吕晓阳
- 作品数：16 被引量：74H指数：4
- 供职机构：扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金：江苏高校优势学科建设工程资助项目国家级星火计划江苏省农业科技自主创新基金更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学更多>>
- 湖羊生长发育曲线模型预测及趋势分析被引量：35
- 2014年
- 本试验旨在研究湖羊的生长发育状况,初步探讨湖羊的生长发育曲线模型并作出趋势分析,并根据此模型建立的生长曲线为湖羊的选育和改善饲养管理提供依据,从而找出湖羊养殖的最佳生长点和上市点。选用木板高床饲养的湖羊31只,测定了初生重、7日龄、14日龄、1~12月龄的体重。采用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy 3种生长曲线模型对湖羊的生长曲线进行拟合。结果发现,Logistic和Gompertz模型对湖羊生长发育的拟合效果较好,其值均高于0.97,其中以Gompertz为最优。利用最优拟合模型进一步分析模型拟合参数,湖羊在2月龄时出现生长拐点。
- 陈玲吕晓阳王庆增王翔宇苏锐殷金凤孙炜周洪孙伟
- 关键词：湖羊非线性模型
- 湖羊生长发育曲线模型预测及趋势分析
- 引言/目的动物生长曲线模型反映了动物个体在生长发育过程中某部分或整体的规律性的变化,其实质是把一系列日龄一体重数据压缩成为生长数学模型中的几个参数,有效消除部分试验误差的影响,具有非常实际的参考意义。目前用来反应动物生长...
- 吕晓阳陈玲王庆增王翔宇苏锐殷金凤孙炜周洪孙伟
- 文献传递
- 感染大肠杆菌F17湖羊羔羊脾脏中差异circRNA分析被引量：2
- 2019年
- 【背景】羊大肠杆菌病是一种以剧烈腹泻和败血症为特征的急性传染病,是规模化羊场最为常见高发的细菌性疾病之一,尤其是初生羔羊易被产肠毒素大肠杆菌(ETEC)感染,引起羔羊腹泻,又叫羔羊白痢,使养殖场遭受严重的经济损失。而传统的抗生素治疗方案存在诸多缺陷。【目的】本研究通过让湖羊羔羊口服大肠杆菌F17菌株获得不腹泻和腹泻的羔羊个体,筛选出服用大肠杆菌F17菌毛后不腹泻与腹泻型个体中差异表达的circRNA,进而探究circRNA在绵羊抗腹泻中的作用,从而发现与抗大肠杆菌病性状相关的候选基因。从circRNA层面上,加深对绵羊拮抗大肠杆菌F17菌株的认识,确定绵羊拮抗大肠杆菌F17菌株的功能基因。【方法】用CIRI软件从头预测circRNA,利用RNA-seq技术,首次筛选出感染大肠杆菌F17菌株后不腹泻与腹泻型羔羊个体脾脏中差异表达的(DE)circRNA,对差异表达转录本进行GO富集分析,结合GO注释结果对其功能进行描述。统计每个GO条目中所包括的差异转录本个数,并用Fisher's exact test计算每个GO条目中差异转录本富集的显著性。然后随机选择6个DE circRNA,利用q-PCR分别验证这6个DE circRNA在不腹泻和腹泻组羔羊脾脏内的相对表达水平,进而利用Miranda软件来预测与miRNA结合的circRNA以及miRNA的靶基因,根据miRNA靶基因的功能注释来阐明此部分circRNA的功能,分析circRNA-miRNA-mRNA相互作用,最后用q-PCR验证circRNA在不腹泻组和腹泻组羔羊体内的相对表达水平。【结果】绘制参考序列后,鉴定出已知的7 730个circRNA,DE circRNA与GO数据库进行比对,发现一共有60条circRNA被注释和分类到297个功能亚类中。利用RNA-seq在不腹泻和腹泻羔羊脾脏中筛选出60个差异表达的(DE) circRNA,其中31个上调和29个下调,用q-PCR验证随机选择的6个DE circRNA在不腹泻组和腹泻组羔羊体内的相对表达水平,发现与RNA-seq结果�
- 邹双霞金澄艳鲍建军王悦陈炜昊吴天弋王利宏吕晓阳高雯王步忠朱国强戴国俊师东方孙伟
- 关键词：湖羊
- 中国绵羊群体Fec^B基因遗传分化的研究被引量：2
- 2016年
- 为研究我国绵羊各地区Fec^B基因的遗传多样性,笔者采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对苏州湖羊、徐州湖羊、小尾寒羊、洼地绵羊、阿勒泰羊和中国美利奴绵羊的Fec^B基因座位进行了检测,引用其他绵羊品种资料辅助分析,并计算其平均杂合度,对其中立性测验的结果进行了相关分析。结果表明:(1)6个绵羊群体的Fec^B座位基因分化系数Gst=0.2937,说明有70.63%的变异是由群体内的遗传多态现象引起,而只有29.37%的变异来自群体间变异。(2)中立性检测的观察值均在L95和U95之间,表明Fec^B位点为中立性位点,其遗传多样性基本上未受选择等因素的影响。(3)Fec^B基因在地理分布上存在一定的规律,东部绵羊品种Fec^B的基因频率高于西部,东部由北向南依次递加。
- 吴天弋鲍建军吕晓阳李达孙伟
- 关键词：绵羊FECB基因
- 湖羊及其陶湖杂交一代若干经济性状的比较研究被引量：3
- 2014年
- 进行湖羊及陶湖杂交一代的部分生长发育性状、繁殖性状以及肉质性能的比较研究,旨在为湖羊品种的杂交改良提供参考依据。选择相同季节出生的湖羊以及陶湖杂交一代,在初生、2月龄、4月龄、6月龄和8月龄进行体重和体尺测量,对不同性别不同阶段间的生长发育性状进行比较,并对屠宰性能和肉质测定结果也进行比较分析。结果表明:陶湖杂交一代的体重、体长以及胸围均比湖羊有所提高,体重提高率公母羊分别为9.97%、4.36%,体长分别为2.92%、3.37%,胸围分别为7.09%、7.08%;但陶湖杂交一代的产羔率、产活率比湖羊有所降低,分别降低48.0个百分点和3.6个百分点。说明利用陶赛特羊可以明显提高湖羊的产肉性能以及产肉潜力,但在饲养管理上要求比湖羊高。该结果可为湖羊新品种的培育提供参考。
- 陈玲王庆增吕晓阳苏锐殷金凤谢丹阳孙炜周洪孙伟
- 关键词：湖羊生长发育肉质性能
- 湖羊羔皮毛囊候选miRNA在不同花纹间的表达与毛囊发育特性关联的研究被引量：1
- 2018年
- 【目的】通过前期高通量测序技术结合生物信息学分析研究湖羊大花、中花和小花羔皮毛囊间miRNA的差异表达,筛选出了14个候选miRNA,现进一步研究14个候选miRNA在不同花纹组间的表达量与毛囊各指标的相关性,以了解候选miRNA与毛囊发育特性间的关联,筛选用于后期功能验证的miRNA。【方法】利用高通量测序技术筛选湖羊大花、中花、小花不同花纹羔皮毛囊中的差异表达miRNA。利用与高通量测序同一批样品所提取的RNA进行RT-RCR验证,随机选取高通量测序结果中的5个差异表达miRNA,验证高通量测序结果的可靠性。通过荧光定量PCR技术检测14个候选miRNA在不同组别间的表达量,制作不同花纹羔皮组织的石蜡切片以评估不同毛囊的结构,并结合组织学观察与显微观测技术,采用SPSS 17.0分析14个候选miRNA的表达水平与毛囊组织学性质的相关性。【结果】湖羊毛囊成群分布,以3毛囊群的居多,直径较大的为中心初级毛囊,直径较小的为侧部次级毛囊。在显微镜相同视野中,湖羊大花、中花和小花3种不同类型花纹羔皮的初级毛囊数差异不显著(P>0.05),小花组的次级毛囊数多于大花组和中花组的次级毛囊数且差异极显著(P<0.01),中花组与小花组二者次级毛囊数相仿,差异不显著(P>0.05),在相同的单位面积中,小花的毛囊总数要高于大花组和中花组;大花组的初级毛囊直径比中花组和小花组的初级毛囊直径要大的多,与中花组和小花组的初级毛囊直径差异极显著(P<0.01),大花组的次级毛囊直径也比中花组、小花组的次级毛囊直径大,同时也与二者均呈极显著差异(P<0.01),中花组和小花组二者的初级毛囊直径以及次级毛囊直径均差异不显著(P>0.05);在已知的miRNA中,miRNA-143在大花组中的表达量与小花组差异极显著(P<0.01),miRNA-10a在小花组的表达量与大花和中花组差异显著(P<0.05),let-7i在大花组
- 金澄艳吕晓阳高雯王悦陈炜昊盛水兴陈玲林杰孙伟
- 关键词：毛囊MIRNA毛囊发育
- F17大肠杆菌在湖羊羔羊个体脾脏中LncRNA表达谱变化被引量：3
- 2019年
- 【目的】通过筛选对大肠杆菌(E.coli)F17菌毛非腹泻型与腹泻型的绵羊脾脏中差异表达的lncRNA,来探究lncRNA对绵羊抗腹泻的作用。【方法】本研究通过对湖羊羔羊口服E.coli F17菌株获得非腹泻和腹泻型个体,利用羔羊肠道细菌计数、病理组织切片验证攻毒成功性;构建非腹泻组和腹泻组羔羊脾脏的cDNA文库,使用Illumina HiSeq 2500平台进行配对测序;通过Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway富集分析对差异表达转录本功能描述和细胞通路分析,利用FPKM法估计lncRNA和mRNA转录物的表达水平,并用高通量测序技术RNA-seq筛选出非腹泻和腹泻个体脾脏中的差异表达lncRNA;然后利用荧光定量PCR技术检测了非腹泻组和腹泻组羔羊脾脏组织中DE lncRNA和DE mRNA的表达水平,来验证筛选的DE lncRNA在非腹泻组过程中发挥作用。【结果】羔羊口服E.coli F17菌株后,出现非腹泻和腹泻两种表型,腹泻组羔羊肠道中的细菌数量显著高于非腹泻组(P<0.05),同时腹泻组羔羊空肠黏膜组织出现不同程度的损伤,色泽暗沉,小肠绒毛部分脱落。笔者利用RNA-seq在非腹泻和腹泻羔羊脾脏中筛选出34个差异表达的(DE)lncRNA,703个的DE mRNA,随机选择一共12个DE lncRNA和DE mRNA,用q-PCR验证它们在非腹泻型和腹泻型羔羊体内的相对表达水平,发现与RNA-seq结果一致。通过Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway富集分析,将DE lncRNA与GO数据库进行比对的结果表明一共有34条lncRNA被注释和分类到302个功能亚类中,绵羊蛋白质结合(GO:0005515),细胞核(GO:0005634),poly(A)RNA结合(GO:0044822),细胞质(GO:0005737),组织重塑(GO:0048771),内肽酶活性的调节(GO:0052548)),6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-双磷酸酶复合物(GO:0043540),磷脂酰肌醇磷酸化(GO:0046854),果糖-2,6-二磷酸2-磷酸酶活性(GO:0004331),钙依赖性磷脂酶C活性(GO:0050429)等10个功能亚类的lncRNA较多,而其余的功能亚类的lncRNA分布较少。将DE lncRN
- 黄赛男金澄艳鲍建军王悦陈炜昊吴天弋王利宏吕晓阳高雯王步忠朱国强戴国俊孙伟
- 海门山羊、徐淮山羊两个产羔性状候选基因的遗传多样性及其与繁殖力的关联分析被引量：4
- 2016年
- 为海门山羊和徐淮山羊繁殖力标记辅助选择提供依据,以海门山羊(113只)和徐淮山羊(78只)为试验动物,将FSH-β和GDF-9基因第2外显子作为影响山羊产羔性状的候选基因,对其第2外显子进行扩增、测序、序列比对以及PCR-SSCP检测,探讨FSH-β和GDF-9基因第2外显子的遗传特征,寻找与产羔数相关的遗传标记。结果表明:FSH-β基因在海门山羊中有AA、AB、AC和CC 4种基因型,基因型频率分别为0.477 9、0.017 7、0.407 1和0.097 3。FSH-β基因在徐淮山羊中有AA、AB和AC3种基因型,基因型频率分别为0.397 7、0.477 3和0.125 0。GDF-9基因在海门山羊和徐淮山羊中有GG和GH 2种基因型,在海门山羊中基因型频率分别为0.539 8和0.460 2,在徐淮山羊中基因型频率分别为0.784 1和0.215 9。FSH-β基因在海门山羊产羔数中AC基因型最小二乘均值比AA型多0.160只,比AB型多0.250只,比CC型多0.300只,各基因型产羔数无显著差异。GDF-9基因在海门山羊产羔数中GH基因型最小二乘均值比GG型多0.179只,各基因型产羔数无显著差异。试验初步认为FSH-β和GDF-9基因不是影响海门山羊多胎性能的主效基因。
- 吕晓阳孙伟吕伟伟高雯于嘉瑞鲍建军王利宏王庆增李拥军张争劲胡永周洪徐厚生花卫华
- 关键词：海门山羊徐淮山羊多态性繁殖力
- 湖羊生长发育曲线模型预测及趋势分析
- 本文旨在研究湖羊的生长发育状况，初步探讨湖羊的生长发育曲线模型并作出趋势分析，并根据此模型建立的生长曲线为湖羊的选育和改善饲养管理提供依据，从而找出湖羊养殖的最佳生长点和上市点。
- 陈玲吕晓阳王庆增王翔宇苏锐殷金凤孙炜周洪孙伟
- 关键词：湖羊非线性模型
- 生物统计课程教学与研究生科研能力培养
- 2016年
- 生物统计与试验设计是农学类专业的专业基础课,是从事农业科学研究的专业基础工具,对研究生科研能力的培养具有重要作用,为了进一步提高本课程的教学效果,本文通过生物统计学教学方法、教学手段以及考核方式等方面进行总结和解析,以期对利用生物统计学培养研究生科研能力提供帮助.
- 孙伟吕晓阳
- 关键词：生物统计学教学
