潘洋洋 作品数:21 被引量:50 H指数:5 供职机构: 山西农业大学动物科技学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山西省科技攻关计划项目 年山西省研究生优秀创新项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
广灵大尾羊FITM2基因扩增、序列及表达特性分析 2022年 本实验旨在克隆广灵大尾羊FITM2基因并进行序列分析,探究FITM2基因在不同组织中的表达规律,分析FITM2基因启动子序列及可能与之结合的转录因子,并揭示在脂肪细胞分化过程中的表达规律。PCR扩增并利用生物信息学软件分析FITM2基因CDS区,预测编码蛋白特性;预测FITM2基因启动子及可能与之结合的转录因子;采用qPCR检测FITM2基因和部分转录因子在不同组织或前体脂肪细胞分化过程中的表达模式。结果预测广灵大尾羊FITM2蛋白主要定位于内质网,有6个跨膜结构域,不存在信号肽,有26个磷酸化位点;二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角4种结构组成;预测出FITM2基因启动子上有3个核心区域;FITM2基因在脂肪组织中的表达量高于其他组织,在前体脂肪细胞分化过程中整体呈上升趋势;转录因子STAT5A、YY1和USF2在分化过程中可能正调控FITM2。本研究为进一步探究广灵大尾羊FITM2基因在脂肪沉积过程中的作用提供理论依据。 秦朋云 乔利英 刘建华 潘洋洋 侯文欣 车雨彤 赵祥 刘文忠关键词:生物信息学 转录因子 绵羊miR-191靶基因预测、功能分析及在脂肪组织中的表达 miR-191是一种具有脂肪代谢调控功能的microRNA(miRNA).本研究利用多种生物信息学在线软件,预测绵羊miR-191(oar-miR-191)的靶基因,并对靶基因进行GO注释;利用实时荧光定量PCR技术,对... 潘洋洋 景炅婕 乔利英 刘建华 刘文忠关键词:荧光定量PCR 绵羊脂肪组织AGPAT2基因启动子区DNA甲基化及其表达研究 2023年 为研究绵羊脂肪沉积过程与AGPAT2基因启动子区DNA甲基化水平及其表达的相关性,本研究以尾型不同的湖羊与广灵大尾羊的尾部脂肪组织为实验材料,通过生物信息学软件和亚硫酸氢盐测序(Bisulfite Genomic Sequencing PCR,BSP)分析AGPAT2启动子区序列的CpG岛和甲基化水平;以qPCR技术检测绵羊尾部脂肪组织中AGPAT2基因的表达水平。结果表明,AGPAT2启动子区存在CpG岛;在尾部脂肪组织中,湖羊与广灵大尾羊的AGPAT2基因启动子区的目的片段甲基化率分别为90.5%和76.2%;湖羊AGPAT2基因启动子区中的目的序列发生甲基化位点高于广灵大尾羊;广灵大尾羊AGPAT2mRNA的相对表达量在绵羊尾部脂肪组织中极显著高于湖羊;对AGPAT2启动子区的甲基化水平与其表达水平进行Pearson相关系数分析可知,二者呈中度负相关(r=-0.364,P=0.478)。综上所述,本研究揭示AGPAT2基因在转录水平的表达受启动子区甲基化的负调控,从而推测AGPAT2基因的DNA甲基化水平与绵羊的脂肪沉积过程具有一定的相关性。 胡靖玮 杨凯捷 乔利英 陈思佳 刘建华 潘洋洋 刘文忠关键词:DNA甲基化 脂肪沉积 miR-142和miR-144靶向FoxO1基因调节绵羊前体脂肪细胞分化的研究 被引量:7 2018年 旨在预测并验证调节FoxO1基因表达的关键miRNAs及其调节脂肪分化的机制。本研究利用4个在线软件预测与FoxO1基因具有潜在靶标关系的miRNAs。用双荧光素酶报告系统检测荧光活性。用荧光定量PCR、Western blotting和油红O染色,分别在mRNA和蛋白水平上检测miRNA对FoxO1表达的影响以及对绵羊前体脂肪细胞分化的调节作用。结果表明,miR-142和miR-144与FoxO1具有靶标关系。过表达miR-142和miR-144显著抑制了双荧光素酶报告载体的荧光活性,下调了FoxO1mRNA(P<0.01)及其编码蛋白的表达(P<0.05)。miR-142和miR-144均可促进绵羊前体脂肪细胞分化,加快脂滴形成。由此证明,miR-142和miR-144靶向负调节FoxO1的表达,进而通过FoxO1对PPARγ的负调节促进绵羊前体脂肪细胞的分化。 赵艳艳 乔利英 景炅婕 潘洋洋 任端阳 王书芳 吕宣增 刘文忠关键词:FOXO1 脂肪细胞分化 miR-132-3p靶向UCP2调节绵羊前体脂肪细胞分化的研究 被引量:6 2017年 旨在研究miR-132-3p对绵羊前体脂肪细胞中UCP2基因的表达调控机制。本研究以绵羊皮下脂肪细胞为研究对象,检测miR-132-3p与UCP2在绵羊前体脂肪细胞中的作用机制;利用生物信息学软件预测miR-132-3p与UCP2的结合位点,并通过双荧光素酶报告试验验证miR-132-3p与UCP2的靶标关系;在绵羊前体脂肪细胞中过表达miR-132-3p,用RT-qPCR、Western blotting技术检测过表达后UCP2mRNA和蛋白的表达水平;最后,采用RT-qPCR检测绵羊前体脂肪细胞分化过程中UCP2和miR-132-3p的表达。结果表明,miR-132-3p在UCP2 3′-UTR上存在结合位点,并显著下调UCP2 3′-UTR重组双荧光质粒的相对荧光活性(P<0.05);过表达miR-132-3p显著下调UCP2mRNA的表达(P<0.05),且明显降低UCP2蛋白的表达量;绵羊前体脂肪细胞分化中期miR-132-3p与UCP2的表达存在负相关关系。综上表明,miR-132-3p通过特异性结合UCP2 3′-UTR抑制UCP2在mRNA和蛋白水平的表达,在一定程度上促进绵羊前体脂肪细胞的分化。 师涛 闫晓茹 潘洋洋 景炅婕 乔利英 郭云利 申彩云 张富权 刘文忠关键词:绵羊 前体脂肪细胞 细胞分化 UCP2 脂肪分化相关信号通路及microRNA调节研究进展 被引量:5 2015年 畜禽体内脂肪含量的多少决定了其肉质的好坏,而脂肪分化则是一个由许多因子调控的复杂生物学过程。了解脂肪分化相关的信号通路及其miRNAs的调节作用,可以在一定程度上揭示脂肪分化的分子调控机制。本文在对6个重要的调控脂肪细胞分化的信号通路进行介绍的基础上,分别对8个促进脂肪细胞分化和8个抑制脂肪细胞分化的miRNAs的生物学功能和作用机制进行了探讨,总结了其靶基因在脂肪形成中的作用。有关miRNAs及其靶基因的研究为畜禽肉质性状的遗传改良提供了理论依据。 贾夏丽 潘洋洋 乔利英 郭云雁 胡子乔 张方 李宝钧 刘文忠关键词:脂肪细胞 成脂分化 信号通路 MICRORNA 靶基因 miR-194-5p靶向调控BCKDHA基因的表达 被引量:3 2017年 旨在预测并验证调控支链氨基酸分解代谢的限速酶支链α-酮酸脱氢酶复合体(Branched-chainα-ketoacid dehydrogenase complex,BCKDH)中α亚基即BCKDHA基因表达的关键miRNA。本研究利用3个在线软件预测与该基因具有靶标关系的miRNAs。利用荧光定量PCR检测小鼠3T3-L1前脂肪细胞分化过程中和超表达后关键miRNA与BCKDHA的表达量。结果表明,miR-194-5p是调控BCKDHA表达的一个关键miRNA,其种子序列与BCKDHA3′UTR第190~196位碱基完全互补。MiR-194-5p的表达随分化时间呈下降趋势,而BCKDHA mRNA则呈上升趋势。双荧光素酶报告结果也显示二者具有靶标关系,miR-194-5p下调BCKDHA的表达。超表达miR-194-5p后,BCKDHA的表达显著下调(P<0.05)。由此证明,miR-194-5p通过与BCKDHA基因3′UTR结合抑制其表达。 张莹姣 乔利英 景炅婕 潘洋洋 马元 郭云利 魏琼 刘文忠关键词:3T3-L1 绵羊ANGPTL4基因的多态性及其与尾型和屠宰性状的关联研究 被引量:3 2016年 血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)可以通过不同方式调节脂肪代谢。本研究利用PCR-SSCP技术检测绵羊ANGPTL4基因5(非编码区的单核苷酸多态性(SNPs)以揭示品种间的遗传差异。研究SNP基因型与性状间的关联以估计该基因的遗传变异对绵羊尾型和屠宰性状的效应。结果表明:供试个体为2个不同脂尾型绵羊品种,即广灵大尾羊和小尾寒羊6个年龄段共96个个体(每品种公、母各半)。设计10对引物,对长度为2436 bp的非编码序列进行扩增。在该序列上检测到8个SNPs,其中,-1691 C>G和-577 T>G 2个颠换的等位基因频率存在显著的品种间差异。-1691 C>G和-1625 G>A均以正向超显性遗传方式影响2个品种的尾长、宰前体重和胴体重,以负向超显性效应方式影响广灵大尾羊的屠宰率。有关结果为这两个突变的实际应用提供了科学依据。 张静 景炅婕 张方 胡子乔 潘洋洋 任端阳 马元 张莹姣 乔利英 刘文忠关键词:绵羊 单核苷酸多态性 基因型 SIRT1基因在绵羊不同组织器官中的差异性表达研究 被引量:3 2015年 SIRT1(silent mating type information regulation 2homolog1)是一种具有NAD+依赖性去乙酰化酶活性的转录调节因子,参与能量代谢的调节。利用实时荧光定量PCR技术,对10月龄山西肉用绵羊母本品系去势公羊内脏(肝、肾、脾、肺、心)、肌肉(背最长肌)和脂肪(大网膜、小网膜、肠系膜、腹膜后、皮下)等11种器官或组织中SIRT1基因mRNA的表达量进行检测,以探讨SIRT1基因的差异性表达规律。结果表明,绵羊SIRT1基因在所检测的器官或组织中均有表达,且差异极显著(P<0.001)。主要表现在脾脏、肝脏和肾脏中的表达显著高于心脏和肺脏中的表达;深层脂肪组织中的表达高于浅层的皮下脂肪;在背最长肌中也有较高表达。这些差异与绵羊SIRT1基因调节脂质代谢及糖异生有关。有关结果为研究SIRT1基因的功能奠定了科学依据。 潘洋洋 景炅婕 乔利英 贾夏丽 张静 张方 胡子乔 刘文忠关键词:绵羊 SIRT1 实时定量PCR 组织器官 绵羊及相关物种去乙酰化酶1的理化性质和蛋白结构预测 被引量:2 2015年 为深入研究SIRT1基因及其编码蛋白的结构和功能,特别是在各信号通路中的作用,本文基于NCBI发布的包括绵羊在内的9个物种的SIRT1基因的核苷酸和蛋白质序列,采用生物信息学方法分析SIRT1蛋白的理化性质和蛋白结构,预测了绵羊SIRT1蛋白的结构和翻译后修饰位点。结果表明,不同物种SIRT1蛋白的理化性质基本一致。绵羊SIRT1是一种接近于中性的亲水性脂溶蛋白,预测其有40个潜在的O-糖基化位点、2个N-糖基化位点、33个磷酸化位点、18个乙酰化修饰位点、11个泛素化修饰位点和3个类泛素化修饰位点。这些结果为进一步研究SIRT1的功能和表达调控奠定了科学依据。 景炅婕 张静 贾夏丽 梁琛 刘建华 潘洋洋 张方 胡子乔 任端阳 刘文忠关键词:绵羊 生物信息学分析 蛋白结构