王萍
- 作品数：11 被引量：17H指数：3
- 供职机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 白血病AML1-ETO融合蛋白转录结合位点在基因组水平的分布规律被引量：1
- 2010年
- 本研究探讨白血病t(8;21)染色体易位形成的融合癌蛋白AML1-ETO在2、9、19号3条染色体上基因组水平的结合位点分布,从而探索其在白血病发生发展过程中异常的转录调控模式,为靶向治疗药物研发以及临床治疗方案优化提供理论基础。应用染色质免疫沉淀技术与高通量的基因芯片相结合的ChIP-on-chip技术,使用覆盖上述3条染色体上所有基因组信息的瓦式基因芯片,在具有t(8;21)染色体易位的Kasumi细胞株上展开研究。实验分为抗ETO特异抗体组和随机打断基因组DNA对照组。通过MAT方法分析ETO抗体组相对于对照组的富集片段;应用CEAS分析工具分析富集片段在基因组上的分布特征,并进一步通过功能富集分析方法挖掘其中潜藏的生物学意义。结果表明:ETO抗体组在2、9、19号染色体上共得到富集片段588条,这些片段在基因组的定位分布特征如下:5.96%位于基因启动子区域,5.49%位于基因外显子区域,48.86%位于增强子区域,37.35%位于基因内含子区域,1.27%位于即时下游区域,0.87%位于3'UTR,0.2%位于5'UTR。进一步功能富集分析结果显示:参与代谢调节、细胞增殖、信号传导等功能的模块在AML1-ETO的潜在靶基因中富集。结论:AML1-ETO融合蛋白在基因组上的结合位点过半分布在经典转录因子结合区域(启动子、5'UTR和增强子),其余近半分布在非经典的区域,其下游调控的分子网络广泛涉及多种重要功能通路。
- 何苗苗石建涛朱雪华金雯王萍张济王侃侃
- 关键词：急性髓系白血病AML1-ETO
- 早幼粒细胞白血病-维A酸受体α融合蛋白对LMO2基因转录调控的影响
- 2012年
- 目的:通过研究急性早幼粒细胞白血病(APL)中染色体融合形成的早幼粒细胞白血病-维A酸受体α(PML-RARα)对红系重要转录因子LMO2基因的转录调控机制,揭示APL中红系分化受阻的潜在机制。方法:利用染色质免疫共沉淀结合多聚酶链反应(ChIP-PCR)技术探讨PML-RARα融合蛋白在体内调控LMO2转录的作用方式。利用荧光素酶报告基因实验研究PML-RARα对LMO2启动子活性的影响。利用逆转录(RT)-PCR技术研究PML-RARα在APL模式细胞株PR9细胞中对LMO2转录的影响。通过分析患者样本数据,观察LMO2在各种急性髓系白血病(AML)中的表达情况。结果:PML-RARα异常融合蛋白结合于LMO2的远端启动子区域,对LMO2的转录活性进行抑制,并且这种抑制呈现梯度依赖的方式。随着PML-RARα的表达升高,LMO2的远端转录本转录水平受到明显抑制,表达量下调。与其他类型的AML以及正常骨髓细胞相比,LMO2在APL中表达较低。结论:LMO2是PML-RARα的靶基因,PML-RARα通过结合在其远端启动子区域对其转录进行负调控。
- 杨贤雯王萍刘静秋王侃侃
- 关键词：转录调控急性髓系白血病
- 老年男性骨质疏松患者阿仑膦酸钠治疗中血清骨保护素水平的变化被引量：2
- 2008年
- 目的观察阿仑膦酸钠治疗3年后骨密度、血清骨保护素（OPG）、相关骨代谢指标及性激素等的变化，探讨阿仑膦酸钠对老年男性骨质疏松患者的治疗作用及其OPG间可能的作用机制。方法随机选取老年男性骨质疏松患者（骨质疏松组）72例及年龄匹配的健康对照者60例（对照组），检测血清OPG浓度。所有骨质疏松患者接受阿仑膦酸钠治疗3年，比较治疗前、后骨密度、血清OPG、性激素、血钙磷、甲状旁腺素、骨钙素、尿Ⅰ型胶原氨基端交联肽（NTX）、尿钙、尿肌酐等的变化。结果骨质疏松组血清OPG（10．56±2．56）pmol／L、骨钙素（9．54±4．40）μg／L、甲状旁腺素（70．39±35．58）ng／L、尿NTX（72．06±9．78）nmol／L，高于对照组的OPG（8．91±2．20）pmol／L、骨钙素（6．77±2．87）μg／L，甲状旁腺素（47．11±21．80）ng／L，尿NTX（63．36±14．61）nmol／L（均为P〈0．05或P〈0．01）。阿仑膦酸钠治疗后，骨密度明显上升，血清OPG降至（8．23±2．96）pmol／L，骨钙素降至（6．18±2．27）μg/L，甲状旁腺素降至（40．46±14．43）ng／L，尿NTX降至（64．83±11．40）nmol／L（均为P〈0．05或P〈0．01）。Spearman相关分析显示治疗前、后骨密度的改变与OPG的变化有关。结论骨质疏松患者血清OPG水平明显高于对照组，阿仑膦酸钠治疗后随骨密度改善OPG浓度下降。阿仑膦酸钠能提高老年男性骨密度，改善骨代谢指标。
- 巩云霞庞小芬严美珠王萍孙静赵咏桔
- 关键词：骨质疏松骨保护素二膦酸盐类
- 血清性激素水平与老年男性骨代谢指标及骨密度的关系被引量：7
- 2008年
- 目的:探讨老年男性血清性激素表达水平与骨代谢指标及骨密度之间的关系。方法:收集老年男性患者230例,年龄65～95岁,分别测定雌二醇(E2)、睾酮、游离睾酮(FT)、性激素结合球蛋白(SHBG)、脱氢表雄酮(DHEA)、骨钙素、骨碱性磷酸酶(BALP)、25-羟维生素D3及尿Ⅰ型胶原交联氨基末端肽(NTX)等指标,同时利用双能X线分别测定髋关节及腰椎(L1～L4)的骨密度,分析老年男性骨密度、骨代谢指标与血清性激素以及年龄与骨密度的相关性。结果:血清E2、FT与腰椎及髋关节的骨密度呈正相关,而睾酮、SHBG、DHEA与骨密度无关。血清E2、FT与骨代谢指标NTX、BALP呈负相关,血清E2与25-羟维生素D3呈正相关,而睾酮、SHBG、DHEA与骨代谢指标NTX、BALP无关。年龄与腰椎L1、L2、L4、L1～4及髋部骨密度呈负相关,与腰椎L3骨密度无关。结论:老年男性骨密度的变化受性激素中FT、E2表达水平的影响,而受E2的影响程度超过雄激素。血清FT及血清E2的水平可作为老年男性骨质疏松症的独立观察指标。
- 孙静庞小芬巩云霞王萍严美珠
- 关键词：骨密度性激素水平老年男性性激素结合球蛋白
- 老年骨质疏松症与动脉硬化间关系的研究
- 研究背景和目的：目前全球骨质疏松症的患病率已跃居各种常见病的第7位,而老年人动脉硬化的发病率亦逐年增高、且是心血管疾病发病危险因素之一。动物实验已证实骨质疏松症与动脉硬化有关, 但发病机制尚不清楚,临床病例骨密度是否与动...
- 王萍庞小芬巩云霞颜美珠
- 文献传递
- 基于非独占式并行计算技术的ChIP-on-chip芯片分析平台
- 2009年
- 随着"后基因组时代"的到来以及各种高通量组学技术的发展,ChIP-on-chip这一新兴的研究细胞内蛋白质与全基因组DNA之间调控机制的实验技术已逐渐成熟并推广。然而由此产生的海量数据也给生物学意义的整合与数据挖掘带来了严峻的挑战。针对ChIP-on-chip得到的高通量原始实验数据,探索如何更有效地开展研究工作,实现了由分析模块、监控模块、并行框架三个模块构建的自适应并行计算系统。系统能非独占式地充分利用计算机资源计算,自动生成富集的DNA序列片段并将其映射到基因组用于后续分析;可比较分析多次实验以评估实验条件、分析不同转录因子之间的协同作用等;其包含的监控模块、并行框架很容易移植入其他开发过程。
- 杨旭智石建涛韩蓓蓓王萍王健张济王侃侃
- 关键词：CHIP-ON-CHIP并行计算
- AML1、AML1-ETO对NUCB2基因转录调控活性的影响
- ＜正＞目的:t（8;21）染色体易位是人类急性髓系白血病M2b亚型中最常见的,由21号染色体上的AML1基因和8号染色体上的ETO基因融合产生AML1-ETO嵌合转录因子。AML1-ETO对在造血分化、增殖以及凋亡等方面...
- 金雯王萍陈赛娟张济王侃侃
- 文献传递
- 老年男性颈动脉粥样硬化与性激素水平的相关性研究
- 目的：以颈动脉中-内膜厚度(intima-media thickness IMT)探讨老年男性颈动脉粥样硬化(Atherosclerosis AS)与内源性性激素的关系。方法：用彩色多普勒高频超声检测86名老年男性颈动脉...
- 朱樱詹维伟任新平庞小芬王萍
- 关键词：老年男性颈动脉粥样硬化性激素超声检测
- 文献传递
- 老年骨质疏松症与动脉硬化间关系的研究
- 目前全球骨质疏松症的患病率已跃居各种常见病的第7位，而老年人动脉硬化的发病率亦逐年增高、且是心血管疾病发病危险因素之一。动物实验已证实骨质疏松症与动脉硬化有关，但发病机制尚不清楚，临床病例骨密度是否与动脉硬化存在关系研究...
- 王萍庞小芬巩云霞颜美珠
- 关键词：老年骨质疏松症动脉硬化发病机制骨密度
- 文献传递
- 性激素与男性骨质疏松被引量：5
- 2007年
- 随着人口老龄化．骨质疏松已成为影响人类健康的重要因素．而男性骨质疏松也已逐渐被认识并得到重视。50岁以上男性骨质疏松的发病率约5％．骨量减少30％～50％。Carlsen等调查了63例男性原发性骨质疏松．结果发现．在原发性骨质疏松患者中．雌激素缺乏比雄激素缺乏更普遍。目前男性骨质疏松的发病机制还未明确．一般认为性腺功能的减退、过度的糖皮质激素使用、不良的生活习惯是3个主要原因。至今．骨质疏松还无有效的治疗措施。
- 王萍庞小芬
- 关键词：雌激素雄激素骨质疏松
