郑小敏
- 作品数:6 被引量:30H指数:4
- 供职机构:重庆师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金重庆市自然科学基金重庆市教育委员会科学技术研究项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 芸薹属大白菜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析被引量:7
- 2012年
- Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的3类基因家族之一。现主要从基因组水平研究白菜Aux/IAA基因的分布及特征。结果表明:从BRAD共检测到59条白菜Aux/IAA基因,不均等分布在白菜的全部10条染色体上。通过多重比对和基序探测结果显示,40条白菜Aux/IAA基因具有4个保守基序,其它基因的保守基序则有不同程度的分化。系统进化分析表明,Aux/IAA基因家族可分为7个亚家族。通过表达模式预测发现,白菜Aux/IAA基因家族表达模式也有较大差异。
- 郑小敏赵敬会李荣冲王瑞雪张涛
- 关键词:生长素生物信息学分析
- 甘蓝型油菜防御素基因的克隆与生物信息学分析
- 2015年
- 为了研究甘蓝型油菜防御素基因的结构和功能,根据白菜防御素基因序列设计引物,采用RTPCR方法从甘蓝型油菜中克隆到4个防御素基因,并对其序列进行了生物信息学分析。结果表明,甘蓝型油菜防御素基因c DNA全长325~335 bp,包含231~243 bp的开放阅读框,编码76~80个氨基酸;防御素基因在长期进化过程中产生了显著的差异,但防御素含有的8个保守半胱氨酸残基均稳定存在;Bndef1、Bndef2、Bndef3与萝卜Rs-AFP1、诸葛菜Omdef亲缘关系较近,Bndef4与豇豆Vudef亲缘关系较近;4个防御素蛋白均为稳定蛋白,具有信号肽结构,可能为分泌蛋白。
- 高天姝郑小敏郭楠白瑞英黄兴琳陆俊杏龚慧明张涛
- 关键词:甘蓝型油菜植物防御素克隆生物信息学分析
- 甘蓝型油菜高效离体再生体系的建立被引量:13
- 2013年
- 以甘蓝型油菜(Brassica napusL.)HC8为材料,从无菌苗苗龄、预培养基激素浓度、预培养天数、6-BA及NAA的浓度等方面对影响油菜组织培养的因素进行了分析研究,建立了甘蓝型油菜品系HC8的离体再生技术体系。结果表明,该油菜组织培养的最佳苗龄为5 d;最佳预培养时间为5 d,最佳2,4-D浓度为1.0 mg/L;子叶最佳诱导培养基为MS+2.0 mg/L 6-BA+0.05 mg/LNAA+3.5 mg/L AgNO3或MS+3.0 mg/L 6-BA+0.1 mg/L NAA+3.5 mg/L AgNO3,该条件下子叶愈伤组织诱导率最高可达100%,再生频率及分化频率分别可达88.0%和108.33%;下胚轴最佳诱导培养基为MS+4.0 mg/L 6-BA+0.05 mg/L NAA+3.5 mg/L AgNO3,子叶愈伤组织诱导率最高可达95.24%,再生频率及分化频率分别可达81.82%和104.55%;最佳生根培养基为MS+0.5 mg/L NAA,生根率最高为90.0%。
- 杨长友袁中厚郑小敏张涛
- 关键词:甘蓝型油菜愈伤组织诱导离体再生芽分化
- 白菜防御素基因的预测及结构功能分析
- 2012年
- 采用生物信息学的方法,通过已知防御素基因家族基因氨基酸序列在线Blast相似性比对,对白菜(Brassicarapa)基因组中防御素基因进行了预测和鉴定,分析了防御素基因在进化过程中各部分结构,包括上游区域、启动子区域、外显子区域、内含子区域以及UTR区域的结构变异以及功能变异,对该基因上游序列顺式作用元件和表达模式进行了预测。分析结果表明,白菜防御素基因编码60~80个氨基酸短肽,编码氨基酸均具有8个保守的半胱氨酸;白菜防御素基因功能结构域保持相对稳定,但部分基因成员前端信号肽序列出现变异;内含子长度出现增长、缩短、消失等3种变异模式;该基因上游启动子区域核苷酸变异较其他区域显著,上游序列顺式作用元件大多与光应答、逆境胁迫应答和信号分子应答相关。该基因表达模式预测结果表明白菜防御素基因在进化过程中可能出现分化,主要体现在基因沉默和表达部位的差异。
- 王瑞雪沈亮余赵敬会李荣冲郑小敏张涛
- 关键词:白菜防御素基因重复进化
- 甘蓝型油菜防御素基因的克隆与表达分析被引量:5
- 2015年
- 植物防御素具有广谱抗菌活性,不仅具有抗真菌、抗细菌、蛋白酶抑制和昆虫淀粉酶抑制等活性,而且参与调节植物的生长和发育。本研究根据白菜防御素基因序列设计引物,从甘蓝型油菜中克隆获得5个防御素基因,其c DNA全长325~461 bp,含有177~243 bp开放阅读框,编码58~80个氨基酸,含有8个保守Cys残基,具备Knot1功能域。系统进化分析表明,Bn PDF2.1、Bn PDF2.3、Bn PDF2.5与拟南芥PDF2亲缘关系较近,可能具有蛋白酶抑制活性。荧光定量分析表明,防御素基因具有组织表达特异性,在花蕾和叶中表达量较高,角果中次之;经1 mmol L–1水杨酸处理开花期油菜2 h后,防御素基因在茎、花蕾、角果中的表达量均有不同程度的上调,但在叶中表达有所下调,在根中表达无明显变化。
- 郑小敏郭楠高天姝龚慧明张涛
- 关键词:甘蓝型油菜防御素基因克隆水杨酸
- 紫苏种子发育过程中脂肪酸组分变化研究被引量:5
- 2013年
- 以野生紫苏与栽培紫苏为材料,通过气相色谱对2个紫苏品种种子发育过程中脂肪酸组分的含量及其变化进行了研究。结果表明:紫苏种子脂肪酸主要由棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸和α-亚麻酸5种成分组成,不饱和脂肪酸占总脂肪酸的90%左右,其中α-亚麻酸含量最高,达60%以上。种子发育过程中棕榈酸、硬脂酸和油酸含量相对较为稳定,亚油酸含量随种子发育逐渐降低,而α-亚麻酸含量随种子发育不断增加直至成熟,占总脂肪酸的60%以上。
- 袁中厚杨长友郑小敏张涛龚慧明罗安才
- 关键词:紫苏种子发育Α-亚麻酸