夏昕
- 作品数:6 被引量:7H指数:2
- 供职机构:中山大学孙逸仙纪念医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广东省自然科学基金广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学更多>>
- 基于层次分析法的大学图书馆电子资源采购决策评估模型研究
- 随着网络技术和数据挖掘技术的不断进步,大学图书馆购买各种电子资源已经成为图书馆采购工作的重要组成部分。如何在种类繁多、价格不一的电子资源中进行合理的选择,如何对电子资源的采购进行规范化决策,已经成为在信息资源数字化时代图...
- 夏昕
- 关键词:电子资源层次分析法
- 地塞米松调控牙本质基质蛋白1在成骨细胞中的表达
- 2017年
- 目的研究地塞米松诱导成骨细胞(MC3T3-E1)中牙本质基质蛋白1(DMP1)的表达变化情况。方法利用实时荧光定量PCR反应技术检测不同浓度的地塞米松处理MC3T3-E1细胞后不同时间段细胞中DMP1基因表达变化,通过单因素方差分析法在每个浓度和48 h下对实验组和对照组进行表达差异比较。利用蛋白印迹法(Western blot)检测10^(-6)g/L的地塞米松处理MC3T3-E1细胞后不同时间段的细胞中DMP1蛋白表达变化。结果不同浓度地塞米松分别处理MC3T3-E1成骨细胞DMP1基因表达水平在24、48和72 h均较对照组0 h显著降低(P<0.05),48 h组较24和72 h组显著降低(P<0.05);48 h下10^(-6)g/L组较10^(-7)g/L组显著降低(P<0.05),而与10^(-5)组相比较没有差异(P>0.05)。10^(-6)g/L地塞米松处理MC3T3-E1成骨细胞后,不同时间点的DMP1蛋白表达量均较0 h降低。结论地塞米松抑制成骨细胞MC3T3-E1中DMP1的表达,提示地塞米松可能是通过调控DMP1的表达而影响成骨细胞的骨形成。
- 夏昕阮毅陈绛媛李博亚孔祥波伍虹
- 关键词:地塞米松基因表达调控牙本质基质蛋白1
- 牙龈卟啉单胞菌外膜囊泡差异表达mRNA的生物信息学分析
- 2021年
- 目的探讨牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)W83与ATCC33277外膜囊泡mRNA表达谱的差异。方法超速离心法分离W83和ATCC33277来源的外膜囊泡,进行粒径检测、电镜及Western blot鉴定;高通量测序检测W83和ATCC33277外膜囊泡mRNA表达谱,筛选差异表达的mRNA,进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果牙龈卟啉单胞菌W83和ATCC33277分离的外膜囊泡符合囊泡特征;W83外膜囊泡中鉴定出1629个mRNA,ATCC33277外膜囊泡中鉴定出1505个mRNA,差异表达的mRNA共594个。差异具有统计学意义的mRNA参与的途径包括生物膜形成-霍乱弧菌(P=0.011)、核糖体(P=0.015)和细菌双组分调节系统(P=0.026)。结论牙龈卟啉单胞菌W83与ATCC33277外膜囊泡mRNA表达存在差异。
- 阮毅艾俊江春招洛丹夏昕刘墨
- 关键词:牙龈卟啉单胞菌高通量筛选
- 长链非编码RNA对牙本质基质蛋白1的调控机制被引量:2
- 2017年
- 目的初步探究长链非编码RNA(lnc RNA)对牙本质基质蛋白1(DMP1)基因表达的调控机制。方法在MC3T3-E1细胞中,运用Western blot以及实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)实验观察lnc RNA32865与DMP1的变化趋势。构建含有荧光素酶报告基因的DMP1启动子载体,并与lnc RNA过表达质粒、si-lnc RNA32865分别共转染后,观察DMP1启动子活性以及lnc RNA32865对其的影响。数据进行统计学处理,以P<0.05为差异具有统计学意义。结果 Western blot以及实时荧光定量PCR实验结果显示,在MC3T3-E1细胞中过表达lnc RNA32865时,DMP1基因表达量(0.236±0.022)较对照组降低(t=59.816,P<0.001),抑制lnc RNA32865时,DMP1基因表达量(1.994±0.133)较对照组升高(t=-12.989,P=0.006)。荧光素酶报告基因检测表明DMP1启动子有活性(t=-77.360,P<0.001)。与转染DMP1启动子处理组(6.018±0.105)比较,DMP1启动子质粒与lnc RNA32865过表达质粒共转染组荧光强度(3.877±0.120)显著降低(t=50.713,P<0.001),而DMP1启动子质粒与si-lnc RNA32865共转染组荧光强度(17.296±0.674)显著增加(t=-26.612,P=0.001)。结论初步证明lnc RNA32865与DMP1表达趋势相反,lnc RNA32865通过与DMP1基因的启动子区相互作用,以此调控DMP1的基因表达。
- 李博亚伍虹夏昕陈绛媛余艳崧庄沛林阮毅
- 关键词:基因表达调控长链
- 小鼠颌骨发育过程中长链非编码RNA的表达谱变化被引量:5
- 2014年
- 目的研究在小鼠颌骨发育过程中长链非编码RNA(lnc RNA)的表达谱变化情况。方法利用lnc RNA-seq测序技术检测孕18 d及出生后14 d的C57小鼠下颌骨组织样本中的lnc RNA表达谱差异,经对原始数据进行预处理达到均一化后,筛选出差异表达lnc RNA,进行分析。结果孕18 d与出生后14 d的C57小鼠下颌骨组织样本相比较,2倍以上变化并有显著差异(FDR≤0.001)的lnc RNA,确定为差异表达lnc RNA。2倍以上变化的共6617条,占所有lnc RNA的17.16%;2倍以上升高的共3720条;2倍以上降低的共2897条;5倍以上升高的共714条;5倍以上降低的共288条;10倍以上升高为共645条;10倍以上降低的共211条。结论孕18 d与出生后14 d的C57小鼠下颌骨组织样本相比较,lnc RNA表达谱发生显著变化。提示差异性表达的lnc RNA可能参与了小鼠颌骨发育的调控。
- 夏昕伍虹陈绛媛孔祥波阮毅
- 关键词:颌骨发育长链非编码RNA基因测序
- 小鼠颌骨发育过程中DMP1基因相关lncRNA的表达研究
- 2018年
- 目的研究C57小鼠不同发育时期颌骨中DMP1基因附近长链非编码RNA (lncRNA)的表达变化情况。方法利用lncRNA测序技术和实时定量PCR (RT-PCR)检测孕18 d (E18D)及出生后2周(2W)的C57小鼠下颌骨组织样本中DMP1基因位置附近的lncRNA表达变化,分析其与DMP1基因表达变化的关系。结果 E18D组与2W组间有6 617条差异表达的lncRNA (∣log2 (2W/E18D)∣>1且控制错误发现率<0.01),其中有5条lncRNA在DMP1基因上游或下游300 000 bp以内。RT-PCR分析显示,2W组中DMP1和lnc19450的表达较E18D组降低,而lnc30219、lnc8292、lnc30219和lnc32865的表达较E18D组上升(P均<0.05)。结论 lnc19450的表达与DMP1基因的表达趋势一致,lnc30219、lnc8292、lnc30219和lnc32865的表达与DMP1基因的表达趋势相反,推测lnc19450、 lnc30219、 lnc8292、lnc30219和lnc32865可能在DMP1基因的表达调控起着重要的作用。
- 夏昕阮毅陈绛媛孔祥波伍虹
- 关键词:牙本质基质蛋白1基因