陈彦涛
- 作品数：9 被引量：14H指数：3
- 供职机构：深圳大学化学与化工学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省教育厅优秀人才培养基金上海市科学技术发展基金更多>>
- 相关领域：理学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 肿瘤相关蛋白复合物的分子模拟及其结合机制分析
- 陈彦涛李文飞张建王俊王炜
- 关键词：肿瘤蛋白质复合物分子模拟MM-PBSA
- 高分子链坍塌转变动力学过程的动态蒙特卡罗模拟被引量：5
- 2009年
- 基于键长涨落格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,引入疏水相互作用,对均聚高分子链坍塌转变动力学过程进行了模拟研究.模拟发现,其坍塌时间呈高斯分布,而平均坍塌时间随淬火深度的变化类似于蛋白质折叠,但难以发现局部最小;另外,平均坍塌时间随链长呈指数形式变化.在其坍塌动力学过程中,高分子链构象先由橄榄球状演变为项链状,进而演变为香肠状,最后形成近球状的熔融球;基于团簇数目、团簇大小和非球面参数等参量,对前人提出的动力学过程四阶段划分进行了更为清晰的界定.
- 陈彦涛丁建东
- 关键词：动力学过程
- 组织工程水凝胶的相转变和粘弹性研究
- 可注射性的聚合物水凝胶可以避免致孔,提供了一大类新型组织工程材料.本文探讨了相关的凝胶化过程以及细胞与水凝胶相互作用,着重考察了相关凝胶的相转变、相结构以及含细胞的水凝胶的粘弹流变行为.
- 张欢纪仕辰段世锋朱文陈彦涛吕文琦丁建东
- 关键词：水凝胶组织工程材料相结构
- 文献传递
- SARS病毒E蛋白的计算机模拟的初步研究被引量：5
- 2003年
- 以粗粒化的多肽链模型进行了 SARS病毒包膜中 E蛋白的计算机模拟 ,描述了该蛋白质空间构象的概貌 .首先扩展了多肽链的 HP模型 ,使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为 ,并且考虑了全部氨基酸残基疏水相互作用能的差异 .相关格子链的 Monte Carlo模拟显示了很高的计算效率 .模拟再现了蛋白质的 coil-globule转变 ,验证了蛋白质序列分布的重要性 .结果表明 ,在水环境中 ,E蛋白质空间结构由紧致的疏水内核和部分向外延伸的亲水片段组成 ;在脂环境中 ,中部疏水片段会成为向外延伸的环 ,而当两侧紧致的亲水片段分开时 ,则形成桥 .
- 陈彦涛罗钟琳丁建东
- 关键词：SARS病毒E蛋白计算机模拟蛋白质折叠非典型肺炎
- 蛋白质折叠的格子链Monte Carlo模拟
- 蛋白质折叠的理论与模拟研究是分子生物学、高分子科学与统计物理相交叉的领域。从高分子科学的角度来看，蛋白质的折叠过程可以理解为一类特殊的高分子从其无规线团状态演变为相对紧致有序的熔球状态的过程。链状分子的折叠过程复杂，而且...
- 陈彦涛
- 关键词：蛋白质折叠膜蛋白
- 文献传递
- 微型有机化学实验教学的改革与实践被引量：5
- 2010年
- 通过对微型有机化学实验的优势进行分析,探讨了微型有机化学实验在教学实践中存在的问题和对策,初步摸索出微型有机化学实验教学改革的课程设置原则和方案。通过合理地设置常量和微量化实验课程,在教学实践过程中把基本操作实验和以及综合设计研究型实验很好的衔接起来。不仅能使学生掌握基本的实验操作技能,还提高了学生对有机化学实验的兴趣和学习积极性,培养了进一步综合设计研究的能力,树立了环保意识和社会责任感。
- 王海滔余振强陈彦涛吕广辉刘波
- 关键词：微型化有机化学实验教学改革
- 隐式生物膜模型及E蛋白折叠模拟
- 2010年
- 受计算速度所限,现有生物膜模拟多集中于膜内多肽链片断,对膜两侧的多肽链片断关注较少.通过构建隐式生物膜模型,在格子空间中针对传染性非典型肺炎冠状病毒E蛋白的全序列进行模拟研究.结果表明,E蛋白在折叠过程中存在两个明显的热力学转变:从无规线团开始,生物膜内较强的氢键相互作用促使螺旋形成,导致coil-helix转变;在疏水相互作用下,膜两侧水溶液中的多肽链片断发生坍塌,导致coil-globule转变;最后形成稳定的跨膜构象,且跨膜序列与已有的预测结果基本符合.相关模拟手段体现了很高的计算效率,为后续的膜蛋白聚集体模拟研究提供了可行方法.
- 陈彦涛刘剑洪
- 关键词：膜蛋白蛋白质折叠
- 有机化学实验的教学体会及改革探索
- 2010年
- 文章基于个人的教学及科研理念,阐述了有机化学实验教学过程中的一些体会及改革尝试。引导学生认识每种实验手段的局限性,并针对特定实验目的改善实验流程;把各种有机实验类型联系起来,利用综合性实验,强化学生完整实验流程的概念;简化考核方式,减少学生实验劳动量,促使学生在掌握基本操作技能的同时,培养全面、综合性的思维方式。上述尝试在教学过程中取得了不错的效果。
- 陈彦涛余振强王海滔刘波
- 关键词：有机化学实验教学体会
- 非天然相互作用对均聚多肽链螺旋形成动力学过程的影响的计算机模拟研究被引量：1
- 2010年
- 以螺旋结构的形成过程为研究对象,基于粗粒化的格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,初步探讨了非天然氢键相互作用对均聚多肽链螺旋折叠动力学过程的影响.研究发现,非天然氢键的引入虽然延缓了其热力学转变的发生,但也从整体上降低了折叠动力学过程的能垒,在某一特定温度之下,反而可以提高折叠速率.对其折叠路径分布的分析表明,非天然氢键可以减少慢速折叠路径的发生,而后者是导致折叠时间增加的主要因素.另一方面,比较特定温度下多肽链链构象及螺旋片断随时间的演化进程,发现非天然氢键在一定程度上影响了天然氢键的形成以及天然态构象的稳定存在,同时也加快了其部分解折叠过程.这说明,非天然相互作用的存在有利于蛋白质构象的快速动态调整,从而行使其相应的生物功能.
- 陈彦涛丁建东
- 关键词：动力学过程
