孙晖
- 作品数：2 被引量：34H指数：1
- 供职机构：传染病预防控制国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 鉴定五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的多重PCR方法被引量：33
- 2011年
- 目的建立一种快速鉴定和鉴别五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的多重PCR方法。方法利用五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的毒力基因stx1、stx2、eaeA、lt、stIb、aggR、ipaH及16SrRNA基因rrs,建立8重PCR反应体系,并对PCR引物、反应体系和循环条件进行优化。结果 8对PCR引物均能特异地扩增相应的基因。对本实验室87株大肠埃希菌及志贺菌的检测结果与先前应用单重PCR的鉴定结果完全一致。结论采用内对照基因和毒力基因建立的多重PCR方法既能在一个反应体系中鉴定和区分五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌,又能评价PCR体系的反应效率,为五类致泻性大肠埃希菌的快速鉴定和鉴别提供了一种有效检测手段。
- 赵爱兰熊衍文白雪梅张少敏王艳孙晖叶长芸
- 关键词：致泻性大肠埃希菌多重PCR方法
- 致泻性大肠杆菌和福氏2a志贺氏菌染色体上毒力岛和基因组岛插入相关的tRNA位点的研究被引量：1
- 2007年
- 目的探讨毒力岛及外源DNA片段的插入与异常tRNA位点的相关性。方法采用PCR和杂交的方法,从异常tRNA位点寻找致泻性大肠杆菌和志贺氏菌的福氏2a菌基因组中可能的毒力岛或基因组岛。以Escherichia coli K12MG1655序列中的86个tRNA位点的45个区域设计引物,对与K12亲缘较近的几类菌株的相关tRNA及其临近序列的完整性进行了初筛,对发现异常者进一步从其内部补充引物扩增证实,并联合杂交方法进行验证,以已知的E.coli O157∶H7EDL933和S.flexneri2a301的序列来对比PCR结果。结果菌株EDL933,S.flexneri2a301,EPEC2348/69,ETEC10407,EIEC8401,E.coliO157∶H78823/64,EAEC O42,E.coli O25F171中异常tRNA位点的个数分别是14,18,15,14,15,11,21,19。通过序列比对EDL933中8个tRNA位点有O岛插入,S.flexneri2a301中有6个插入了毒力岛,其余的位点均有外源片段插入或原有片段缺失。结论毒力岛及外源DNA片段的插入与异常tRNA位点密切相关。
- 王蕾叶长芸赵爱兰孙晖徐建国
- 关键词：TRNAPCR
