秦洪强
- 作品数:34 被引量:21H指数:3
- 供职机构:中国科学院大连化学物理研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金创新研究群体科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:理学生物学医药卫生一般工业技术更多>>
- 基于固定化金属离子亲和色谱法富集实现血浆中D-二聚体定量的方法
- 本发明涉及一种基于固定化金属离子亲和色谱法(immobilized metal affinity chromatography,IMAC)富集实现对血浆中D‑二聚体质谱定量的方法。取D‑二聚体血浆样品,酶解得到血浆蛋白酶...
- 叶明亮张娜秦洪强
- 一种低丰度蛋白质翻译后修饰组的直接质谱检测方法
- 本发明涉及一种基于模拟靶向的低丰度蛋白质翻译后修饰组质谱检测方法。该方法首先使用数据依赖质谱采集模式获得的鉴定结果,从中挑选样品中潜在的、低丰度低可信度的发生翻译后修饰的多肽并构建靶标清单;再使用靶向蛋白质组技术中的平行...
- 叶明亮吕佳纹秦洪强
- 文献传递
- 修饰蛋白质组学分离鉴定新技术新方法被引量:3
- 2013年
- 蛋白质翻译后修饰(PTMs)是对基因产物蛋白质进行共价加工的过程,它是生命体在有限基因数目的条件下进行复杂生理学过程调控的重要原因.生物体内多达300种的翻译后修饰在细胞周期调控、信号传导及免疫应答等众多生命活动中发挥着关键作用.由于大多数翻译后修饰的蛋白质通常具有丰度低、动态范围宽以及结构复杂等特点,因此对蛋白质翻译后修饰进行规模化分析面临着巨大的挑战.基于生物质谱技术的修饰蛋白质组学分析方法的出现为翻译后修饰蛋白质的高通量分析提供了前所未有的发展契机,翻译后修饰蛋白质的规模化分析鉴定,已经成为蛋白质组学研究的核心内容之一.本文主要针对修饰蛋白质组学常用分析方法,包括翻译后修饰蛋白质的富集策略、分级方法、质谱鉴定技术和定量分析技术的最新研究进展进行介绍,并对其发展前景进行展望.
- 宋春侠孙珍秦洪强叶明亮张丽华张玉奎邹汉法
- 关键词:修饰磷酸化糖基化蛋白质组学
- 低丰度蛋白质翻译后修饰的分析新方法
- 学层次研究蛋白质翻译后修饰可以在全局、系统的层面理解翻译后修饰调控生物过程的规律.尽管蛋白质组学技术在揭示蛋白质磷酸化、N-糖基化、乙酰化等高丰度翻译后修饰方面已经取得了很好的效果,但是对一些低丰度的翻译后修饰目前还缺少...
- 董铭铭秦洪强王科云邓真真叶明亮邹汉法
- 关键词:蛋白质翻译后修饰酪氨酸磷酸化
- 基于超滤辅助酶解提高样品中D-二聚体质谱检测灵敏度的方法
- 本发明涉及一种基于超滤辅助酶解来提高样品中D‑二聚体蛋白质谱检测灵敏度的方法。取D‑二聚体样品,变性之后,转移到分子截留量小于4K的超滤管内,胰蛋白酶酶解过夜,离心去除分子量小于超滤膜分子截留的肽段同时用缓冲液清洗,收集...
- 叶明亮张娜秦洪强
- 提高N-连接完整糖肽鉴定准确性的母离子特征筛选策略
- 2023年
- 将糖链设置为糖基化位点上的可变修饰是鉴定完整糖肽的常见策略。可变修饰策略的检索性能依赖设置的糖库,糖库越大,产生的随机匹配越多,则完整糖肽鉴定的准确性越差。随机匹配的完整糖肽会造成母离子质荷比的分配发生同位素偏移,进而影响糖链部分的鉴定。由于可变修饰检索只考虑肽段的碎裂,而忽略糖修饰碎裂产生的糖碎片离子,因此,该方法仅依赖二级质谱图信息无法系统地对母离子和完整糖肽的匹配进行评估与考察。基于一级质谱图的母离子特征(如流出曲线、强度分布等信息)可实现对鉴定结果的筛选,排除母离子同位素偏移导致的错误鉴定,提高完整糖肽结果的准确性。本方法通过母离子特征筛选,在同位素标记的酵母标准数据集中将鉴定假阳性率从11.31%降至4.15%。小鼠组织样品的数据处理结果表明,该方法可用于提升复杂体系中完整糖肽鉴定的准确性。
- 方正秦洪强叶明亮
- 关键词:蛋白质组学数据检索
- 基于固定化金属离子亲和色谱法富集实现血浆中D-二聚体定量的方法
- 本发明涉及一种基于固定化金属离子亲和色谱法(immobilized metal affinity chromatography,IMAC)富集实现对血浆中D‑二聚体质谱定量的方法。取D‑二聚体血浆样品,酶解得到血浆蛋白酶...
- 叶明亮张娜秦洪强
- 文献传递
- 蛋白质糖基化分析新方法研究
- <正>作为最重要的翻译后修饰之一,蛋白质糖基化在多种生物学功能和生物过程中发挥着关键作用,包括蛋白质折叠、信号转导、细胞通讯、细胞凋亡等,而糖链结构的异常变化如核心岩藻糖化和末端唾液酸化等则与多种疾病和癌症密切相关[1,...
- 秦洪强程凯朱俊由昕毛家维叶明亮邹汉法
- 关键词:蛋白质糖基化
- 文献传递
- 一种基于化学酶促的人血清O糖基化鉴定方法
- 本发明涉及一种粘蛋白型O‑连接糖基化(O‑GalNAc型)检测方法。本发明基于生物酶选择性氧化‑生物正交化学反应相结合的策略,利用半乳糖氧化酶将半乳糖6‑羟基特异性氧化为醛基,并通过酰肼化学实现了糖肽的特异性捕获与释放,...
- 叶明亮由昕秦洪强
- 文献传递
- 一种高通量富集和鉴定内源性N/O-连接糖肽的方法
- 本发明涉及一种基于体积排阻色谱和亲水作用色谱的内源性N‑/O‑连接糖肽的富集和检测方法,并用于肿瘤早期诊断。该发明包括以下四个步骤:1)去除高丰度蛋白质,利用高温变性和体积排阻效应,有效降低蛋白质非特异性吸附并去除干扰蛋...
- 叶明亮王舒越秦洪强王璐陈尧
- 文献传递