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刘新卓

作品数:3 被引量:6H指数:2
供职机构:厦门大学物理科学与技术学院福建省等离子体与磁共振研究重点实验室更多>>
发文基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金福建省自然科学基金更多>>
相关领域:理学农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 2篇理学
  • 1篇农业科学

主题

  • 2篇代谢
  • 2篇代谢组学
  • 2篇核磁
  • 2篇核磁共振
  • 2篇核磁共振波谱
  • 2篇波谱
  • 1篇信号
  • 1篇信号分析
  • 1篇营养
  • 1篇营养代谢
  • 1篇散度
  • 1篇数据分析
  • 1篇缩放
  • 1篇缩放算法
  • 1篇罗非鱼
  • 1篇磁共振

机构

  • 3篇厦门大学
  • 1篇东华理工大学

作者

  • 3篇刘新卓
  • 2篇董继扬
  • 2篇邓伶莉
  • 2篇沈桂平
  • 1篇许晶晶
  • 1篇周玲
  • 1篇陈忠
  • 1篇王婉兰

传媒

  • 1篇厦门大学学报...
  • 1篇光谱学与光谱...

年份

  • 2篇2016
  • 1篇2014
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
基于K-L散度的核磁共振波谱数据尺度缩放方法被引量:4
2014年
在基于核磁共振(NMR)的代谢组学数据分析中,尺度缩放是关键的预处理步骤之一,其主要目的是通过调整数据的方差结构,改善后续的多变量统计分析的结果。从信息熵的角度出发,利用KullbackLeibler(K-L)散度来度量不同实验分组的生物样品的1 H NMR波谱数据的差异程度,并结合单位方差缩放法,提出一种基于K-L散度的尺度缩放方法。该方法先利用单位方差法将数据各变量的标准差调整到同一水平上,再利用K-L散度对各变量进行有监督地加权,增强重要变量、减弱无关变量。由于K-L散度是在概率分布的意义上度量数据间的差异程度,且对于高斯和非高斯分布的数据均适用,因此能更准确地度量不同实验分组样品的1 H NMR波谱数据的差异性,从而更有效地地对谱数据的重要变量进行识别和加权。人群尿液1 H NMR波谱数据的分析结果表明,基于K-L散度的尺度缩放方法能有效抑制噪声变量,同时很好地区分特征变量和非特征变量;提高主成分回归(PCR)模型的判别能力;改善偏最小二乘回归判别分析(PLS-DA)模型的解释能力、预测能力以及对特征代谢物的辨识能力。
邓伶莉Cheng Kian-Kai沈桂平周玲刘新卓董继扬陈忠
关键词:核磁共振波谱代谢组学
核磁共振波谱信号分析中的尺度缩放新算法被引量:2
2016年
尺度缩放(scaling)是代谢组学数据处理中的一个重要环节,其主要目的是增强后续多元统计模型的分析能力.但目前常用的尺度缩放方法大多将尺度缩放当成一个独立的数据处理步骤,而未考虑多元统计模型的需要,使得后续的多元统计模型难以达到最优的分析能力.因此,提出一种模型自适应的数据尺度缩放算法,该算法将模型性能的代价函数写成变量缩放系数的一个函数,通过最大化代价函数来寻找最优的变量缩放系数.并且利用真实的核磁共振波谱数据对新方法进行评估,与单位方差法(unit variance,UV)、帕莱托法(Pareto)和变量稳定性法(variable stability,VAST)3种常用的尺度缩放方法进行比较.结果表明,新方法能够保留谱数据的结构信息,有效增强重要变量,抑制噪声和无关变量,提高模型的解释能力和预测能力.
刘新卓邓伶莉王婉兰沈桂平许晶晶董继扬
关键词:磁共振
代谢组学数据尺度缩放新算法及其应用
代谢组学,即利用高通量、高灵敏度与高精确度的现代分析技术,结合模式识别方法研究生物体系在受到外界刺激或干扰因素后,其内源性小分子代谢产物的动态变化,探究代谢模式变化与生命现象之间的关系,已成为当今系统生物学的一个研究热点...
刘新卓
关键词:罗非鱼营养代谢数据分析
文献传递
共1页<1>
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