张俊艳 作品数:27 被引量:25 H指数:3 供职机构: 广州医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 广州市科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 化学工程 农业科学 轻工技术与工程 更多>>
全国过敏人群信息化综合服务平台及数据库的设计与构建 2023年 过敏性疾病被世界卫生组织列为21世纪需要重点研究和防治的三大疾病之一。其发病率高,在我国影响人群广泛。然而我国过敏人群的科普、患者教育、患者治疗跟进以及防诊治工作的综合水平都有待提高。依托我国互联网技术的发展优势,设想并构建一个集过敏性疾病多层次科普、风险预测、自我筛查与诊断、线上线下就诊指引、患者管理、资料入库、流行病学调查及回顾分析、多中心临床试验开展、患者宣教、治疗依从性提升、预防产品开发与功效认证、疑难罕见病跨区域会诊、成果推广等多功能于一体的综合服务平台和数据库,并以此平台和数据库作为重要工具,向广大过敏人群提供更好服务的同时,为我国在过敏性疾病防诊治新方法的研发中提供便利,助力于我国变态反应事业的发展。 张俊艳 赵思捷 陈汝治 黄于艺关键词:过敏性疾病 数据库 综合服务平台 乳胶过敏原Hev b1二级结构及抗原表位的预测 被引量:1 2013年 目的利用生物信息学软件预测乳过敏原Hevb1的二级结构及B细胞和T细胞的抗原表位。方法在Uniprot数据库中获得Heyb1蛋白序列,通过GOR4在线软件预测其二级结构;采用DNAStar的Protean模块预测Hevb1蛋白的亲水性、表面可及性、柔韧性及抗原指数,从而综合预测其B细胞表位;应用NetMHCⅡ2.2在线服务器预测Hevb1蛋白的T细胞表位。结果乳胶过敏原Heyb1的B细胞优势抗原表位为1—14,40一46;T细胞优势抗原表位为56—64,76—84,97—116。结论通过生物信息学分析获得乳胶过敏原Hevb1的B细胞和T细胞优势抗原表位,可为乳胶过敏原Hevb1的抗体设计、过敏原性改浩等研奔打下略宴的基础. 何颖 刘雪婷 王珊 张俊艳 邹泽红关键词:HEY 抗原表位 联合应用主要代表性过敏原及泛过敏原诊断螨虫过敏的初步研究 张可俊 张俊艳 赖荷 陈惠芳 邹泽红 许晨霞 巫娟 李林梅 伍秋容 刘永平 于陆 陶爱林药物过敏的实验室检测及其应用价值 张俊艳 何颖 陈惠芳 邹泽红 赖荷 陶爱林寡细胞哮喘的特征基因挖掘及其对哮喘治疗靶点的应用前景评估 2022年 目的 应用生物信息学方法对寡细胞型哮喘患者的基因表达谱芯片进行分析,以研究寡细胞型哮喘的病理机制,进而寻找寡细胞型哮喘的精准治疗靶标。方法 从GEO平台库获取GSE143303芯片数据集,在对数据集进行整理与初步分析后,对寡细胞型哮喘和健康对照的表达谱进行基因表达分析。利用R语言进行功能基因集富集分析,对基因进行功能聚类。利用基因集互作信息,构建与表型正负关联度最强的基因互作网络,并计算不同网络间的相关性,结合差异基因分析,筛选出关键基因和调控网络。结果 GSE143303数据集包含47例成人支气管活检样本,其中有16例寡细胞型哮喘和13例健康对照。筛选出显著意义的通路基因集115个,其中正相关的通路基因集有37个,负相关的通路基因集有78个。与寡细胞型哮喘强负相关的通路基因网络之间,存在基因纠缠。对互作网络进行基因共集分析,结果发现网络交叉主要出现在HLA相关基因。结合差异基因分析,发现网络交联基因TNFRSF13B、HLA-DQB1、HLA-DRB5在正常对照组相比存在表达差异,其中TNFRSF13B有显著差异。结论 TNFRSF13B、HLA-DQB1、HLA-DRB5及由此组成的基因调控网络可能是寡细胞型哮喘的关键基因与主要相关调控网络,研究结果为寻找寡细胞型哮喘的精准治疗靶标和病理机制提供了研究方向。 黄于艺 张俊艳关键词:调控网络 生物信息学 基于公共数据库的“医学科研设计”全流程沉浸式案例教学探讨 2024年 为培养医学生创新思维及科研能力,医学院校大多开设了“医学科研设计”等课程。然而,该课程现有教学方式存在内容联结不紧密,学生课堂参与度不高,对学生实践能力提升不够等问题。为此,笔者提出基于公共数据库的全流程沉浸式案例教学方式。以Dryad等公共数据库的真实临床研究案例为基础,深度剖析研究案例,科学有机地设计和整合授课内容,涵盖文献检索、研究背景与综述撰写、研究设计与方案制定、数据分析与结果展示、论文撰写与发表,以及成果推广与转化等内容。案例教学法贯穿该课程整个教学过程,通过“亲身经历”的形式,激发学生的学习兴趣,让学生通过线上线下课堂“参与”科研,以实现科研理论与实践能力双提升的目标。 张俊艳 黄于艺关键词:医学科研设计 案例式教学 课程设计 粉尘螨过敏原蛋白Der f 3的表达纯化及活性鉴定 2016年 目的:制备有生物学活性的粉尘螨过敏原蛋白Der f 3。方法:构建带有StrepⅡ标签的原核表达体系Rosetta-p ET44a-Der f 3高效表达目的蛋白,分别用梯度透析法和亲和层析法对其进行复性纯化,通过Western Blot试验验证目的蛋白的有效表达,最后用丝氨酸蛋白酶特异荧光底物及粉尘螨过敏病人血清分别鉴定目的蛋白的酶学活性及免疫学活性。结果:利用原核表达体系成功表达了目的蛋白Der f 3,Western Blot结果显示有目的条带出现。复性纯化后的过敏原蛋白Der f 3能够成功降解丝氨酸蛋白酶特异性荧光底物,ELISA试验结果显示该蛋白血清特异性Ig E在4级以上粉尘螨过敏病人中阳性率为4%。结论:成功获得有酶学活性及免疫学活性的粉尘螨过敏原蛋白Der f 3,为生产高质量的诊断试剂和疫苗奠定了基础。 巫娟 张俊艳 何颖 陈惠芳 李碧舟 关志澳 陶爱林关键词:F 酶学活性 免疫学活性 ELISA检测广东地区粉尘螨过敏人群中Der f2和Der f3特异性IgE的阳性率 目的:调查广东地区粉尘螨过敏人群对粉尘螨过敏原组分2、3的过敏情况.方法:筛选就诊于广州医科大学附属第二医院患者中经UniCAP检测粉尘螨过敏的病人血清,其中1-3级和4-6级血清各87例,利用重组表达粉尘螨过敏原Der... 巫娟 张俊艳 赖荷 何颖 陈惠芳 邹泽红 陶爱林人IgE受体α链的克隆及真核表达载体的构建 何颖 张俊艳 张妙莲 邹泽红 陶爱林甲型H1N1病毒HA、NA氨基酸序列比较及抗原性表位预测 被引量:1 2013年 目的:比较新型甲型H1N1流感病毒分离株HA、NA氨基酸序列之间的差异,分析HA、NA蛋白可能的抗原性细胞表位。方法:从GenBank中选取28株世界各地的新型甲型H1N1流感病毒分离株并下载各株HA、NA的氨基酸序列;使用ClustalX和MEGA2.0软件对氨基酸序列的进行进化树分析;用Protean软件预测HA、NA蛋白的B细胞表位;用NetMHCⅡ2.2预测T细胞抗原表位。结果:世界范围的毒株之间氨基酸序列相对保守,HA及NA均只有少数位点的变异,HA蛋白氨基酸序列之间较NA蛋白氨基酸序列之间变异较大;预测HA蛋白具有8个B细胞表位和10个T细胞表位;NA蛋白有12个B细胞表位和7个T细胞表位。结论:HA、NA蛋白的少数区域抗原性相对比较稳定,可以作为检测以及疫苗研究的靶区域。 邹泽红 张俊艳 刘兆宇 刘昌文 李胜涛 何颖关键词:H1N1流感病毒 血凝素 神经氨酸酶