张建 作品数:11 被引量:13 H指数:2 供职机构: 哈尔滨医科大学大庆校区医学信息学系 更多>> 发文基金: 黑龙江省卫生厅科研项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 自动化与计算机技术 生物学 文化科学 更多>>
拓扑推断乳腺癌的活性miRNA介导的子通路 2018年 笔者获取了人类通路数据、TCGA(The Cancer Genome Atlas)中乳腺癌表达数据、mirTarBase和miRBase等数据库中用于实验验证的miRNA-mRNA靶向关系数据,通过整合生物网络的拓扑信息、miRNAs和基因表达的差异性以及miRNAs和基因的靶向互做关系,计算出每个miRNA介导的自通路的活性值,再从中筛选出活性较高的自通路作为癌症分子诊断的标志物,进而提出一种算法miDRW。实验证明,乳腺癌的数据内5倍交叉验证的AUC值可达0.994 8,准确率达98.86%,明显高于单基因和单miRNA标志物的分类指标。可见,笔者提出的整合算法可以精确识别乳腺癌的诊断标志,并实现精确分类。 宁梓淯 张建 关梦 周新源关键词:癌症 分子标志物 胰腺癌中miRNAs、mRNAs基因表达谱分析 2016年 本文研究miRNAs、mRNAs在胰腺癌中的调控机制。通过对胰腺癌表达谱进行分析,基于生物信息学方法,建立miRNAs-mRNAs网络,通过模块挖掘获得5个功能显著性模块,网络中结点度较大的HUB节点miRNAs,这些结点与胰腺癌的发生、发展密切相关。对每个模块进行聚类分析,得到度数小却聚集的集合,这些基因也和胰腺癌密切相关。对这些模块进行功能注释,多个模块注释到代谢相关的功能上,表明胰腺癌与代谢密切相关;另外,多个模块中具有多个相同功能注释,多个调控相反的功能在同一模块当中出现。这表明在组织自身原来就存在着平衡调控机制。通过本文的研究得到miRNAs与mRNAs协同作用的一些结果,为今后更深入的研究胰腺癌提供指导和借鉴。 白雪峰 刘跃娟 齐靖 张建关键词:胰腺癌 MIRNAS MRNAS 蜂胶黄酮对卡介苗联合脂多糖诱导小鼠免疫性肝损伤的保护作用 被引量:1 2011年 目的探讨蜂胶黄酮(PF)对卡介苗(BCG)与脂多糖(LPS)诱导小鼠免疫性肝损伤的作用。方法除正常对照组外,采用BCG和LPS诱导小鼠建立免疫性肝损伤模型,随机分为5组,药物实验组分别用300mg/kg、150mg/kg、75mg/kg的蜂胶黄酮干预后,计算肝指数;检测血清中谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)活性;测定肝组织中丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH—Px)等生化指标。结果蜂胶黄酮高、中剂量实验组小鼠肝指数下降,与模型组比较差异有统计学意义(F=9.88,P〈0.05)且不同程度地降低血清ALT及AST活性(F值分别为55.66和6.86,P〈0.05);蜂胶黄酮各浓度组均能提高肝组织中SOD、GSH—Px水平(F值分别为11.96和11.14,P〈0.05),减少MDA的含量(F=8.61,P〈0.05)。结论蜂胶黄酮对BCG与LPS联合诱导的小鼠免疫性肝损伤具有一定的保护作用。 苏晓杰 张建 赵晶 张悦关键词:蜂胶黄酮 免疫性肝损伤 通过构建竞争性内源RNA网络识别潜在的椎间盘疾病相关circRNA 被引量:1 2018年 环状RNA(circRNA)可以通过竞争性结合微小RNA(miRNA),从而降低miRNA对其他靶标RNAs的抑制作用,进而间接调控其表达水平。这种竞争性关系代表了一种全新的基因调控机制,在癌症生理和发展中起重要作用。我们运用生物信息学的方法,对基因表达谱、circRNA探针谱重注释处理,并且结合MiRanda算法预测的miRNA靶点信息构建了竞争性内源RNA(ceRNA)网络,发现了五个与疾病相关的重要模块。其中通过hsa-miR-17-3p介导的CD74与hsa_circ_0001320,通过hsa-let-7a-2-3p介导的PAPSS2与hsa_circ_0000077两组ceRNA关系在椎间盘变性中起到重要的分子调控作用,从而成为潜在的临床标志物。进一步地,通过对靶基因的功能注释预测了这两个circRNA的生物学功能,其中明显与椎间盘炎症反应和骨发育相关,为临床基因检测预测疾病和药物靶点治疗提供依据并且也为椎间盘疾病的科学研究提供思路。 陈佳新 宋超 张玥欣 尹佳琦 李姗珊 李春权 张建关键词:椎间盘变性 105例分化型甲状腺癌的诊断和治疗 被引量:6 2010年 目的:探讨分化型甲状腺癌的诊断和治疗。方法:回顾分析2006年1月至2009年8月行手术治疗的105例分化型甲状腺癌病例。结果:全组均行手术治疗和内分泌治疗。本组病例中,甲状腺乳头状癌69例(65.71%),甲状腺滤泡状癌36例(34.29%),并发淋巴结转移19例(17.14%)。手术方式为患侧腺叶及峡部切除26例,患侧腺叶和峡部及对侧大部分切除70例,全甲状腺切除并双侧颈淋巴结清扫术8例。全组无手术及住院期间死亡。结论:分化型甲状腺癌应根据病理组织类型、肿瘤大小、年龄和颈部淋巴结转移选择不同手术方式,术后辅以内分泌治疗。 于国峰 李爱东 张建关键词:分化型甲状腺癌 颈淋巴结清扫术 外科手术 内分泌治疗 校园网上建立基于Web的流媒体服务器 2003年 本文主要介绍利用流媒体技术在校园网上建立Web站点并实现多媒体点播的功能,从而有效进行多媒体的网上传输.结合网络教学,实现影像资料这一重要教学资源的充分利用和共享。 张建 胡宪武 王晓霞关键词:校园网 WEB站点 流媒体技术 服务器 教学资源 校园网上建立基于Web的流媒体服务器 被引量:3 2003年 本文主要介绍利用流媒体技术在校园网上建立Web站点并实现多媒体点播的功能,从而有效进行多媒体的网上传输,结合网络教学,实现影像资料这一重要教学资源的充分利用和共享。 张建 胡宪武 王晓霞关键词:校园网 WEB 流媒体服务器 网络教学 教学资源 基于教育资源库的高校课程E-learning平台设计 被引量:1 2011年 如何有效利用现有高校教育资源一直是网络学习的重要研究方向,基于教育资源库的高校E-learning平台在实现了学习者通过互联网在任何时间,任何地点学习。平台设计开发了以学习者自学与教师辅助的学习方式。经实践证明是对现有高校授课模式有益补充。 李学沧 张建关键词:教育资源库 E-LEARNING 校园网 基于关联规则的脂肪肝与血脂异常的相关性分析 2014年 目的:发现不同年龄、性别的人群及不同类型的血脂异常与脂肪肝之间的关系,为早期防治高脂血症及脂肪肝提供科学依据.方法:选择体检数据中性别、年龄、甘油三酯TG、总胆固醇TC、高密度脂蛋白胆固醇HDL、低密度脂蛋白胆固醇LDL以及肝脏彩超结果作为源数据库,利用Apriori算法进行关联规则挖掘;最后对产生的规则进行解释.结果共形成34个强关联规则,这些强关联规则中蕴涵脂肪肝发病与性别、年龄及各类型血脂异常之间的关联关系.结论:本方法有利于发现隐藏在大量体检数据中有价值的信息,为医院体检中心提供了新的研究方法,具有一定的应用价值. 张建 刘跃娟 胡新梅关键词:脂肪肝 关联规则 高脂血症 APRIORI算法 抑郁症患者血清补体通路差异蛋白的研究 被引量:1 2018年 目的探究补体差异蛋白与抑郁症的潜在联系。方法选取2015年1月至2016年7月大庆市第三医院收治的22例抑郁症患者作为抑郁症组,并纳入20例大庆市健康市民作为健康组,提取血清。利用同位素相对标记与绝对定量(i TRAQ)技术和独创通路分析(IPA)通路富集,得到补体通路及其补体通路中的差异表达蛋白。用酶联免疫吸附测定法(ELISA)对差异表达蛋白进行验证。从基因表达数据库(GEO)中获取重度抑郁症患者和健康人全血基因表达芯片数据集GSE19738,各21例。采用R包对数据做预处理和差异性表达基因(DEGs)的筛选,应用ClueGO进行生物过程富集分析。结果用ELISA验证出5个蛋白在抑郁症组中的表达显著升高,分别是补体因子I(CFI)、补体成分(C)2、C4A、C5、C6。对芯片数据集GSE98793分析,得到442个DEGs,其中102个基因表达上调,340个基因表达下调。经过ClueGO富集分析得到差异表达基因在生物过程中,主要参与翻译蛋白靶向到膜,线粒体呼吸链复合体组装,凋亡细胞;在细胞组成中,差异基因主要参与核糖体亚基,线粒体内膜。在分子功能方面,主要参与细胞色素C氧化酶活性,RNA聚合酶1活性,蛋白质通道活性。结论抑郁症患者血清补体通路中5个差异表达蛋白(CFI、C2、C4A、C5和C6)的表达量显著增加。这些差异补体蛋白可能与抑郁症存在密切联系,为疾病的病因、诊断和药物研究提供重要线索。 石珊珊 于春月 王琪 张建 赵希武 王炎 魏太明关键词:抑郁症 生物信息学分析 生物标志物