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刘林: 作品数：124 被引量：287H指数：10; 供职机构：北京奶牛中心更多>>; 发文基金：北京市科技计划项目国家现代农业产业技术体系建设项目长江学者和创新团队发展计划更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>

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中国荷斯坦牛产后0～35d繁殖疾病遗传参数估计被引量：6: 2019年; 旨在估计中国荷斯坦牛产后0～35d的繁殖疾病遗传参数。本研究收集了1993-2017年间北京地区27个场中国荷斯坦牛产后0～35d25 026条繁殖疾病记录,统计分析发病规律,采用阈模型和线性模型,以场年、胎次和产犊季节为固定效应,个体加性遗传效应和永久环境效应为随机效应得到遗传参数来探究中国荷斯坦牛产后0～35d繁殖疾病遗传规律,同时尝试单独对子宫疾病进行遗传参数估计。结果显示,奶牛产后0～35d繁殖疾病记录占整个泌乳期繁殖疾病记录的54%;使用线性模型和阈模型所得奶牛产后0～35d遗传力分别为0.015 2(0.001 9)和0.094 4(0.01),使用SAS计算两个模型繁殖疾病EBV排名秩相关达95%(P<0.01);在繁殖疾病中,子宫疾病占48%,且主要集中于产后0～35d,利用线性模型估计得到产后0～35d子宫疾病遗传力为0.010 7(0.001 6)。根据线性模型得到的EBV计算繁殖疾病遗传趋势,发现自2000年以来,公母牛繁殖疾病、子宫疾病估计育种值均呈现下降趋势。本研究结果可为中国荷斯坦牛繁殖疾病的遗传育种工作提供参考。; 董祎鑫李想亓建刚罗汉鹏窦金焕刘林李锡智王雅春; 关键词：繁殖疾病子宫疾病

中国荷斯坦牛PIK3CB基因多态性及其与繁殖和产奶性状的关联分析被引量：3: 2022年; 【目的】探究磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚单位β(PIK3CB)基因多态性及其与中国荷斯坦牛繁殖和产奶性状的关系。【方法】通过混池测序对中国荷斯坦牛PIK3CB基因进行单核苷酸多态性(SNP)位点筛选,采用竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术在1 160头健康泌乳中国荷斯坦牛中进行SNP分型并进行群体遗传学分析,采用线性模型进行SNP与11个繁殖和产奶性状基于单位点和单倍型组合的关联分析。【结果】在PIK3CB基因中共检测到了17个SNPs,筛选出7个SNPs用于后续分析。关联分析发现,7个SNPs与多个目标性状存在显著或极显著的关联(P<0.05;P<0.01);位于外显子区域的g.130433743 A>G位点AA基因型个体和位于可变剪接区域的g.130448069 G>A位点GG基因型个体,其经产牛首末次配种间隔、产奶量、乳蛋白量和乳脂量最低,体细胞评分最高,上述基因型个体具有较短的首末次配种间隔,而产奶性能相对较差;g.130387717 G>A位点AA基因型个体,其初配日龄和青年牛首末次配种间隔最低,产奶量、乳蛋白量和乳脂量最高,该基因型个体的繁殖和产奶性能均较好,上述3个SNPs位点可作为中国荷斯坦牛繁殖和产奶性状的候选位点重点关注。单倍型分析发现,PIK3CB基因的g.130387717 G>A、g.130430832 A>-、g.130433743 A>G、g.130433982 C>T、g.130446073 C>T和g.130448069 G>A 6个SNPs紧密连锁形成一个单倍型块,且与多个目标性状存在显著或极显著关联(P<0.05;P<0.01),其中H2H3和H2H4单倍型组合个体的繁殖和产奶性能较好,为优势单倍型组合。【结论】中国荷斯坦牛PIK3CB基因存在丰富的遗传变异,其多态性与繁殖和产奶性状存在关联,g.130433743 A>G、g.130448069 G>A和g.130387717 G>A位点可作为潜在分子标记,为中国荷斯坦牛的平衡育种提供理论依据。; 徐昊祺许静漪胡丽蓉张帆罗汉鹏张海亮师睿李想刘林刘巧香郭刚王雅春; 关键词：中国荷斯坦牛繁殖性状产奶性状

奶牛胚胎早期死亡的转录组初探被引量：1: 2020年; 为了探讨奶牛胚胎早期死亡的分子机理,通过对奶牛8-细胞期和桑葚胚期死亡和正常的胚胎样本进行基因转录组测序,联合分析不同时期胚胎之间的差异表达基因,挖掘奶牛胚胎早期死亡的关键基因。本研究首先对单个卵裂球的mRNA进行了提取和反转录,其次成功建立了cDNA文库,并用Illumina高通量测序系统完成胚胎的测序,最后分析了不同时期胚胎的表达差异基因。得到如下结果:①成功利用单细胞RNA提取体系建立并扩增了不同时期胚胎的cDNA文库;②对8-细胞期差异表达基因进行分析,获得2倍以上差异基因157个,其中上调基因6个,下调基因151个;对桑葚胚期差异基因进行分析,获得2倍以上差异基因269个,其中上调基因10个,下调基因259个;③通过GO富集分析发现,正常胚胎和死亡胚胎的差异基因表现在细胞、繁殖过程和结合等方面;④通过KEGG分析,8-细胞期和桑葚胚期正常胚胎与死亡胚胎的差异基因主要表现在细胞凋亡信号通路和内质网蛋白合成通路上。; 吕小青刘林刘林王彦平薛建华麻柱; 关键词：奶牛体外受精早期胚胎转录组

拷贝数变异及其在奶牛育种中的研究现状被引量：3: 2012年; 拷贝数变异(copy number variation,CNV)作为结构变异的一种新形式,在品种多样性、生物进化和疾病相关性等研究中起着重要作用。本文主要介绍了CNV的相关概念、分类、作用机制等,并对近年来的研究进行了总结;简单介绍了目前检测CNV的常用技术和CNV在奶牛育种中的研究现状;阐述了当前CNV研究进展缓慢的部分原因,并对其与疾病、生物进化和物种多样性相关性研究的前景进行了一些展望。; 吴晓平刘林刘文娇王鹏孙东晓; 关键词：拷贝数变异奶牛育种

基于智能项圈系统荷斯坦牛发情相关指标的遗传参数估计及全基因组关联分析: 2023年; 【目的】探究基于奶牛智能项圈系统产生的发情指数和活动峰值指标的群体规律及其影响因素,对其进行遗传参数估计,并利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘与奶牛发情相关指标的遗传标记,以期为从遗传育种角度制定选育策略提高奶牛繁殖力提供有用信息。【方法】试验以北京市某规模化牧场健康的泌乳期荷斯坦牛为研究对象,收集了该牧场2017年7月至2020年5月2 074头泌乳牛的发情记录,包括发情指数和活动峰值,同时收集了试验牛的产犊记录;采用SAS 9.4中MIXED过程,分析了非遗传因素对发情指数和活动峰值的影响;基于DMU软件DMUAI模块,使用双性状动物模型估计了发情指数与活动峰值的遗传力及遗传相关,并计算了发情指数与常规繁殖性状的近似遗传相关;以逆回归育种值为关联分析的表型,利用Farm CPU软件分别对发情指数和活动峰值进行了GWAS。【结果】荷斯坦牛发情指数为(71.77±19.13)au,活动峰值为(105.94±30.73)au/2h。发情指数遗传力为0.04±0.01,活动峰值遗传力为0.19±0.04,均为低遗传力性状;发情指数与活动峰值之间的遗传相关为0.45±0.03;发情指数与经产牛首末次配种间隔、首次产犊日龄和青年牛首末次配种间隔的近似遗传相关分别为0.37、-0.41、-0.55。两个性状的GWAS共找到7个在全基因组水平上显著的SNP位点,分别位于7条染色体上,显著位点附近(300 kb内)共发现基因31个。【结论】通过项圈系统获得的发情指数和活动峰值是可遗传的,两者之间存在中等遗传相关,活动峰值为中低遗传力,且能够一定程度上反映奶牛的发情指数,活动峰值和发情指数为研究奶牛的发情行为以及提高母牛的繁殖力提供了新的方向。GWAS鉴定到的候选基因PTGS1(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase1)和NDUFA8(Ubiquinone Oxidoreductase Subunit A8)的功能与供体胚胎总数有关,VEGFA(Vascular End; 杨明路张海亮罗汉鹏黄锡霞张翰林章施施王炎刘林郭刚王雅春; 关键词：繁殖性状全基因组关联分析

杂交繁育在奶牛生产中的应用与探讨被引量：4: 2010年; 在奶牛业长期发展和选育过程中,对奶牛单产的片面追求,导致奶成分比例降低,牛群健康、繁殖等次级性状下降。因此提高群体的综合生产性能及经济效益已成为目前奶牛生产的首要问题。杂交繁育能够结合不同品种的优点、利用杂种优势,提高奶牛群总体经济效益,因而备受奶牛业的关注。本文从不同重要经济性状角度介绍了奶业发达国家对奶牛杂交繁育的研究结果,并探讨了奶牛杂交繁育体系在我国的应用。; 王婷初芹刘林王雅春张沅; 关键词：杂交杂种优势经济性状奶牛

荷斯坦牛新遗传缺陷单倍型HH7分子筛查: 2021年; HH7(Holstein Haplotype 7)是在荷斯坦牛群中新发现的一种隐性遗传缺陷单倍型,由27号染色体上CENPU基因4个碱基缺失突变引起,隐性基因纯合时能引起胚胎早期流产,严重影响着奶牛养殖者的经济效益。本研究利用竞争性等位基因特异性PCR(KASP法)对随机抽取的166头荷斯坦公牛样本进行了检测分析,结果表明,在所检测的荷斯坦公牛中未发现HH7携带者个体。提示新缺陷单倍型HH7在北京地区的荷斯坦牛群中比例可能很低,但在全国牛群中的分布情况尚不清楚,建议继续开展相关研究,并在种牛遗传物质引进时重点关注,避免将新缺陷基因引入进来,造成有害基因的广泛传播。; 李艳华吕小青吕小青刘林王丽云; 关键词：荷斯坦牛单倍型

基于高效液相色谱的对乳制品中β-酪蛋白分型的方法: 本发明涉及一种基于高效液相色谱的对乳制品中β‑酪蛋白分型的方法，包括如下步骤：S1：制备β‑酪蛋白标准品；S2：制备β‑酪蛋白样品；S3：制备第一流动相和第二流动相；S4：在液相色谱仪中进样样品后，不同时间以不同浓度比例...; 刘林吕小青赵凤水明赵凤茹王彦平李艳华张建聪曾伊凡李智洋高耀超; 文献传递

一种用于检测牛GART突变基因型的引物对和检测方法: 本发明涉及分子生物学，具体提供了一种用于检测牛GART突变基因型的引物对，所述引物对如SEQ ID No.1-2所示。本发明进一步提供了一种检测牛GART突变基因型的方法，包括PCR扩增、扩增产物酶切和电泳检测酶切产物，...; 张毅劳兰兰刘林石万海孙东晓俞英王雅春张胜利; 文献传递

低温条件下混合乳酸菌制剂对芦苇发酵品质的影响被引量：21: 2011年; 为探讨低温条件下混合乳酸菌制剂对芦苇(Phragmites australis Cav.Trin.ex Sterd.)发酵品质的影响,对含水量为40%的芦苇添加混合乳酸菌制,分别设计4℃和0℃的发酵温度,密封发酵,分别取3,4,5,6,7和8周的发酵样品分析。结果表明:在0℃条件下,发酵后第5周pH值出现显著下降(P<0.05),第8周NDF含量显著降低(P<0.05)。在4℃条件下,发酵第3周起pH值一直保持在4.20以下。在相同发酵时间内,4℃条件比0℃条件时的pH值显著降低(P<0.05),乳酸菌数量、乳酸产量显著提高(P<0.05),乙酸产量显著降低(P<0.05)。在低温条件下,对每克干物质添加6.63(lg CFU.g-1DM)的混合乳酸菌,可使含水量为40%的芦苇启动发酵。为保证得到优良发酵质量,发酵时间应在6周以上。; 王鹏白春生刘林曹兵海; 关键词：温度乳酸菌制剂发酵时间青贮品质

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