聂晓庆
- 作品数：7 被引量：22H指数：3
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：四川省畜禽育种攻关项目四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 泸宁鸡MyoG基因的克隆及组织表达差异分析被引量：4
- 2015年
- 为了研究MyoG基因在鸡生长发育与肉质形成中的作用,试验以泸宁鸡为研究对象,采用RT-PCR技术克隆MyoG基因序列,并利用生物信息学的方法对其理化性质、氨基酸同源性等进行预测和分析,同时采用半定量方法检测MyoG基因在泸宁鸡不同组织中的表达水平。结果表明：泸宁鸡MyoG基因序列长度为741bp,其中开放阅读框（ORF）长度为684 bp,编码227个氨基酸,具有碱性螺旋-环-螺旋结构（bHLH）,与哺乳动物的同源性为70%~71%,与原鸡、火鸡、绿头鸭、游隼的同源性为91%~99%。组织表达谱结果表明,MyoG基因在泸宁鸡腿肌、胸肌、肝脏、肾脏、脑、脾脏、心脏中均有表达,在腿肌、胸肌、心脏中表达水平较高,在肝脏、肾脏和脑中表达水平较低,说明Myo G基因的表达主要集中于肌肉组织。
- 梅寒徐亚欧吕明张明刘红丽左斌石浩聂晓庆林亚秋
- 关键词：MYOG基因基因克隆
- 米易鸡ADSL基因第2和第9外显子多态性与肌苷酸含量的关联被引量：7
- 2015年
- 为了检测米易鸡ADSL基因第2、第9外显子的单核苷酸多态性并分析该多态性与胸肌肌苷酸含量的关联性,以四川省优质地方鸡种米易鸡为研究对象,采用高效液相色谱测定米易鸡胸肌肌肉肌苷酸的含量,并运用测序技术测定了ADSL基因第2、第9外显子的单核苷酸多态性。结果表明:ADSL基因在外显子2(A3713G、C3797T),外显子9(C10191T)处出现3个SNP位点,变异引起相应的氨基酸均为同义变异,第2外显子A3713G位点的基因型为AA、GG、AG型;C3797T位点的基因型为CC、CT、TT型;第9外显子的C10191T位点的基因型为CC、CT型。经独立性检验,ADSL基因A3713G、C10191T位点变异处于Hardy-Weinberg平衡状态;应用最小二乘法对基因型与肌苷酸含量进行分析,说明ADSL第9外显子C10191T SNP位点与IMP含量存在显著相关性(P<0.05),CT型个体的胸肌肌苷酸含量高于CC型个体,初步推测米易鸡中ADSL基因第9外显子C10151T SNP位点CT型为优势基因型。
- 石浩徐亚欧梅寒王海刘红丽左斌聂晓庆胡卫民
- 关键词：肉质风味外显子2
- 藏鸡THRSP基因的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 对藏鸡THRSP基因进行克隆、序列测定及生物信息学分析.结果表明:获得的藏鸡THRSP基因核苷酸序列为428 bp(Gen Bank登陆号:KT153607),在50-258 bp处存在1个Cp G岛,ORF长度为390 bp,编码129个氨基酸,其中Leu所占比例为10.9%.THRSP蛋白分子量为14.18 ku,等电点(p I)为4.61,属于不稳定酸性核蛋白,存在8个磷酸化位点和5个O糖基化位点.预测其二级结构中α螺旋占51.2%,β折叠占3.1%,无规则卷曲占45.7%.同源性分析结果表明:藏鸡与原鸡THRSP基因核苷酸及预测的氨基酸序列同源性为100%,两者亲缘关系最近.
- 聂晓庆徐亚欧吕明左璐璐李想林亚秋
- 关键词：藏鸡基因克隆生物信息学分析
- 藏鸡磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)的克隆及组织表达谱研究被引量：5
- 2016年
- 本研究旨在阐明藏鸡PID1基因在不同组织与时序表达谱,并研究PID1基因表达与肌内脂肪含量(IMF)的关系。利用RT-PCR技术克隆藏鸡PID1基因,用相关软件预测PID1蛋白的结构和功能,采用荧光定量PCR研究PID1基因在藏鸡不同组织、不同日龄的表达谱,并分析其与IMF的相关性。结果显示,克隆得到藏鸡PID1基因序列长度为654bp(GenBank登录号:KT000001),共编码217个氨基酸,是具有PTB结构域的不稳定亲水酸性蛋白质;有14个磷酸化位点、4个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点、7种保守特异性蛋白激酶结合位点、3个二硫键;预测其二级结构中α-螺旋占26.73%,β折叠占20.74%,无规则卷曲占52.53%,属于混合型蛋白且主要存在于细胞质中。荧光定量PCR结果显示,PID1基因在藏鸡的不同组织中均存在表达,且在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01);时序表达谱结果显示,PID1基因在1日龄公藏鸡胸肌中表达水平最高。在210日龄的公鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄的表达水平(P<0.01),在119日龄母鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄表达水平(P<0.01)。在119和154日龄公鸡脂肪组织中表达水平较高,在210日龄母鸡脂肪组织中的表达量最高(P<0.01)。相关性分析结果显示,PID1mRNA的表达量与藏鸡胸肌的IMF含量存在显著相关(P<0.05)。结果提示,PID1基因可能是影响藏鸡IMF沉积的候选基因。
- 聂晓庆林亚秋徐亚欧赵燕英吕明左璐璐张小玉李想
- 关键词：藏鸡克隆肌内脂肪
- 泸宁鸡肌肉硫胺素沉积规律研究被引量：2
- 2015年
- 以四川省优质地方鸡种泸宁鸡为素材,分别从不同时期(81、119、154、210日龄)的200只鸡中随机选取8公8母,采用高效液相色谱法测定不同组织、日龄、性别肌肉中硫胺素的含量。结果显示,公母鸡腿肌硫胺素含量极显著高于胸肌(P<0.01);公母鸡胸肌、腿肌硫胺素含量均在119日龄达到最高;随着日龄的增加,胸肌与腿肌硫胺素含量先上升后下降;胸肌硫胺素含量119日龄与81日龄、210日龄差异显著(P<0.05),其余各日龄间差异不显著(P>0.05);腿肌硫胺素含量各日龄间差异均显著(P<0.05)。硫胺素含量与屠宰性状相关性分析结果显示,119日龄胸肌硫胺素含量与胸肌重呈极显著相关(P<0.01),腿肌硫胺素含量与腹脂重呈极显著相关(P<0.01)、与腿肌重呈显著相关(P<0.05)。
- 聂晓庆徐亚欧阳明华陆岩冰王培王海梅寒刘红丽左斌石浩林亚秋
- 关键词：屠宰性状相关系数
- 藏鸡A-FABP基因和H-FABP基因的克隆及生物学信息分析
- 2015年
- 以藏鸡为研究对象,根据NCBI上登录的原鸡A-FABP和H-FABP基因序列设计引物,利用RT-PCR方法克隆藏鸡A-FABP和H-FABP基因的CDS区,并进行生物信息学分析.结果表明:藏鸡A-FABP和H-FABP基因的ORF分别为399 bp、402 bp,编码132、133个氨基酸;A-FABP和H-FABP分子量分别为14.91ku、14.84ku,等电点分别为6.34、5.92,均为亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构.磷酸化位点分别有9、6个,O糖基化位点分别有10、5个;藏鸡A-FABP和H-FABP的氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别为99%、100%,在鸟类动物中序列比较保守.
- 梅寒王强徐亚欧吕明左璐璐聂晓庆林亚秋
- 关键词：藏鸡A-FABP基因H-FABP基因克隆
- 肌细胞生成素基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联研究被引量：3
- 2015年
- 本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联性。采用PCRSSCP和DNA测序技术,对泸宁鸡MyoG基因5′调控区的多态性进行检测。结果表明,泸宁鸡MyoG基因5′调控区存在4个多态位点(A153G、A267G、A446G和C612T)。在153bp处存在A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),其中AA基因型肝脏重显著高于AG、GG基因型(P<0.05)。在446bp处存在的A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),该位点GG基因型屠宰率显著高于AA、AG基因型(P<0.05),AG、GG基因型胸肌率显著高于AA基因型(P<0.05)。以上结果显示,MyoG基因5′调控区的多态性与泸宁鸡肝脏重、屠宰率、胸肌率有一定的关联性,可作为泸宁鸡相应生长性状的候选基因。
- 刘红丽徐亚欧熊斌胡卫民梅寒石浩左斌聂晓庆王海
- 关键词：MYOG基因PCR-SSCP生长性状
