于凡 作品数:35 被引量:24 H指数:3 供职机构: 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 更多>> 发文基金: 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 国家现代农业产业技术体系建设项目 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 自动化与计算机技术 更多>>
利用微卫星标记分析两个吉富罗非鱼群体的遗传差异 被引量:12 2015年 【目的】评价不同吉富罗非鱼群体的遗传多样性,筛选出鉴别不同群体的分子标记,为吉富罗非鱼种质资源保护及其新品种选育提供理论依据。【方法】对48尾来自两个不同群体的吉富罗非鱼进行尾静脉采血,抽提其基因组DNA,应用微卫星标记技术判定其等位基因和基因型,然后采用Gen Al Ex 6.2、Cervus 3.0和Populations软件进行数据分析,计算有效等位基因数(Ne)等群体遗传多样性相关参数,对两个吉富罗非鱼群体进行遗传差异分析。【结果】从50对微卫星引物中筛选出23对扩增产物稳定、条带清晰、特异性好的引物,扩增出的DNA片段大小在110~388 bp。利用23个微卫星位点,从两个吉富罗非鱼群体中共检测到89个等位基因和163种基因型,平均每个位点的等位基因数(Na)3.8个、基因型7.1种。两个吉富罗非鱼群体的平均观察杂合度(Ho)分别为0.6383和0.5957,平均期望杂合度(He)分别为0.5759和0.5559;23个位点在两个群体中平均多态信息含量(PIC)分别为0.5131和0.4942,平均固定系数(FIS)分别为-0.1184和-0.0718;两个群体间的遗传距离(DA)为0.1287,平均遗传分化系数(FST)为0.135。UNH911、GM141、GM287、GM134等4个位点在两个群体中扩增的条带存在明显差异。【结论】两个吉富罗非鱼群体遗传多样性水平较高,均存在杂合子过剩现象,群体间遗传分化程度中等,具有较强的环境适应能力,且选育空间大。UNH911、GM141、GM287、GM134等4个微卫星位点可作为鉴别两个吉富罗非鱼群体的分子标记,也可用于分子标记辅助育种研究。 李建林 李红霞 唐永凯 俞菊华 于凡关键词:吉富罗非鱼 微卫星标记 建鲤极长链脂酰辅酶A脱氢酶基因cDNA克隆及相关定量表达分析 被引量:1 2015年 【目的】克隆建鲤(Cyprinus carpio var.Jian)极长链脂酰辅酶A脱氢酶(VLCAD)基因c DNA序列,并分析其表达情况,为揭示鲤鱼脂肪酸代谢机理提供理论依据。【方法】以建鲤为研究对象,利用RT-PCR、RACE克隆VLCAD基因的c DNA序列,并通过实时荧光定量PCR对VLCAD基因在不同组织、脂肪源及饥饿胁迫等条件下的表达情况进行分析。【结果】扩增获得的建鲤VLCAD基因c DNA序列全长2527 bp,包括296 bp的5'非翻译区、1974 bp开放阅读框(OFR)及257 bp的3'非翻译区,共编码659个氨基酸;建鲤VLCAD氨基酸序列包含FAD结合位点、底物结合位点、催化位点,具有ACADs家族的特征性结构;与鲤科类斑马鱼(Danio rerio)的同源性最高,达94%。建鲤VLCAD基因在性腺、肌肉、肝脏、前肠、肾脏、心脏和脑中均有表达,且以心脏的表达量最高,前肠的表达量最少。鱼油和亚麻油对建鲤VLCAD基因在肝脏和肌肉中的表达无显著影响(P>0.05),但饥饿状态下肌肉中的VLCAD基因表达量显著高于正常状态(P<0.05)。【结论】建鲤VLCAD基因在富含线粒体且脂肪酸代谢旺盛的组织器官中高效表达,对脂肪酸β氧化起调控作用,尤其在饥饿状态下对脂肪酸氧化调控作用明显增强,能促进脂肪酸分解为机体供能。 刘骏恂 俞菊华 李红霞 唐永凯 李建林 于凡关键词:建鲤 脂肪源 饥饿胁迫 建鲤剩余采食量性状相关的SNP遗传分子标记及其应用 本发明涉及一种与建鲤剩余采食量性状相关的SNP分子遗传标记及其应用。该SNP分子遗传标记位于B22号染色体NC_056618.1序列的18426059位点,所述位点为一个C>T突变。本发明提供一种通过确定SNP分子... 冯文荣 唐永凯 许元峰 贾睿 苏胜彦 于凡 李建林一种电泳加样装置 本实用新型公布了一种电泳加样装置,其特征在于:该装置包括伸缩结构和多个加样装置,所述多个加样装置均匀设置在所述伸缩结构上,由伸缩结构带动调整相互之间间距。本实用新型将多个加样装置设置在伸缩结构上,可以实现多个加样装置相互... 李建林 俞菊华 李红霞 唐永凯 于凡文献传递 6 种鲤鱼mtDNA D-loop区的遗传差异分析 经克隆、测序获得了建鲤、黑龙江鲤、荷包红鲤、兴国红鲤、黄河鲤和框镜鲤6种43尾鲤鱼的mtDNA控制区全序列,并分析了控制区序列的变异和遗传多样性。 李建林 唐永凯 李红霞 于凡 俞菊华关键词:D-LOOP区 一种河蟹离体孵化装置 本实用新型涉及一种河蟹离体孵化装置,包括离体孵化缸,所述离体孵化缸内部的顶端设置有第一过滤棉安装槽,离体孵化缸内部的底端设置有第二过滤棉安装槽,第一过滤棉安装槽和第二过滤棉安装槽的中部均设置有过滤板,过滤板的顶端设置有过... 唐永凯 苏胜彦 王美垚 李建林 李红霞 宋长友 于凡 徐跑文献传递 一种浮游动物诱捕装置 本实用新型涉及一种浮游动物诱捕装置,包括履带式移动底座,其顶面外侧固定连接有固定底板,所述固定底板的顶端外侧固定连接有固定支架,所述固定支架的顶端外侧固定连接有加强固定圈,所述加强固定圈的一端内壁面固定连接有高强度真空罐... 唐永凯 苏胜彦 王美垚 李建林 李红霞 宋长友 于凡 徐跑文献传递 一种鉴别斑马鱼雌核发育过程中单倍体二倍化的方法 本发明提供一种鉴别斑马鱼雌核发育过程中单倍体二倍化的方法,采集斑马鱼受精卵,提取RNA,并进行反转录获得DNA,进行QPCR扩增,确定产物特异性,通过QPCR基因表达量,确定是否二倍化及二倍化时间节点。运用本发明所述方法... 于凡 李建林 苏胜彦 冯文荣 唐永凯 徐跑鲤鱼 3个SAA基因的克隆、表达和抗菌特性 血清淀粉样蛋白A是一种急性相蛋白,具有多种生物学功能.本实验在鲤鱼克隆到了 3 种 SAA 基因,分别位于两个连锁群上,CcSAA3a 位于LHQP01005363,但 CcSAA3b 和 CcSAA1 以相反的转录方向... 俞菊华 唐永凯 李建林 李红霞 于凡关键词:鲤鱼 血清淀粉样蛋白A 重组蛋白 抑菌作用 鲤鱼2种脂酰辅酶A脱氢酶基因cDNA克隆、表达及活性研究 2017年 为探究脂酰辅酶A脱氢酶对脂肪酸β氧化的调控机制,使用RT-PCR在鲤鱼肝脏克隆了脂酰辅酶A脱氢酶家族中的MCAD和LCAD全长c DNA序列,阅读框分别为1 275,1 326 bp,编码424,441个氨基酸,分析表明他们均具备ACADs家族的特征序列:FAD结合位点、底物结合位点、催化位点等,与斑马鱼MCAD和LCAD的一致性分别为93.16%和94.56%。实时定量RT-PCR结果表明,MCAD和LCAD主要在肝脏和心脏表达;不同脂肪源对MCAD的表达没有明显影响,但鱼油对LCAD的表达有明显的刺激作用。此外,构建了原核表达载体MCADs-p EASY(E2)和LCADs-pEASY(E2),经IPTG诱导获得了原核表达蛋白,分子量分别为43.0,43.6 kDa。经检测这2个蛋白在370,450 nm处有明显的吸收峰,表明他们能自然结合FAD辅基。吩嗪硫酸甲酯反应法结果表明:MCAD和LCAD酶活性最适温度均为28℃,酶活分别为9.12,10.29 U/g。结果表明,与哺乳动物类似,鲤鱼MCAD和LCAD在肝脏和心脏表达量高;高不饱和脂肪酸对LCAD的表达有促进作用。 喻文娟 俞菊华 李红霞 李建林 唐永凯 于凡 何枫 傅纯洁关键词:鲤鱼 MCAD 克隆 原核表达 酶活性