王彬
- 作品数：108 被引量：371H指数：12
- 供职机构：福建省农业科学院更多>>
- 发文基金：福建省属公益类科研院所基本科研专项福建省自然科学基金国家大宗蔬菜产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 西葫芦过氧化物酶POD1基因的分离及表达分析被引量：1
- 2018年
- 通过西葫芦转录组测序,筛选得到1条功能注释为过氧化物酶(peroxidase,POD)的基因全长序列(c47620.graph_c0)。分析发现,该序列全长1 245bp,包含1个996bp的开放读码框(open reading frame,ORF),预测编码331个氨基酸,理论分子量(molecular weight,Mw)为35.70kDa,等电点(isoelectric point,pI)为5.40,编码的蛋白质与黄瓜、甜瓜和苦瓜等常见瓜果类蔬菜同源蛋白质的相似性在84%、84%和81%,显示其高度的保守性,基因命名为CpPOD1,GenBank登录号为MF988285。荧光定量PCR分析结果表明,CpPOD1基因具有组织表达特异性,在叶片中表达丰度最高,其次为根,在花中的表达最低。CpPOD1基因在低温弱光条件下,其表达量随时间增加而显著上调。初步推测,CpPOD1基因在西葫芦低温弱光胁迫下存在一定上调表达,猜测可能参与调控下游基因对低温弱光胁迫的响应有关。
- 黄丽芳刘建汀王彬温庆放朱海生林碧英
- 关键词：西葫芦过氧化物酶转录组测序荧光定量PCR
- 一种中国南瓜内参基因及其应用
- 本发明公开了一个用于中国南瓜内参基因的18S rRNA序列，在此基础上设计定量特异引物，中国南瓜18S rRNA基因在中国南瓜各生长发育阶段及各种非生物胁迫条件下均能稳定表达，适合在中国南瓜基因表达研究中作为内参基因。本...
- 朱海生温庆放王彬张前荣陈敏氡蓝新隆
- 文献传递
- 全基因组关联分析在蔬菜育种研究中的应用被引量：6
- 2021年
- 全基因组关联分析(GWAS)是一种高效地将表型和基因型进行关联并用于遗传作图和搜寻相关性状候选基因的方法,可同时对多个复杂性状进行关联分析,在蔬菜育种中应用日益广泛。本文对全基因组关联分析方法进行概述,对近年来全基因组关联分析在蔬菜生长发育过程相关性状、品质和产量性状以及抗性性状上的应用研究进行总结,并展望了其在蔬菜育种领域的应用前景。
- 曾美娟刘建汀卓玲玲陈敏氡叶新如王彬朱海生温庆放
- 关键词：蔬菜育种
- 植物激素对离体再生的调控及其在南瓜上的作用被引量：3
- 2018年
- 离体再生涉及植物激素信号应答,细胞分化、脱分化获得组织器官发生以及细胞再分裂形成特定的器官原基和分生组织等过程。激素调控是影响植物离体再生的重要因素。一些关键的启动子元件和转录因子在激素应答信号的检测和转导过程中起着重要作用,激素的控制对象通常是使细胞的形态和代谢发生转变的决定性基因,以转录因子和表观遗传因子为主,它们共同完成对全基因组基因表达的重排,实现细胞命运的转变。该文对植物离体再生中激素的诱导、应答模式和信号转导以及植物器官发生和体细胞胚胎发生过程激素的分子调控进行了综述,并概述了近年来国内外有关南瓜离体再生过程激素作用的研究,旨在为提高南瓜属作物的离体再生率提供新思路。
- 王彬陈敏氡林亮白昌辉朱海生温庆放
- 关键词：植物激素离体再生分子调控南瓜
- 黄秋葵实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选评价被引量：16
- 2021年
- 为筛选黄秋葵实时荧光定量PCR的稳定内参基因,本研究以绿白1号为试验材料,根据黄秋葵RNA-seq数据库,筛选并验证获得18SrRNA、ACT、EF-1α、TUA、TUB、GAPDH等6个内参基因ORF序列;以黄秋葵不同组织、不同发育时期果实、不同发育时期叶片和低温、高温、干旱胁迫处理的叶片为材料,利用实时荧光定量PCR技术分析测定基因表达量,并结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件评价6个内参基因的稳定性。结果表明,6个基因在不同组织、各发育阶段及不同胁迫下均有表达,但表达稳定性不尽相同,其中,EF-1α在黄秋葵果荚发育、高温胁迫下表达稳定性最好;18SrRNA在黄秋葵各组织、叶发育和干旱胁迫下表达稳定性最优;ACT在低温胁迫下表现最稳定。此外,在29个处理中,18SrRNA、EF-1α、ACT表达均较稳定,可以用于荧光定量表达分析。本研究结果为黄秋葵基因功能分析和调控机理研究提供了基础。
- 李永平叶新如王彬陈敏氡刘建汀朱海生温庆放
- 关键词：内参基因胁迫
- 丝瓜LcWRKY21转录因子基因的克隆与表达分析被引量：4
- 2017年
- 采用RT-PCR和Race技术从普通丝瓜果肉中分离到1条长达1 809 bp的cDNA,并对其进行序列分析。结果表明,该序列包含1个1 044 bp的开放读码框(open reading frame,ORF);预测编码347个氨基酸,理论分子量为38.61 kDa,等电点为9.46;编码蛋白质与甜瓜(Cucumis melo)和黄瓜(Cucumis sativus)同源蛋白的相似性达到84%以上,具有高度的保守性,基因命名为LcWRKY21。Wolf Psort预测其亚细胞定位于细胞核(nucleus)内。Motif Scan分析显示,LcWRKY21蛋白质的氨基酸序列274~340位、279~339位和325~337位分别为WRKY保守结构域、DNA结合结构域及锌指结构域序列。同源性分析表明,丝瓜LcWRKY21的锌指结构为C2H2型,属于第II类WRKY蛋白质家族。荧光定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction,q PCR)分析显示,LcWRKY21具有组织表达特异性,在普通丝瓜品种"福丝2号"果实中表达量最高,其次为根和茎,在叶片和花中的表达量较低。LcWRKY21基因在6个丝瓜品种中的表达水平具有品种差异性,在易褐变普通丝瓜品种"福丝2号"中的表达量最高,其次为普通丝瓜"福丝3号"和"福丝4号",在有棱丝瓜"福丝5号"、"福丝6号"和不易褐变的普通丝瓜品种"福丝1号"中的表达量较低。分析发现,LcWRKY21在"福丝2号"不同成熟时期中的表达量呈先上调后下调的趋势,在授粉后35 d的表达丰度达到最高。此外,LcWRKY21在普通丝瓜品种"福丝2号"的表达水平呈先上调后下调的趋势,鲜切后3 h时表达量达到最高,随后出现下调。初步推测,转录因子LcWRKY21基因在丝瓜果肉褐变过程中起着一定的调控作用。
- 刘建汀朱海生温庆放王彬张前荣陈敏氡林珲薛珠政
- 关键词：丝瓜转录因子基因克隆
- 不同草莓品种成熟期类胡萝卜素含量的研究
- 2015年
- 以‘福莓1号’、‘法兰地’、‘女峰’、‘红珍珠’和‘红实美’等5个草莓品种为材料,利用超高效液相色谱法(UPLC)研究不同草莓品种果实成熟期类胡萝卜素含量的变化。结果表明,5个草莓品种主要含叶黄素和β-胡萝卜素,不同品种间类胡萝卜素的含量存在差异,‘福莓1号’、‘法兰地’、‘女峰’中类胡萝卜素含量较高,而‘红珍珠’和‘红实美’较低;果实外部的类胡萝卜素含量显著高于中心部位;‘福莓1号’和‘法兰地’中类胡萝卜素的含量随果实成熟而逐渐下降,其中绿果期到白果期以及粉红果期到红果期含量下降最为明显。
- 陈敏氡朱海生王彬温庆放
- 关键词：草莓类胡萝卜素成熟期
- 龙眼果实发育实时荧光定量PCR内参基因的筛选
- 2021年
- 本研究以龙眼早熟品种‘石硖’、晚熟品种‘香脆’与‘立冬本’的4个不同发育阶段的果肉为试材,利用q-PCR技术对EF-1α-1、EF-1α-2、Actin1、Actin2及GAPDH2等5个候选内参基因的表达水平进行检测,并采用geNorm、NormFinder、BestKeeper和ReFinder软件综合分析评价其稳定性。结合应用验证,最终得出EF-1α-1、EF-1α-2和Actin2是龙眼果实发育q-PCR的适宜内参基因。
- 王淳璐王彬寇译丹胡文舜陈秀萍
- 关键词：龙眼实时荧光定量PCR内参基因稳定性
- 中国南瓜内参基因18S rRNA的克隆及其引物开发被引量：6
- 2017年
- 【目的】克隆获得中国南瓜18SrRNA,并设计合适的荧光定量PCR内参,为开展中国南瓜重要功能基因的表达模式和调控机制研究奠定基础。【方法】以中国南瓜‘密本’品种的基因组DNA为模板,通过PCR方法克隆中国南瓜18SrRNA基因序列,再利用Primer Premier软件设计荧光定量PCR引物,对该内参基因在中国南瓜不同组织、生长阶段及非生物胁迫条件下的表达稳定性进行检测。【结果】首次克隆得到中国南瓜18SrRNA基因序列,其长度为1 857bp,GenBank登录号为KM979454,该基因与西瓜、西葫芦等瓜类蔬菜18SrRNA基因同源性大都在90%以上;以中国南瓜内参基因18SrRNA核苷酸全长序列为基础设计1对荧光定量PCR引物,以中国南瓜果肉总RNA逆转录的cDNA第一链为模板进行PCR扩增,该引物扩增的片段大小为132bp,扩增效率高,特异性强;18SrRNA基因在中国南瓜不同组织、生长发育阶段及非生物胁迫条件下均能稳定表达。【结论】克隆获得中国南瓜18SrRNA基因,该基因适合在中国南瓜基因表达研究中作为内参基因。
- 朱海生王彬陈敏氡李永平张前荣刘建汀李大忠吴卫东温庆放
- 关键词：中国南瓜RRNA内参基因实时荧光定量PCR
- 冬瓜BhMAPK15基因的克隆及其非生物胁迫下的表达分析被引量：3
- 2020年
- 该文为探究MAPK15基因的结构和功能,根据冬瓜(Benincasa hispida(Thunb.)Cogn.)转录组高通量测序结果,采用RT-PCR方法从冬瓜中分离得到MAPK15基因的完整编码序列,命名为BhMAPK15。序列分析表明,BhMAPK15开放阅读框(ORF)长1704 bp,编码567个氨基酸。亚细胞定位预测表明,BhMAPK15可能定位于细胞核或细胞质。以NCBI数据库为基础,从数据库中获得模式植物水稻、拟南芥和其他不同物种间的MAPK15家族成员,分析该基因与这些成员的氨基酸序列、保守基序,并构建系统进化树。经系统进化树分析表明,BhMAPK15属于D组家族成员,与甜瓜、南瓜、黄瓜和苦瓜的相似性较高。氨基酸序列和保守基序结果表明,该基因家族成员保守性较高。实时荧光定量PCR分析表明,BhMAPK15在不同组织器官中均有表达,且非生物胁迫处理可以上调BhMAPK15的表达水平。上述研究结果表明,BhMAPK15基因可能在冬瓜响应非生物胁迫中发挥作用。
- 叶新如王彬陈敏氡刘建汀曾美娟朱海生温庆放
- 关键词：冬瓜基因克隆非生物胁迫
