别阳性检出率比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论上海市普陀区急性呼吸道感染病原谱较为广泛,流感病毒和肺炎克雷伯菌是感染的主因,应进一步加强病原监测和系统研究。
- 唐海丰李晓君胡焰何鑫顾文超张宇艳
- 关键词：呼吸道感染病原谱
- 上海市普陀区515例住院严重急性呼吸道感染病例监测结果分析被引量：5
- 2020年
- 目的了解上海市普陀区住院严重急性呼吸道感染(SARI)的病原谱和流行病学特征,为SARI防控提供参考依据。方法收集2016年1月-2017年10月上海市普陀区中心医院住院的SARI监测病例的咽拭子标本和临床信息,采用多重荧光聚合酶链式反应(PCR)检测方法检测22种呼吸道病原体,并分析病例的病原学和流行病学特征。结果共监测到住院SARI病例515例,年龄中位数为6岁,主要来自儿内科。共检出呼吸道病原体阳性病例160例,总阳性率为31.07%。其中流感病毒阳性26例(5.05%);其他病毒阳性105例(20.39%),主要为腺病毒(5.83%)、副流感病毒(5.24%)和鼻病毒/肠道病毒(4.66%);细菌阳性19例(3.69%),主要为肺炎支原体(3.5%);混合感染10例(1.94%)。流感病毒呈春夏季高发,其他病毒呈冬春季和夏季高发,细菌呈夏季高发。不同年龄组的病例阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05),7~16岁年龄组的病例病原体阳性率最高(37.36%)。不同住院科室病例阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.01),儿内科的病例阳性率最高(28.37%)。患有肺部疾病病例的阳性率高于患有心脑血管疾病的病例(P<0.05)。结论上海市普陀区住院SARI的主要病原体为流感病毒、腺病毒、副流感病毒、鼻病毒/肠道病毒和肺炎支原体等,不同的病原体呈现不同季节高峰,建议重点加强<17岁未成年人SARI病例的监测,并扩大SARI监测的呼吸道病原种类。
- 顾文超唐海丰李晓君胡焰桑灏何鑫张宇艳
- 关键词：病原谱流行病学特征
