张坚
- 作品数:7 被引量:7H指数:1
- 供职机构:中国医学科学院中国协和医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家攀登计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 树鼩卵磷脂胆固醇酰基转移酶cDNA和蛋白质序列结构分析
- 2002年
- 目的克隆获得树鼩卵磷脂胆固醇酰基转移酶cDNA序列并进行结构分析。方法以树鼩肝脏mRNA逆转录出的Ⅰ链cDNA为模板,运用SMARTRACEPCR扩增技术,扩增得到树鼩卵磷脂胆固醇酰基转移酶(LCAT)cDNA序列,并推导出LCAT氨基酸序列。利用分子生物学软件DNAMAN对氨基酸序列的一、二级结构及主要结构域进行分析和比较。结果树鼩LCATcDNA序列由1340个核苷酸构成,开放阅读框架1320bp,编码440个氨基酸的LCAT前体(含24个氨基酸构成的信号肽和416个氨基酸组成的成熟蛋白)熏3'非翻译区18bp,终止密码TAA,加尾信号AATAAA和一个25bp的poly(A)尾。树鼩LCATcDNA序列已作为新基因被GenBank接受,登记号AF272861。树鼩与人和狒狒LCATcDNA的同源性分别为90%和89%。结论树鼩LCATcDNA序列与人及其他实验动物高度同源。
- 张坚曾武威陈保生吴钢张文成张可满
- 关键词:树QUCDNA
- 树鼩载脂蛋白E的cDNA和蛋白质结构分析
- 2002年
- 以从树肝脏mRNA逆转录得到的Ⅰ链cDNA为模板 ,运用SMARTRACEPCR技术 ,扩增得到树载脂蛋白E(apoE)cDNA序列 ,并推导出apoE蛋白质的氨基酸序列 .利用分子生物学软件包PCGENE对氨基酸序列和二级结构进行分析和比较 .结果表明 ,树apoEcDNA序列 (作为新基因已被GenBank接收 ,登录号为AF 30 3830 )由 1138bp构成 ,其中 5′非翻译区 6 4bp ,3′非翻译区 135bp ,939bp组成一个完整开放阅读框架 ,与人apoEcDNA的同源性为 86 % .编码 313个氨基酸组成的apoE前体 ,包含 18个氨基酸构成的信号肽和 2 95个氨基酸组成的成熟蛋白 .与人apoE氨基酸序列的同源性为 78% .树apoE与人及其它种属动物apoE在氨基酸组成上相近 ,但比人apoE少4个氨基酸 ,比动脉粥样硬化易感动物家兔apoE多 2个氨基酸 .经Garnier法预测 ,树apoE蛋白二级结构与人apoE相似 ,螺旋构象 (helical) 6 9 9% ,伸展构象 (extended) 16 6 % ,转角构象 (turn)6 0 % ,无规则卷曲 (coil) 7 6 % .
- 张坚曾武威陈保生吴钢张文成张可满
- 关键词:载脂蛋白ECDNA蛋白质结构
- 北京鸭卵磷脂胆固醇酰基转移酶的cDNA和蛋白质的结构分析被引量:1
- 2002年
- 为获得不易感动脉粥样硬化动物北京鸭卵磷脂胆固醇酰基转移酶 (LCAT)的cDNA和蛋白质序列 ,分析其结构特点 .以从北京鸭肝脏mRNA反转录获得的cDNA一链为模板 ,应用SMART RACE技术 ,获得了北京鸭LCAT的cDNA序列 ,推导出其蛋白质氨基酸序列 ,应用分子生物学软件对该蛋白的一级、二级结构进行分析和比较 .北京鸭LCATcDNA (在GenBank中的注册号为AF32 4 887)全长 195 3bp ,其中开放阅读框架 135 6bp ,编码 4 5 1个氨基酸 ,包括一个由 2 3个氨基酸构成的疏水性信号肽和一个由 4 2 8个氨基酸组成的成熟蛋白 .该成熟蛋白比人LCAT在C端多 12个氨基酸 ,其与鸡、人、家兔的同源性依次为 98%、83%和 82 % .与其它种属LCAT蛋白序列的比较结果表明 ,北京鸭LCAT蛋白质序列虽然在长度上和结构上与其它种属有一定的差异 。
- 曾武威张坚陈保生吴钢张可满薛红
- 关键词:北京鸭卵磷脂胆固醇酰基转移酶CDNA蛋白质结构
- 人血管生成素-1的天然反义RNA,Gna-1的克隆及鉴定
- 2001年
- 用差异显示-PCR方法,从血管内皮细胞中获得一新的cDNA片段,以该片段为探针,从人主动脉cDNA文库中筛选到一个长2198bp的CDNA克隆,经DNA测序及同源性分析,发现该序列中含有与血管生成素-1FD编码区及3’端部分非翻译区完全互补的碱基,推测该克隆为体内血管生成素-1的天然反义RNA,命名为Gna-1,它不编码蛋白质.RT-PCR方法证实,Gna-1在人脐静脉内皮细胞及ECV304中有转录,推测Gna-1可能具有调控血管生成素-1的作用,参与血管再造过程.
- 张可满陈保生吴刚薛红曾武威张坚白玲
- 关键词:血管生成素-1反义RNACDNA文库克隆内皮细胞
- 不易感动脉粥样硬化动物脂代谢相关基因的克隆与分析
- 2004年
- 北京鸭和树鼩是两种很好的不易感动脉粥样硬化的模型动物,以往的研究显示它们血浆中富含HDL和apoA Ⅰ,同时发现其血浆中LCAT活性高、CETP活性低的特点,喂饲高脂饮食数周后动脉壁不易形成粥样硬化斑块.它们的动脉粥样硬化不易感性可能与其血浆中特殊的脂质结构和代谢有关.
- 曾武威张坚吴钢薛红陈保生
- 关键词:动脉粥样硬化动物模型脂代谢克隆
- 树载脂蛋白CⅡ的cDNA和蛋白质结构分析
- 2002年
- 以从树肝脏mRNA反转录获得的cDNA一链为模板 ,应用SMART RACE技术 ,获得了树apoCⅡ的cDNA序列 ,并推导出其蛋白质氨基酸序列 ,应用分子生物学软件对该蛋白的一级、二级结构进行分析和比较。结果显示 ,树apoCⅡcDNA序列 (在GenBank中的注册号为AF335 5 85 )长 483bp ,其中开放阅读框架 30 6bp ,编码 10 1个氨基酸的前原蛋白 ,其蛋白原由 79个氨基酸组成。树apoCⅡ的氨基酸顺序与人、猴、狗的同源性分别为 86 %、87%和 81%。与人及其它种属动物的相同序列比较显示 ,树apoCⅡ分子C 端激活LPL功能区比N 端脂质结合区更具保守性。
- 曾武威张坚陈保生吴钢张文成薛红
- 关键词:树QUCDNA蛋白质
- 树胆固醇酯转运蛋白的cDNA和蛋白质结构分析被引量:6
- 2001年
- 目的 获得不易感动脉粥样硬化动物树胆固醇酯转运蛋白 (CETP)的cDNA和蛋白质序列 ,分析其结构特点 ,寻找其可能的抗动脉粥样硬化分子机制。方法 以从树肝脏mRNA反转录获得的cDNA一链为模板 ,应用SMART RACE技术 ,获得了树CETP的cDNA序列 ,并推导出其蛋白质氨基酸序列 ,应用分子生物学软件对该蛋白的一级、二级结构进行分析和比较。结果 获得的树CETPcDNA(在GenBank中的注册号为AF334 0 33)长 16 36bp ,编码 485个氨基酸 ,其成熟蛋白由 477个氨基酸组成 ,比人多一个氨基酸 (Gly318) ,该蛋白与人、家兔的同源性分别为 88%和 82 %。序列中与CETP结合和转运中性脂质功能相关的区域均非常保守 ,但在Asn34 2位的N 糖基化位点缺失 ,可能使其转运胆固醇酯的活性增加 ,利于外周组织和血浆中的胆固醇及其酯的清除。通过对不同种属蛋白序列的比较 ,初步分析了树CETP蛋白与功能相关的结构特点。
- 曾武威张坚陈保生吴钢薛红
- 关键词:树QU胆固醇酯类转运蛋白蛋白质结构分析