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PCR-SSP在HLA低分辨中常见问题及解决措施被引量：4: 2007年; 目的探讨PCR-SSP在HLA低分辨分型中常见问题的原因,提出解决的措施。方法应用盐析法提取基因组DNA,用PCR-SSP法对参加造血干细胞资料库志愿者的血样进行HLA分型,琼脂糖凝胶电泳后紫外光灯下分析判读,并进行统计学分析。结果在4800份血样标本中,4187份标本能够准确判读出结果,检出率为87.2%,其余613份样本无法判读出确定的基因型。在这613份血样标本中所遇到的问题包括有漏检占41.9%(其中单孔漏检多达90.2%);假阳性及非特异性所占比例也较大,为29.2%;模棱两可的结果所占比例为23.2%;人为因素影响分析的占4.4%;仪器因素影响分析的占1.3%。结论SSP法用于HLA分型时,有99.5%问题可找到其原因所在,并通过相应的方法加以解决。; 孙瑛傅敏金晔谢军华季芸杨剑豪杜可明; 关键词：HLA PCR-SSP 假阳性

DNA序列分析鉴定HLA新等位基因B＊58：01：04: 2011年; 目的确认中国人群中的1个新HLA等位基因。方法使用PCR-SSO、PCR-SSP和测序为基础的分型技术,分析确认HLA-B位点新等位基因与B*58∶01∶01的差异。结果先证者HLA-B位点的2个等位基因为纯合子(均为HLA-B*58∶01∶04),不同于已知的HLA-B等位基因序列,与其同源性最高的B*58∶01∶01相比,在第4外显子处有1个碱基发生了改变,为785位G>A,但编码的氨基酸并未发生变化,仍然为Gln。结论该等位基因于2009年10月由WHO HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*58∶01∶04。; 刘嬿季云杨剑豪孙瑛谢军华郑皆炜杜可明; 关键词：HLA-B 等位基因

4082名上海骨髓库汉族无关供者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究被引量：12: 2012年; 目的了解上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1在高分辨分型水平上的等位基因及单体型频率分布特征。方法采用PCR-测序分型技术(Sequence-based typing,SBT)对4 082名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库上海分库汉族造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型频率。结果 4 082例样本中,共观察到204个HLA等位基因,其中频率>0.1的HLA-A、B、DRB1等位基因分别有A*11∶01、A*24∶02、A*02∶01、B*46∶01、DRB1*09∶01、DRB1*15∶01。841条A-B单体型中,70条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),8条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),17条单体型的频率高于0.01;1 027条B-DRB1单体型中,99条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),12条单体型的频率高于0.01;3 344条A-B-DRB1单体型中,681条单体型是"可靠的"(频率≥3.67×10-4),单体型频率高于0.001有135条。结论获得上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,为临床移植供者的选择、中国人群CWD表的制订、骨髓库最适库容的评估及人类遗传学研究提供参考数据。; 杨剑豪刘嬿郑皆炜谢军华孙瑛姜跃琴唐晴钧杜可明; 关键词：HLA-A DRB1 等位基因频率单体型频率

HLA单链分型技术在高分辨检测工作中的初步应用: 刘嬿杨剑豪郑皆炜谢军华孙瑛杜可明

HLA-A,B,DRB1单体型频率计算及其在骨髓库中的应用被引量：20: 2005年; 目的从群体资料计算HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,并用于骨髓库寻找HLA匹配供者。方法根据HLA表型群体资料,使用最大数学预期值算法(ExpectationMaximization,EM)计算HLA三座位单体型频率。通过实例运算介绍HLA表型频率以及发现HLA匹配无关供者的概率。结果①使用DNA基因分型技术鉴定12193例无关汉族健康个体HLA表型,计算求得HLAA,B,DRB1单体型频率。②预期概率与观察结果吻合,并用于评估骨髓库的最适大小。结论使用EM算法估计大样本汉族群体HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,结果可靠,可用于评估骨髓库的最适大小和组份。; 孙继丽杜可明傅敏季芸谢军华孙瑛金晔杨剑豪稽月华刘达庄钱开诚赵桐茂; 关键词：EM算法

构建采供血机构知识产权管理的评价体系: 目的构建适用于采供血机构知识产权管理的评价体系,为持续提升采供血机构知识产权工作绩效提供参考性依据。方法基于知识链及其相关理论,结合上海市血液中心的实践经验,采用德尔菲专家调查法,对拥有丰富工作经验的12名专家进行了3轮...; 刘李栋孙瑛马国豪; 文献传递

构建采供血机构知识产权管理的评价体系: 目的：构建适用于采供血机构知识产权管理的评价体系，为持续提升采供血机构知识产权工作绩效提供参考性依据.方法：基于知识链及其相关理论，结合上海市血液中心的实践经验，采用德尔菲法，对拥有丰富工作经验的12名专家做了3轮问卷调...; 刘李栋孙瑛马国豪; 关键词：知识产权采供血机构德尔菲法

慢性粒细胞白血病和HLA基因的关联性研究: 目的探讨慢性粒细胞白血病与HLA等位基因多态性的遗传相关性。方法采用PCR-SSOP分型技术对266 位慢粒病人进行HLA-A,B,DRB1基因分型,并以9996位上海骨髓库志愿捐献造血干细胞的健康供者作为对照,对 2组...; 季芸杨剑豪傅敏杜可明孙瑛孙继丽金晔谢军华嵇月华张铮毛臻; 文献传递

PCR-SBT法HLA基因分型模棱两可结果的判读及解决对策: 2009年; 目的研究PCR-SBT法HLA基因分型结果判读中出现的模棱两可问题并提出解决策略。方法对306名随机抽取的组织配型患者的DNA采用PCR-序列特异性引物(Sequence Specific Primer,SSP)低分辨方法检测,同时采用PCR-SBT法进行HLA-A,B,DRB1高分辨基因分型。PCR-SBT法模棱两可结果用PCR-SSP高分辨方法复核确认。结果所有306例检测标本的高低分辨血清学抗原一致,经PCR-SBT基因测序方法检测有111份模棱两可结果,占36.3%(111/306)。其中HLA-A座位有30对等位基因存在模棱两可结果,占所有检测标本等位基因总数的3.3%;HLA-B座位有66对,占7.2%;HLA-DRB1座位有36对,占3.9%。所有模棱两可标本经PCR-SSP HLA基因高分辨分型试剂PCR-SSP等方法复核确认。结论针对PCR-SBT法进行HLA-A,B,DRB1高分辨基因分型模棱两可结果所建立的解决策略,对于提高HLA数据分型的速度和分型准确性有重要意义。; 刘嬿季芸孙瑛杨剑豪毛臻杜可明; 关键词：人类白细胞抗原

PCR-SSP在HLA低分辨中常见问题及解决措施: 目的探讨PCR-SSP在HLA低分辨分型中常见问题的原因,提出解决的措施。方法应用盐析法提取基因组 DNA,用PCR-SSP法试剂盒对参加造血干细胞资料库志愿者的血样进行HLA分型,琼脂糖凝胶电泳后紫外光灯下分析判读,并...; 孙瑛杜可明傅敏金晔谢军华季芸张铮杨剑豪孙继丽嵇月华毛臻; 文献传递

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孙瑛

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