丛培君
- 作品数:4 被引量:8H指数:2
- 供职机构:东北农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 鸡堆型艾美尔球虫3-1E抗原表位的生物信息学预测被引量:4
- 2015年
- 应用生物信息学分析和预测鸡堆型艾美尔球虫3-1E蛋白二级结构和抗原表位,为确定和筛选优势表位,研制安全、高效表位疫苗奠定基础。以克隆获得的鸡堆型艾美尔球虫3-1E蛋白氨基酸一级结构为基础,采用DNAStar软件和生物信息学在线分析程序Prot Param、SOSUI、IEDB、SYFPEITHI等预测3-1E蛋白理化性质和二级结构,并分析其序列跨膜区、可溶性、亲水性、可及性、柔韧性参数以及抗原指数,预测B细胞表位和T细胞表位的可能区域。3-1E蛋白由170个氨基酸组成,分子式C818H1257N213O272S3,分子质量18.5234 ku,理论等电点为4.25,半衰期为10 h;无跨膜区均为膜外区,是一种可溶性蛋白。其二级结构中α螺旋占31.76%,β转角为12.35%。B细胞表位预测区域:44-49、65-67、86-87、111-116;分值较高的T细胞表位区域:52-60、94-102、97-105、154-162、157-165。运用生物信息学方法确定3-1E存在多个抗原表位,对进一步研究3-1E的抗原性和研发优势表位疫苗具有重要意义。
- 李广兴丛培君潘龙马玲冯俪黄艺华任玉东黄小丹
- 关键词:抗原表位生物信息学
- 鸡堆型艾美尔球虫乳酸脱氢酶增强型核酸疫苗构建和免疫保护研究
- 本试验根据GeneBank上发表的堆型艾美尔球虫(Eimeria acervulina)乳酸脱氢酶(LDH)基因序列设计引物,成功克隆上海株堆型艾美尔球虫的部分LDH基因,大小为993bp。构建LDH的原核表达质粒,表达...
- 丛培君
- 关键词:鸡球虫鸡白细胞介素18免疫保护
- 文献传递
- 鸡堆型艾美耳球虫乳酸脱氢酶增强型核酸疫苗构建和免疫保护研究
- <正>本试验根据Gen Bank发表的堆型艾美耳球虫(Eimeiria acervulina)乳酸脱氢酶(LDH)基因序列设计引物,成功克隆上海株堆型艾美耳球虫的部分LDH基因,大小为993 bp。构建LDH的原核表达质...
- 黄艺华丛培君黄小丹杨贵君李广兴
- 文献传递
- 鸡堆型艾美耳球虫乳酸脱氢酶增强型核酸疫苗构建和免疫保护研究
- 本试验根据GenBank发表的堆型艾美耳球虫(Eimeiria acervulina)乳酸脱氢酶(LDH)基因序列设计引物,成功克隆上海株堆型艾美耳球虫的部分LDH基因,大小为993bp.构建LDH的原核表达质粒,表达大...
- 黄艺华丛培君黄小丹杨贵君李广兴
- 关键词:乳酸脱氢酶基因序列免疫保护
- 文献传递