- 胆道闭锁循环miRNA的高通量测序分析被引量：2
- 2016年
- 目的用高通量二代测序方法（next generation sequencing, NGS）分析胆道闭锁（biliary atresia，BA）患儿外周血中循环miRNA的表达特征，为寻找新的疾病相关无创诊断标志物提供依据。方法分别收集2013年1月至2014年5月到本中心就诊的29例BA（疾病组），10例婴儿肝炎综合征、5例Citrin基因缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症（NICCD）、5例胆总管囊肿（疾病对照组）和29例健康对照（正常对照组）血浆样本。选取前期收集的疾病组和正常对照组样本各9例用于高通量测序，将两组儿童分别按性别和年龄匹配分为3组，将血浆样本按上述分组进行组内等比例混合，提取血浆混合池中的总RNA，以Illumina HiSeq 2000测序仪分析混合样品中的全部miRNA序列。组间差异比较采用t检验，靶基因预测软件TargetScan, miRanda和PITA对差异miRNA的功能进行预测；并以实时荧光定量聚合酶链反应（reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction，RT-qPCR）对差异表达显著的miRNA进行验证。结果本研究成功构建BA患儿循环miRNA表达谱；BA患儿组与正常对照组中有188个循环miRNA表达存在差异（P〈0.05），包括87个上调、101个下调，56个为新发现的miRNA，其余皆为数据库中的已知miRNA。表达差异大于2倍的miRNA有146个，77个上调、69个下调。其中，表达量高且为各样本组恒定表达的miRNA有8个，均为已知miRNA，包括上调的has-miR-122-5p、-100-5p、-432-5p，下调的has-miR-140-3p、-10b-5p、-26a-5p、-126-3p、-744-5p；功能预测显示，这8个差异miRNA与肝胆发育、肝纤维化、细胞凋亡等相关；RT-qPCR验证结果表明，BA组血浆hsa-miR-122-5p、-100-5p表达量显著高于正常对照，而hsa-miR-140-3p、-10b-5p、-126-3p显著低于正常对照组（均P〈0.05），与测序结果一致。结论本研究结果全面展示了BA患儿外周血循环中miRNA的表达特征，其中一些�
- 彭小芳付捷温哲庞舒尹陈奕豪高坎坎辜少玲杨丽媛陈峥嵘刘海英
- 关键词：胆道闭锁微RNAS高通量测序标记物
- B族链球菌相关疫苗的研究进展被引量：8
- 2017年
- B族链球菌(GBS)属革兰阳性链球菌,是引起新生儿败血症和脑膜炎的重要致病菌。目前针对GBS采取的主要治疗措施是围生期抗菌药物预防(IAP),可以有效预防早发型GBS疾病(GBS-EOD),但晚发型GBS疾病(GBS-LOD)发生率依然较高。而且随着近年抗菌药物的大量使用,GBS耐药率逐渐增高。因此,GBS疫苗为预防新生儿GBS感染提供了新的方法和途径,特别是荚膜多糖-蛋白结合疫苗,目前已经完成Ⅰ、Ⅱ期临床试验,并且保护性抗体水平的研究已经成为近年来研究的热点。笔者拟对GBS相关疫苗的研究进展进行综述,旨在为GBS疫苗的进一步研制提供参考。
- 高坎坎钟华敏梁绮华刘海英
- 关键词：疫苗抗体
- 欧美国家围生期B族链球菌感染预防指南筛查策略与方法的解读被引量：34
- 2018年
- B族链球菌（GBS）是西方国家围生期新生儿侵袭感染的首要致病菌，可导致严重的肺炎、败血症及脑炎，引起新生儿死亡或残疾。母婴传播是其主要感染途径。20世纪90年代，欧美国家开始实施产前GBS筛查与产时抗生素干预（IAP），有效降低了新生儿GBS感染的发生。GBS感染对我国新生儿造成的危害近些年才逐渐被认识与重视，目前尚缺乏一致的预防措施。GBS筛查结果的准确与否决定临床预防的有效性，为增加对其了解，笔者特此就欧美国家GBS预防指南或共识所推荐的筛查策略、检测方法以及样本采集保存转运等做一解读。
- 高坎坎曾兰兰邓秋连钟华敏刘海英
- 关键词：B族链球菌围产期
- 女性泌尿生殖道支原体感染及其耐药率分析被引量：1
- 2022年
- 目的探讨女性泌尿生殖道支原体感染(GTMI)的临床特点与采集泌尿生殖道分泌物标本的抗菌药物耐药率。方法选择2014年8月至2020年12月,于广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心进行泌尿生殖道解脲脲原体(UU)和人型支原体(MH)培养的30952例疑似GTMI女性为研究对象。采用回顾性研究方法,根据疑似GTMI女性年龄,将其分为3组,适龄组(n=22863,年龄≥20~35岁),高龄组(n=7786,年龄≥35~60岁)与老龄组(n=303,年龄≥60岁)。采集疑似GTMI女性宫颈拭子分泌物标本,采用液体培养法进行UU和MH及其对抗菌药物耐药率检测。采用χ^(2)检验与线性趋势χ^(2)检验,对3组疑似GTMI女性的GTMI发生率、2014—2020年GTMI发生率逐年变化趋势及单纯UU与UU+MH患者宫颈拭子分泌物标本对抗菌药物耐药率,以及耐药率逐年变化趋势进行统计学比较。本研究遵循的程序符合2013年新修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求。结果①本研究30952例疑似GTMI女性中,GTMI总体发生率为39.2%(12130/30952,95%CI:38.7%~39.7%)。2014—2020年,疑似GTMI女性GTMI发生率总体变化呈逐年上升趋势(χ^(2)=191.19,P<0.001)。②12130例GTMI患者中,单纯UU患者占比为82.1%(9956/12130),显著高于UU+MH患者(15.9%,1934/12130),并且差异有统计学意义(χ^(2)=10614.62,P<0.001);单纯UU、UU+MH患者占比,均显著高于单纯MH患者(2.0%,240/12130),并且差异亦均有统计学意义(χ^(2)=15970.82、1449.91,P<0.001)。2014-2020年,单纯UU患者和单纯MH患者占比均呈逐年下降趋势(χ^(2)=124.29、17.46,P<0.001),而UU+MH患者占比,则呈逐年上升趋势(χ^(2)=176.09,P<0.001)。③适龄组疑似GTMI女性的GTMI发生率为41.6%(9505/22863),显著高于高龄组的32.3%(2516/7786)和老龄组的36.0%(109/303),并且差异均有统计学意义(χ^(2)=208.51、3.86,P<0.001、=0.049)。2014—2020年,适龄组和高龄组疑似GTMI女性的GTMI发生率均呈逐年上升趋势(χ^(2)=134.00、84.50,P<0
- 高坎坎钟华敏谢永强邓秋连高飞王洁琳龙燕
- 关键词：泌尿道感染支原体感染人型支原体耐药女(雌)性
- B族链球菌四种筛查方法的比较被引量：10
- 2020年
- 目的评估B族链球菌肉汤增菌培养法(Todd-Hewitt型,T-H)、直接培养法、液体显色培养法及核酸环介导恒温扩增法(LAMP)在孕晚期妇女筛查中的临床应用。方法回顾性研究。采集2016年10月至2018年4月在广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心产科门诊产检妊娠35~37周孕妇直肠阴道分泌物标本969份,采用双盲法,以T-H肉汤增菌培养法为参考方法,分3个研究阶段先后比较直接培养法、液体显色培养法及LAMP法的检验性能。以敏感度、特异度、符合率、阳性预测值、阴性预测值及尤登指数为评价指标,一致性用Kappa检验。结果增菌培养法共检测标本969份,阳性90份(9.3%)。以增菌培养法为参考,敏感度从高到低依次为LAMP法[100%(25/25)]、直接培养法[81.5%(22/27),95%CI:65.8%~97.1%]、液体显色培养法[71.1%(27/38),95%CI:55.9%~86.2%];特异度则依次为直接培养法[100%(282/282)]、液体显色培养法[98.1%(455/464),95%CI:96.8%~99.3%]、LAMP法[94.0%(125/133),95%CI:89.9%~98.1%];符合率依次为直接培养法[98.4%(22+282)/309]、液体显色培养法[96.0%(27+455)/502]、LAMP法[94.9%(25+125)/158]。而直接培养法(0.889)、LAMP法(0.832)与增菌培养法的一致性Kappa值均≥0.75,液体显色培养法则为0.708。直接培养法有18.5%(5/27)的漏检率,LAMP法漏检率为零、假阳性率为6.0%(8/133),液体显色培养法的漏检率、假阳性率分别为28.9%(11/38)、1.9%(9/464)。结论本研究所比较的几种GBS筛查方法中,仅LAMP法与增菌培养法在敏感度、特异度及符合率上均具较好的一致性,而其他两种方法存在一定的漏检。临床实验室可根据实际条件、技术力量选择使用,或参照欧美指南推荐的孕晚期增菌培养筛查与产时核酸检测相结合,以最大程度满足临床需求。
- 高坎坎关小珊邓秋连邓蕾朱素菲华夏高飞刘海英
- 关键词：妊娠末期无乳链球菌细菌学技术培养基核酸扩增技术
- B族链球菌基质辅助激光解析电离飞行时间质谱蛋白指纹特征肽峰验证研究被引量：1
- 2021年
- 目的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析验证既往发现的B族链球菌(GBS)序列分型(ST)、血清型蛋白指纹特征肽峰及D试验阳性相关肽峰,为临床GBS快速分型和有效诊疗提供依据。方法选取2015年1月至2017年12月全国多中心新生儿侵袭感染分离的237株GBS,均已知血清分型及多序列分型(MLST),运用Bruker微生物质谱仪采集菌体蛋白的肽指纹图谱,纸片扩散法分析菌株对红霉素和克林霉素耐药表型及红霉素诱导克林霉素的耐药发生率,用FlexAnalysis 3.0软件分析和验证特征肽峰。结果分子分型相关特征肽峰分析示,237株GBS均未见m/z 7 625肽峰,但48.3%ST17型菌株中(41/85)有m/z 7 620肽峰;所有ST1型菌株(2/2)均检出m/z 6 250肽峰且无m/z 6 888肽峰,即肽峰对(m/z 6 250+/6 888-),该峰对亦见于所有ST10菌株(31株)及ST2(2株)、ST4(1株)、ST156(1株)和ST579(1株)菌株。血清分型相关特征肽峰示,m/z 6 891在血清Ⅲ型(96.4%、133/138)和Ⅰb型(81.2%、56/69)常见,但在Ⅰa(90.5%、19/21)和Ⅴ型(87.5%、7/8)亦常见,故m/z 6 891肽峰无血清型特异性;m/z 7 620处小肽峰可见于29.7%Ⅲ型菌株(41/138),且均为ST17型,于其他血清型中偶见,包括Ⅴ型(12.5%、1/8)、Ⅰa型(9.5%、2/21)和Ⅰb(2.9%、2/69)。m/z 7620肽峰对Ⅲ/ST17型GBS判断的灵敏度和特异性分别可达48.2%和93.1%。D-试验阳性耐药相关特征峰,红霉素为中介或耐药,克林霉素敏感的菌株占33.76%(80/237),其中D-试验阳性占77.5%(62/80)。主要克隆亚型D试验阳性率从高到低依次为ST10/Ⅰb(100%、9/9)和ST12/Ⅰb或ST12/Ⅲ(100%、13/13)、ST17/Ⅲ(90%、27/30)、ST19/Ⅲ(40%、4/10)、ST23/Ⅰa(16.67%、1/6),ST10、ST12和ST17亚型D试验阳性率高达94.23%(49/52)。结论肽峰对(m/z 6 250+/6 888-)为ST1、ST10及少许罕见ST型GBS菌共有特征峰,m/z 6 891为不同血清型共有肽峰,而非Ⅲ/Ⅰb特异;m/z 7 620则为Ⅲ/ST17型菌特征肽峰,提示其可用于高毒力GBS的快�
- 陈光炼刘海英高坎坎关小珊钟华敏邓秋连谌亚星梁文怡蒋莹谢永强黄莲芬
- 关键词：B族链球菌
- ST17型B组链球菌MALDI-TOF MS快速鉴定模型的建立被引量：5
- 2020年
- 目的建立基于MALDI-TOF MS技术的临床微生物鉴定仪快速鉴定高毒力ST17亚型B组链球菌(GBS)的分类模型。方法回顾性研究。选取2015年至2018年全国多中心新生儿侵袭感染GBS菌235株,采用45株ST17菌和50株非ST17菌(20株ST19、15株ST12和15株ST10)主要ST亚型作为建模组,余下40株ST17、16株ST10、17株ST12和17株ST19为验证组,其他少见ST亚型菌50株视为模型分类观察组。以Bruker质谱仪采集菌株质谱图,通过ClinProTools 3.0软件用遗传算法(GA)进行建模、验证和差异肽峰筛选。结果ST17-GA法分类模型对建模菌株谱图识别率为99.4%,交叉验证值为96.9%。10个差异肽峰中,两个主要肽峰m/z 2956和m/z 5912权重均>1,而其他8个肽峰权重均<0.5。以90株主要ST亚型菌验证,仅1株ST17型菌被错判为非ST17,余下89株ST17与非ST17菌模型判断均正确,ST17型分类模型的诊断效能达98.9%,敏感度、特异度分别为97.5%、100%,阳性和阴性预测值分别为100%和98.0%。模型对其他50株少见ST型菌分类显示,21株(42.0%)被误判为ST17亚型。结论成功建立高毒力ST17型GBS菌的MALDI-TOF MS快速鉴定模型,并显示较好的诊断效能。
- 李姿娴刘海英高坎坎陈光炼关小珊钟华敏邓秋连谢永强黄莲芬
- 关键词：B组链球菌
- 广州地区中老年妇女血流感染中大肠杆菌分子流行特征及耐药表型与机制研究
- 2023年
- 目的研究广州地区中老年妇女血流感染患者病原菌分布特点及主要病原菌分子流行特征与耐药特征,为临床有效防治提供理论依据。方法以2017年1月至2022年12月该中心年龄≥45岁血培养阳性病例为研究对象,回顾性分析临床病原菌分布特点,主要病原菌多位点序列分型及耐药表型与机制。结果研究期间共收集血培养非重复标本409株,阳性标本31株(7.6%),2017至2022年阳性率分别为9.6%、7.5%、6.9%、8.6%、6.8%及7.8%。其中,革兰阴性菌18株(58.1%),革兰阳性菌13株(41.9%),未发现真菌。常见病原菌依次为大肠杆菌10株(32.3%)、肺炎克雷伯菌5株(16.1%)、金黄色葡萄球菌4株(12.9%)、铜绿假单胞菌2株(6.5%)、肺炎链球菌2株(6.5%)、B族链球菌2株(6.5%)。10株大肠杆菌型别分布依次为ST131(30.0%)、ST1193(20.0%)、ST405(20.0%)、ST493(10.0%)、ST69(10.0%)及ST3460(10.0%);所有菌株对亚胺培南、厄他培南等碳青霉烯类抗菌药物均完全敏感;第四代头孢菌素头孢吡肟的耐药率为10.0%,第二代头孢菌素头孢呋辛和第三代头孢菌素头孢曲松耐药率均为50.0%;左氧氟沙星的不敏感率高达90.0%(n=9),其耐药基因依次分别为qnrS(44.4%)、oqxA(22.2%)、oqxB(22.2%)及qnrD(11.1%)。结论2017-2022年间广州地区中老年妇女血流感最常见染病原菌为大肠杆菌,ST131是其最主要型别,首选碳青霉烯类抗菌药物,其对左氧氟沙星耐药机制主要由qnrS基因介导。
- 钟华敏谢永强高坎坎黄莲芬张白杜
- 关键词：中老年妇女血流感染大肠杆菌多位点序列分型耐药机制
- 妊娠晚期阴道菌群与妊娠结局的相关性研究被引量：4
- 2017年
- 目的探讨妊娠晚期阴道菌群与妊娠结局的相关性。方法对该院580例妊娠晚期孕妇行常规产前阴道菌群检查,按检查结果将其分为阴性组(382例)和阳性组(198例),并将阳性组患者根据有无自觉症状分为无症状组(112例)和有症状组(86例),对各组患者的妊娠结局进行比较分析。结果有症状组与无症状组、阴性组比较,胎膜早破、产褥期感染、新生儿感染及病理性黄疸发生率均较高,差异有统计学意义(P<0.05)。无症状组与阴性组比较,产褥期感染明显高于阴性组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论妊娠晚期孕妇阴道菌群失衡紊乱与不良妊娠结局密切相关,尤其是有症状的阴道菌群失衡紊乱孕妇。
- 黄镇华梁绮华高坎坎张素娟曾兰兰杨伟华
- 关键词：妊娠晚期阴道菌群
- 3个月龄以内婴儿败血症病原菌分布及抗菌药物耐药状况分析被引量：6
- 2018年
- 目的探讨月龄<3个月婴儿败血症的病原菌分布[排除凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)]及其对抗菌药物耐药状况。方法选择2012年1月1日至2016年12月31日,广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心收治的924例月龄<3个月的婴儿败血症患儿为研究对象。这924例患儿经血培养,共计分离出968株病原菌。回顾性分析924例月龄<3个月的婴儿败血症患儿的病原菌分布情况,早发型败血症(EOS)与晚发型败血症(LOS)患儿病原菌分布情况,以及常见革兰阴性杆菌、革兰阳性球菌对抗菌药物耐药情况。采用χ~2检验,对EOS和LOS患儿血培养分离出的大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、B族链球菌(GBS)、金黄色葡萄球菌、真菌所占比例进行比较。本研究遵循的程序符合广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心医学伦理委员会制定的伦理学标准,并得到该委员会审查批准。结果 (1)本研究924例月龄<3个月的婴儿败血症患儿血培养共计分离出968株病原菌,其中革兰阴性杆菌为593株(61.3%,593/968),以大肠埃希菌(21.4%,207/968),肺炎克雷伯菌(19.6%,190/968)为主;革兰阳性球菌为318株(32.9%,318/968),以GBS(11.5%,111/968),金黄色葡萄球菌(7.7%,75/968),粪肠球菌(4.1%,40/968)为主;真菌为52株(5.4%,52/968);革兰阴性球菌为3株(0.3%,3/968);革兰阳性杆菌为2株(0.2%,2/968)。(2)197例EOS患儿血培养共计分离出226株病原菌,常见病原菌前3位依次为大肠埃希菌(23.9%,54/226),GBS(17.7%,40/226)和肺炎克雷伯菌(15.9%,36/226)。727例LOS患儿血培养共计分离出742株病原菌,常见病原菌前3位依次为肺炎克雷伯菌(20.8%,154/742),大肠埃希菌(20.6%,153/742)和GBS(9.6%,71/742)。EOS患儿血培养分离出的GBS所占比例为17.7%(40/226),明显高于LOS患儿的9.6%(71/742),二者比较,差异有统计学意义(χ~2=11.280,P=0.001)。EOS患儿血培养分离出的金黄色葡萄球菌及真菌所占比例分别为4.0%(9/226)与2.7%(6/226),均分别低于
- 徐晓明付捷高坎坎朱素菲曾兰兰庄晓旭高秀蓉高飞龙燕刘海英
- 关键词：脓毒症病原菌抗菌药
