郭云涛
- 作品数：5 被引量：15H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
- 发文基金：转基因生物新品种培育专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
- 牛miR-320a的靶基因预测及生物信息学分析被引量：3
- 2015年
- 旨在对bta-miR-320a的靶基因进行生物信息学预测和分析,探索其影响牛脂肪沉积的作用机制。本试验利用Promoter Scan、TargetScan、DAVID、Cytoscape等生物信息学软件和miRBase、Ensembl、NCBI、miRWalk等数据库对bta-miR-320a进行转录因子结合位点预测、保守性分析、靶基因预测、基因本体论富集分析和信号通路富集分析。结果表明,miR-320(a)在各物种间非常保守,bta-miR-320a启动子区域有SP1等多个转录因子结合位点,获得的84个靶基因主要参与负调控细胞分化、细胞周期、负调控生长等多个生物学过程,涉及p53、细胞周期和MAPK等信号转导通路。由此推测,bta-miR-320a受到SP1等多种转录因子调控,它可能通过对MAPK、细胞周期和p53信号通路中靶基因TP53、MAPK1等的抑制作用调控牛脂肪细胞分化,进而影响了牛的脂肪沉积。
- 郭云涛张秀秀苗向阳
- 关键词：靶基因生物信息学
- 调控褐色脂肪细胞分化的microRNAs被引量：2
- 2015年
- MicroRNA(miRNA)是近年来在真核生物中发现的一类长约22nt的内源性非编码RNA,在动物中主要通过抑制靶m RNA翻译,在转录后水平调控基因表达。动物体内有两种类型的脂肪组织:褐色和白色脂肪,白色脂肪以甘油三脂形式贮存能量,而褐色脂肪利用甘油三酯产生能量。褐色脂肪因其对肥胖的拮抗作用而对研究肥胖等代谢疾病具有重要意义,大量研究表明mi RNA在褐色脂肪细胞分化中扮演着重要角色,其自身也受到多种转录因子和环境因子调控,这个复杂的调控网络维持了体内脂肪组织稳态。文章主要综述了mi RNA在褐色脂肪细胞分化中的最新研究进展,以期为利用mi RNA进行肥胖、糖尿病等相关疾病及其并发症的治疗提供新思路。
- 郭云涛苗向阳
- 关键词：MICRORNA分化
- 脂肪组织中的miRNAs研究进展被引量：1
- 2016年
- miRNA是近年来发现的一类长约22 nt的内源性非编码RNA,在动物中主要通过抑制靶mRNA翻译,在转录后水平调控基因表达。大量研究表明脂肪组织中的miRNAs参与了脂肪细胞分化、脂代谢等多种生物过程调控,其自身也受到转录因子、脂肪细胞因子和环境因子等调控,这些复杂的相互作用关系构成了脂肪组织中miRNA的调控网络,循环miRNA的发现为这个网络加入了新元素。对肥胖等代谢疾病的研究,应该从这个复杂的动态网络中寻找答案。文中综述了脂肪组织中miRNA的最新研究进展,以期为利用miRNA进行肥胖等相关代谢失调疾病的治疗提供新思路。
- 郭云涛张秀秀黄万龙苗向阳
- 关键词：MIRNA脂肪分化脂代谢
- 靶向MAPK信号通路调控脂肪细胞分化的microRNAs被引量：8
- 2016年
- 脂肪细胞分化是一个多能间充质干细胞(MSCs)逐渐向成熟脂肪细胞分化的复杂过程,该过程受很多转录因子、激素以及信号通路相关分子的严格调控。体内外的试验表明,microRNAs(miRNAs)也参与了脂肪细胞分化的调节,且可以靶向转录因子和信号通路中的关键分子发挥作用。丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路是真核细胞将胞外信号转导至胞内引起细胞反应的一类重要信号系统,研究证明,miRNAs可以靶向MAPK信号通路中的某些基因,影响该通路的信号转导,参与脂肪细胞分化的调控。因此本文总结了近几年有关miRNA改变MAPK信号转导,实现调控脂肪细胞分化功能的研究,以期为深入了解脂肪细胞分化的机制,为治疗脂肪型疾病提供新的思路。
- 张秀秀郭云涛黄万龙李嫒苗向阳
- 关键词：MAPK信号通路靶基因脂肪细胞分化
- ssc-miR-486靶基因预测及生物信息学分析被引量：1
- 2016年
- 通过对ssc-miR-486进行靶基因预测及生物信息学分析,以探索其影响猪脂肪沉积的作用机制。首先利用实时荧光定量PCR技术对脂肪沉积能力相差较大的莱芜猪和大白猪皮下脂肪组织中ssc-miR-486表达情况进行比较研究,然后利用miRBase、Ensembl、NCBI等数据库及miRanda、PITA、RNAhybrid、Cytoscape、JASPAR、Promoter Scan等软件对ssc-miR-486进行生物信息学分析,包括保守性分析、转录因子结合位点预测、靶基因预测、GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果表明,ssc-miR-486在脂肪沉积能力较强的莱芜猪皮下脂肪组织中发生显著上调。生物信息学分析结果发现,miR-486在各物种间非常保守,ssc-miR-486启动子区域有SREBP1、SREBP2等多个转录因子结合位点,获得的229个靶基因显著富集于脂质代谢、脂质生物合成、细胞代谢等生物学过程及类固醇生物合成、磷脂肌醇代谢、PPAR等信号转导通路中。结果表明,ssc-miR-486参与了猪脂肪沉积或脂肪代谢的调控,为今后研究脂肪沉积提供基础理论支撑。
- 张秀秀黄万龙郭云涛苗向阳
- 关键词：生物信息学脂肪沉积
