秦剑秋
- 作品数：47 被引量：179H指数：8
- 供职机构：南宁市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广西南宁科学研究与技术开发计划项目国家自然科学基金广西卫生厅科研项目更多>>
- 相关领域：医药卫生交通运输工程机械工程农业科学更多>>
- 2007年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒抗原性及血凝素重链区基因特性分析被引量：2
- 2010年
- 目的:了解南宁市A(H3N2)亚型流感病毒血凝素的抗原性和基因变异情况。方法:对分离到的A(H3N2)亚型流感病毒进行单向HI试验分析抗原性,并按不同时间、不同人群选取35株进行血凝素核苷酸全长序列测定,推导出其氨基酸序列,重点对血凝素重链区进行基因特性分析。结果:单向HI试验表明,2007年度南宁市分离到的A(H3N2)亚型流感病毒抗原性与2004年WHO推荐株A/福建/411/2002(H3)相比,后者HI效价比前者高4倍以上;与2007年国内代表株A/江西东湖/312/2006(H3)相比,HI效价无≥4倍差异。核苷酸和氨基酸序列分析结果表明,与A/福建/411/2002(H3)相比核苷酸和氨基酸同源性分别为97.99%和97.81%,平均替换数分别为19.8个和7.2个,涉及2个抗原决定簇和受体结合位点左侧壁;与A/江西东湖/312/2006(H3)相比核苷酸和氨基酸同源性均为98.40%,平均替换数分别为15.8个和5.2个,涉及2个抗原决定簇。结论:2007年南宁市分离的A(H3N2)亚型流感病毒已发生抗原漂移。
- 秦剑秋刘海燕林新勤范云燕黄莉
- 关键词：流感病毒血凝素抗原
- 南方少数民族地区特色食品安全风险防控关注点被引量：1
- 2020年
- 目的了解少数民族地区特有(传统)的加工方法下特色食品的安全隐患,更好地指导风险防控。方法数据来源于2014年-2018年广西首府城市食品安全风险监测,对当地传统和特色食品进行风险分析。结果鲜湿米粉含铝食品添加剂超标率为12.15%、二氧化硫为11.21%、硼砂为1.35%;淡水鱼及鱼生华支睾吸虫检出率为4.39%,其中鱼生的检出率为(1.37%)低于整鱼(6.01%),差异有统计学意义(χ^2=12.46,P <0.01)。副溶血性弧菌检出率9.76%(12/123),沙门菌为2.67%(2/123)。氯霉素超标率为28%(35/125)、孔雀石绿超标率为1.09%(1/92);散装花生油黄曲霉毒素B1超标率为35.17%(121/344)且最大超标48倍,定型包装的花生油未超标。散装和定型包装的花生油增塑剂(DEHP和DBP)超标率为3.61%~12.05%;五色糯米饭人工色素、铝、硼砂等均未超标,食用风险较低;狗肉中检出氰化物,提示有毒物毒杀犬只的行为。结论超范围使用添加剂、食品中添加非食用物质、水产使用抗生素、花生油真菌毒素污染为该市特色食品安全的突出风险点。需加快地方特色性食品地方标准的制定,同时加强风险防控,切实保障当地食品安全。
- 张静施向东庞洁秦剑秋
- 关键词：食品安全少数民族
- 南宁市HIV-1/AIDS人群治疗前pol区遗传特性及蛋白结构分析
- 2019年
- 为探讨南宁市某县艾滋病病毒1型(HIV-1)感染人群中治疗前pol区遗传特性及蛋白结构变化情况,本研究通过RT-PCR扩增pol区部分序列并进行测序,将序列同源比对构建系统进化树;分型确定毒株亚型和斯坦福大学HIV耐药性数据库比对,分析耐药相关位点;SWISS-MODEL蛋白质同源数据库进行建模分析氨基酸的突变对蛋白质结构和功能的影响。本研究在90份HIV-1标本中获得46个pol区有效序列,共发现4种亚型,其中CRF01_AE占76.08%(35/46)、CRF08_BC占15.22%(7/46)、CRF07_BC占(3/46)6.52%、CRF59_01B1占2.17%(1/46);46个序列中有4例(8.69%)出现耐药突变位点,没有针对核苷酸反转录酶抑制剂(NRTI)的耐药突变;针对蛋白酶类抑制剂(PIs)1例,PR蛋白酶的柔性部位I47V位点发生突变,β折叠结构的I84V位点发生突变,都是异亮氨酸突变为缬氨酸;针对非核苷酸反转录酶抑制剂(NNRTI)有3例,2例位于活性中心的Y181C位点由酪氨酸突变为半胱氨酸,1例位于转角处的E138G位点由谷氨酸突变为甘氨酸。研究表明,南宁市某县HIV-1病毒CRF01_AE重组亚型比例最大,未经抗病毒治疗HIV1感染者中已经出现pol区耐药突变株,突变位点主要位于活性中心及柔性部位,传播水平已经处于中等流行状态。深入分析蛋白质与抑制剂相互作用机制,有助于为艾滋病抗病毒及耐药性监测方案提供科学依据。
- 裴建新唐驰秦剑秋潘海西栾苑周吉
- 关键词：人类免疫缺陷病毒1型耐药性突变同源建模蛋白结构
- 两种HIV筛查试剂的比较及首次CD4+T淋巴细胞检测结果分析被引量：3
- 2020年
- 目的比较两种人类免疫缺陷病毒(HIV)筛查试剂在南宁市无偿献血人群中的筛查效果,并进行首次CD4+T淋巴细胞检测,为制定合理的血液筛查提供参考依据。方法采用两种酶联免疫吸附试验(ELISA)对2017—2019年南宁中心血站送检的HIV筛查有反应的标本进行复检。其中一种使用进口的第4代抗原抗体联合检测试剂,另一种采用国产的第3代抗体检测试剂。当一种和/或另一种试剂有反应时,则用免疫蛋白印迹试验(WB)进行进一步确证,并对部分送检的抗凝全血标本进行CD4+T淋巴细胞计数。结果共收集到398份送检标本,复检有反应标本共356份,其中对进口第4代试剂和国产第3代试剂有反应的样本分别为309和129份,两种试剂均有反应的样本共122份。WB结果表明,两种试剂复检均有反应且样本吸光度值/临界值(S/CO)>5的HIV-1抗体阳性样本为68份(占19.10%),HIV抗体不确定样本为13份(占3.65%),HIV抗体阴性样本为275份(占77.25%)。CD4+T淋巴细胞计数检测结果显示,WB结果为阳性、不确定和阴性标本CD4+T淋巴细胞均值分别为(309.46±135.69)、(405.42±203.17)和(710.14±263.84)个/μL。结论HIV第四代抗原抗体试剂比第三代抗体诊断试剂敏感,但特异性比第三代试剂差,CD4+T淋巴细胞计数检测可以作为HIV感染的辅助诊断。
- 黄秋芳张玲玲潘海西秦剑秋栾苑
- 关键词：人类免疫缺陷病毒无偿献血人群
- 肠道病毒及其实验室诊断概况
- 2011年
- 在对肠道病毒病原学及实验室诊断方法进行综述的基础上,分析了目前各种实验室诊断技术的优缺点,针对该病毒的特点并结合实际工作需要,进一步指明了在诸多实验室诊断技术中以现代分子生物学技术为检测技术的发展方向。
- 秦剑秋
- 关键词：实验室诊断技术
- 2011—2013年南宁市服务业从业人员体检沙门氏菌检查结果分析被引量：8
- 2015年
- 目的了解南宁市服务业从业人员沙门氏菌感染情况,为沙门氏菌感染防控提供参考依据。方法对2011—2013年南宁市服务业从业人员沙门氏菌检测的结果进行统计分析。结果 2011—2013年共检测从业人员280 763人,检出沙门氏菌感染3 278人,年度感染率分别为1.59%、1.40%和0.57%。其中女性感染率1.21%,高于男性1.10%(χ2=6.61,P<0.05);一至四季度的感染率分别为0.57%、1.31%、1.72%、0.61%;不同行业从业人员沙门氏菌感染率差异无统计学意义(χ2=0.33,P>0.05),各年龄段的感染率差异也无统计学意义(χ2=5.89,P>0.05)。结论南宁市服务业从业人员沙门氏菌感染率呈逐年下降趋势,女性感染率高于男性,以第三季度感染率最高。
- 陆鸿燕刘海燕秦剑秋覃巍巍黄汝忠陆莹
- 关键词：沙门氏菌感染率
- 南宁市1株人感染高致病H7N9禽流感病毒遗传特性分析
- 2018年
- 目的通过对广西省南宁市2017年首例人感染高致病H7N9禽流感病毒株血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)基因测序,从分子水平分析毒株的溯源及遗传特性。方法通过RT-PCR扩增H7N9禽流感毒株HA基因和NA基因并测序,经NCBI数据库BLAST比对,利用MEGE 5.1等软件构建进化树及统计蛋白关键位点的变异情况。结果系统进化树表明中国H7N9毒株HA基因与NA基因主要为2个类群,长三角分支和珠三角地区分支,南宁毒株A/Nanning/01/2017(H7N9)HA和NA基因均在珠三角分支上,与广东毒株高度同源。病毒HA蛋白裂解位点插入4个氨基酸由PEIPKGR↓GLF突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,含有5个碱性氨基酸,使其具有高致病性禽流感病毒的分子特征;毒力相关位点225由天冬氨酸(D)突变为甘氨酸(G)(D225G),毒力增强;受体结合186位点由甘氨酸(G)突变为缬氨酸(V)(G186V);飞沫传播关键氨基酸位点没有发生突变组合;糖基化位点高度保守。NA蛋白丢失5个氨基酸,毒力可能增强,耐药性位点、糖基化位点均相对保守,未发生突变。结论南宁市人感染H7N9禽流感病毒可能来源于广东省珠三角地区禽类的感染,人传人的可能性不大,对NA抑制剂药类敏感,但毒株已经具有高致病性禽流感病毒的分子特征,毒力增强。南宁市外环境已经检测到H7N9核酸阳性标本,提示需要加强监测有效防控传染源。
- 裴建新秦剑秋农皓詹鑫婕杨丞何冰刘海燕
- 关键词：高致病性
- 南宁市2007～2009年H3N2亚型流感病毒NA基因变异分析
- 2012年
- 目的对2007～2009年度南宁市流行性感冒病毒NA序列分析,阐明NA基因变异和进化特征。方法提取2007～2009年30株（每年10株）H3N2亚型病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,利用VectorNTI9.0对测序结果分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树。结果南宁市2007～2009年H3N2亚型流感病毒被分为3个分枝,其中疫苗株A/Wisconsin/67/2005独立形成一个分支（类群Ⅰ）,A/Brisbane/59/2007与2007年毒株（除339外）形成类群Ⅱ,2008和2009年毒株聚集成类群Ⅲ。NA基因在质尾区域、极性跨膜区、柄部区域有个别毒株个别位点发生了替换。抗原区域328～336替换频率较高,2008年毒株抗原位点更活跃。A/nanning/242/2007在酶活性位点发生了D151E替换,可能导致NA对扎纳米韦和奥斯他韦的轻微耐药性;A/nanning/242/2007、A/nan ning/561/2008分别在非活性位点N234D,在G286D的替换则可能影响NA介导的病毒粒子的释放从而影响NA蛋白的活性。结论南宁市2007~2009年毒株NA均发生了较大变异,当年疫苗株均滞后南宁流行株。
- 范云燕刘海燕林新勤秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：流感病毒H3N2神经氨酸酶基因分析
- H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶基因特性研究被引量：2
- 2011年
- 目的了解H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶(NA)基因变异规律方法采用狗肾传代细胞法对流感病毒进行分离培养,提取病毒RNA,逆转录-聚合酶链式反应,扩增NA基因后进行核苷酸序列测定。测序结果与WHO全球流感疫苗株序列进行氨基酸序列同源比对,并采用MEGA 4.0构建系统进化树,计算遗传距离。结果 NA氨基酸序列的系统进化树表明,南宁市2007年H3N2亚型人流感病毒株被分为4个分枝,其中大部分病毒株位于分枝Ⅰ和分枝Ⅱ中。氨基酸序列比对表明,NA没有发生氨基酸的缺失与插入,总体上比较保守,NA的酶活性中心、二硫键和糖基化位点基本保持不变。NA不同抗原决定簇变异频率不同,L370S变异出现在多数病毒株中。非结构功能位点也发生了不同程度的变异情况,其中K249E变异是导致分枝Ⅱ出现的主要因素。结论 NA基因的这些特性为流感的防控以及NA抑制剂药物的应用提供了一定的参考依据。
- 刘海燕范云燕林新勤秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：H3N2亚型神经氨酸酶
- 78份HIV抗体不确定标本的结果分析被引量：4
- 2016年
- 目的通过分析HIV抗体不确定结果及其带型进展情况,探讨预示HIV感染的意义和随访工作的重要性。方法收集南宁市疾病预防控制中心实验室2012-2013年的78份HIV抗体不确定标本进行分析免疫印迹法(Western Blot,WB)条带的类型,并对24例个案患者进行了随访,观察WB条带的进展。结果 78份HIV抗体不确定标本中env类共70份,gag类共7份,pol类1份。env类中gp160p24共39份,比例最大。24例随访的个案中,23例为env类型,20例转为HIV抗体阳性,3例条带无进展;还有1例随访个案为p17,1个月后也转为HIV抗体阳性。结论 env类型蛋白的不确定反应最为常见,预示着HIV感染性很大,特别是gp160p24。HIV抗体不确定若为HIV早期感染标志,应该尽早做好随访工作,及时进行诊断。
- 潘海西秦剑秋
- 关键词：HIV抗体
