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焦春波
作品数:
3
被引量:2
H指数:1
供职机构:
大连理工大学高科技研究院
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相关领域:
生物学
农业科学
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合作作者
刘伟
大连理工大学高科技研究院
宋哲
大连理工大学高科技研究院
朱鸣华
大连理工大学高科技研究院
刘涛
大连理工大学高科技研究院
王晓钢
大连理工大学高科技研究院
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中国科学(B...
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化学学报
年份
3篇
2008
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3
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ANN方法在蛋白酶体酶切研究中的应用
蛋白酶体(Proteasome)在抗原肽加工提呈过程中发挥着重要的酶切功能。为了进一步研究蛋白酶体酶切特异性,本文基于神经网络方法预测蛋白酶体的酶切位点,采用10折交叉验证法得到预测准确度为80.21%。在相同检验集下,...
焦春波
关键词:
蛋白酶体
抗原蛋白
肿瘤疫苗
文献传递
基于SVM方法分析蛋白酶体裂解位点的特异性
被引量:2
2008年
真核细胞中的泛素-蛋白酶体系统在抗原肽加工呈递途径中发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切位点特异性,采用支持向量机(support vector machine,SVM)方法建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型.在相同检验集下,将本模型性能指标与其他预测模型方法比较,结果是本模型性能指标优先,预测准确度为83.1%.由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,反映了蛋白酶体裂解抗原蛋白的相互作用信息,这表明蛋白酶体对抗原蛋白的酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.
刘涛
宋哲
焦春波
刘伟
朱鸣华
王晓钢
关键词:
支持向量机
蛋白酶体
抗原肽
蛋白酶体对抗原蛋白酶切特异性的研究
2008年
在MHCI类分子结合的抗原表位加工呈递途径中,泛素-蛋白酶体系统对抗原蛋白的降解发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切特异性,采用偏最小二乘方法(partial least squares method,PLS)建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型,预测准确度为82.8%;由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,它反映了蛋白酶体对抗原蛋白酶切的相互作用信息,也表明蛋白酶体对抗原蛋白酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.
宋哲
刘涛
焦春波
刘伟
朱鸣华
王晓刚
关键词:
蛋白酶体
抗原表位
偏最小二乘法
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