魏来 作品数:14 被引量:71 H指数:5 供职机构: 北京医科大学人民医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 美国中华医学基金会项目 美国中华医学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
构建T载体快速克隆丙型肝炎病毒5′端非编码区扩增产物 被引量:1 1997年 为探讨自行构建T载体的简便方法,克隆丙型肝炎病毒(HCV)5′端非编码区(5′NCR)扩增产物,并为制备HCV检测探针作准备。以SmaⅠ消化质粒pGEM3Zf(+),酶切产物纯化后在仅含有脱氧腺苷酸的聚合酶链反应(PCR)缓冲液中70℃作用2小时,构建成T载体。根据PCR扩增产物3′端存在一个非模板依赖的脱氧腺苷酸原理,将扩增产物直接克隆入T载体。同时以SmaⅠ消化的质粒pGEM3Zf(+)与PCR产物平端连接作为对照。限制性酶切长度多肽性分析,PCR及DNA序列测定等均证实克隆构建成功。AT克隆的连接效率约为平端连接的42倍。以上结果表明,构建T载体经济、简便。AT克隆快速、有效。所构建的克隆可用作PCR实验对照模板或制备探针。 魏来 陶其敏关键词:T载体 克隆 丙型肝炎病毒 中国人庚型肝炎病毒部分基因的克隆及序列分析 被引量:5 1996年 目的:分析中国人血清中庚型肝炎病毒(HGV或GBV-C)NS3区部分基因序列。方法:从个体供血者及肝硬化患者血清中,通过逆转录合成cDNA,设计特异性引物进行多聚酶链式聚合反应,将产物克隆于载体上,采用双脱氧核苷酸链终止法进行双向测序。结果:分离出的5株NGV毒株的NS3区部分核苷酸序列之间同源性从85%到98%,与国外已发表的HGV序列比较,同源性在79%~91%。推测的其编码氨基酸序列,5株之间100%一致,与国外已报告的HGV比较,同源性为94.9%~100%。结论:从中国人血清中分离出5株HGV序列,其NS3区部分核苷酸存在着一定的变异性,但其编码的氨基酸非常保守。 陈红松 王宇 魏来 王凤水 陈志 刘玉兰关键词:庚型肝炎病毒 基因克隆 氨基酸序列 用PCR分析HCV-RNA NS5部分序列变异 1996年 用PCR分析HCV-RNANS5部分序列变异魏来,王宇,陈红松,陶其敏(北京医科大学人民医院肝病研究所,北京100044)对丙型肝炎病毒(HCV)cDNA的序列分析是验证HCV基因分型,确定新的型与亚型的基础 ̄[1].经典的序列分析方法需经繁琐的分子... 魏来 王宇 陈红松 陶其敏关键词:丙型肝炎病毒 RNA 聚合酶链反应 丙型肝炎病毒RNA非结构区套式聚合酶链反应 被引量:12 1996年 目的探讨不同引物对HCVRNA检出率的影响,立敏感的NS5区基因扩增技术。方法选择不同引物,采用非结构5(NS5)区套式聚合酶链反应(PCR)及联合式[HC非编码区(5′NCR)与NS5联合]PCR技术检测10例抗HCV阳性献血员及37例输血后丙型肝患者的血清HCVRNA。结果10例抗HCV阳性献血员应用联合式PCR,以NS5-3+NS5-4、SF2+NS5-4、K1+NS5-4、NS5-1+NS5-4引物及套式NS5-1+NS5-4引物扩增时,其RNA检出率分别为5/10、6/10、7/10、8/10和9/10;而37例输血后丙型肝炎患者中35例RNA阳性,检出率为95%,其中18例1b型和19例2a型样品的检出率分别为100%和89%。 杜绍财 魏来 陶其敏 冯百芳 朱凌 刘金祥关键词:丙型肝炎病毒 聚合酶链反应 RNA 庚型肝炎病毒非结构基因(NS)5区部分序列的一级结构及其变异 被引量:7 1997年 测定庚型肝炎病毒(HGV)非结构基因5(NS5)区部分基因序列。方法从3例献血员,2例肝硬化患者及1例非甲-戊型肝炎患者血清中通过逆转录-套式-聚合酶链反应(PCR)扩增出长994bp的cDNA序列,PCR产物纯化后以双脱氧末端终止法测定其序列。结果所分离的6株HGVNS5区部分核苷酸序列与国外报道的3株(GBV-C、PNF2161、R10291)比较,同源性为87.2%~93.9%;6株间同源性为90.1%~93.8%。根据所测得的6株cDNA序列推导出其编码的氨基酸序列,与国外发表的3株序列相比,同源性在93.6%~98.7%,6株之间为93.6%~98.4%。在此区内发现有16个保守的脯氨酸残基及8个保守的半胱氨酸残基。结论从不同慢性肝脏疾病患者及献血员血清中分离出6株HGV,其NS5区部分序列在核苷酸水平及氨基酸水平均较保守。 常锦红 魏来 陶其敏关键词:庚型肝炎病毒 基因 NS5区 肝癌病人血清中庚型肝炎病毒非结构基因(NS)5区cDNA的序列分析 被引量:5 1996年 通过逆转录-套式-聚合酶链反应,从2例肝癌患者血清中扩增出长994bp的庚型肝炎病毒(HGV)cDNA序列,聚合酶链反应(PCR)产物纯化后以双脱氧末端终止法从双向直接测定其序列。结果,所分离的2株HGV NS5区994bp核苷酸与国外已发表的3株HGV序列比较,同源性为87.21%~93.67%;2株间的同源性为93.92%。根据所测得的cDNA序列推导出其编码的313氨基酸序列,在氨基酸水平上本文报告的2株与国外发表的3株序列相比,同源性在94.25%~97.44%之间,2株之间为96.49%。在此区内发现有16个保守的脯氨酸残基及8个保守的半胱氨酸残基。结论:首次从肝癌患者血清中分离出2株HGV,其NS5区部分序列在核苷酸水平及氨基酸水平均较保守,与非肝癌患者血清中分离的HGV相比,变异不大。 魏来 常锦红 陶其敏关键词:庚型肝炎病毒 病毒基因 病毒学 Sequencing of hepatitis C virus cDNA with polymerase chain reaction directed sequencing * 1997年 AIM To explore a rapid and easy sequencing method for hepatitis C virus (HCV) genome, and establish a new sequencing method in China. METHODS Polymerase Chain Reaction (PCR) was combined with DNA sequencing technique. PCR products were purified by agarose gel electrophoresis, polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE), Polyethylene glycol (PEG) respectively. Then in the presence of a 5′ labeling PCR primer, purified PCR products were directly sequenced. By this method, HCV NS5b cDNA from two HCV infected individuals (HC 42 and HC 49) were sequenced. 魏来 王宇 陈红松 陶其敏慢性非甲-戊型肝炎患者血清中庚型肝炎病毒核酸的检测及部分核苷酸序列分析 被引量:4 1997年 目的了解庚型肝炎病毒(HGV)在慢性非甲-戊型肝炎发病中的作用,并测定其非结构基因5(NS5)区部分核苷酸序列。方法以逆转录-套式-聚合酶链反应法检测 HGV RNA,并对阳性者血清中扩增出的994bp 长的 cDNA直接测序。结果 35例慢性非甲-戊型肝炎患者中1例血清 HGV RNA 阳性(2.9%)。该患者 HGV NS_5区部分核苷酸序列与美国株 PNF2161及 R10291的同源性分别为87.95%及89.23%。与西非株的同源性为93.50%。结论 HGV 为慢性非甲-戊型肝炎的病原之一,但可能不是主要病原。在北京所分离的一株 HGVNS_5区核苷酸序列与西非株较接近。 常锦红 魏来 杜绍财 王豪 孙焱 陶其敏关键词:庚型肝炎病毒 聚合酶链反应 核酸 逆转录套式聚合酶链反应检测庚型肝炎病毒 被引量:6 1997年 目的建立敏感、特异的逆转录套式聚合酶链反应(RT-nested-PCR)方法,以检测中国人庚型肝炎病毒(HGV)感染。方法根据中国人感染HGV者NS5区部分核苷酸序列分析结果,设计套式PCR引物,用于HGVRNA的检测,并与用国外报道引物所作的一次PCR和套式PCR检测结果进行比较。结果共检测标本133份。以国外报道引物作一次PCR和套式PCR检出率分别为8.3%和11.3%,作者建立的套式PCR检出率为18.0%,对部分PCR产物进行序列分析证实为HGV特异性基因。结论建立的方法可在中国人群中显著提高HGVRNA检出率。 常锦红 魏来 陶其敏 杜绍财 王豪 孙焱关键词:庚型肝炎病毒 聚合酶链反应 核苷酸序列 丙型肝炎病毒非结构基因5b的变异及与干扰素治疗的关系 被引量:4 1997年 以聚合酶链反应直接序列分析方法测定了4例无症状慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染者,与9例接受干扰素治疗的慢性丙型肝炎患者血清中HCV非结构基因5b(NS5b)cDNA的序列。发现,与已发表的Ⅱ/1b型HCV序列相比,无症状慢性HCV感染者的HCV在核苷酸水平的同源性高于干扰素治疗有效的慢性丙型肝炎患者(95.65%±2.61%比94.35%±2.29%),后者又高于干扰素治疗无效的慢性丙型肝炎患者(92.70%±1.90%)。还发现在干扰素治疗后,治疗无效者血清中HCVNS5bcDNA序列发生明显变化,在所测定的380个核苷酸中有9~48个发生碱基替换,从而导致所编码的氨基酸中有6~20个发生突变。结果提示,HCVNS5b基因变异与病情及干扰素治疗有一定关系。变异较大者常出现明显的临床表现,且干扰素治疗可能趋势于失败。 魏来 杜绍财 王豪 孙焱 陶其敏 冯百芳关键词:丙型肝炎病毒 病毒变异 干扰素 丙型肝炎