王守源
- 作品数：4 被引量：15H指数：2
- 供职机构：内蒙古大学更多>>
- 发文基金：内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 蛋白质的二级结构序列和结构型被引量：4
- 2002年
- 从蛋白质的二级结构序列出发 ,提出了冗余的概念 ,定义了冗余数量和冗余长度 ,给出了不同结构型蛋白的冗余数量和长度的分布特性 .统计结果表明 α类蛋白中 30 %、β类蛋白中84 %、α/β类蛋白中 95 %的序列不同程度的存在冗余 ,冗余数量和冗余长度主要分布在 1～ 3的范围 .以主二级结构序列三联体为参数 ,利用信息聚类方法对 α类、β类、α/ β类、α+ β类的6 0 0个蛋白进行了聚类 ,结果表明 ,对冗余较少的α类蛋白 85 %以上能够较好地聚类在一枝中 ,但对于冗余较多的其它类蛋白不能分在一个大支中 ,大部分可以分散在多个小支中 .以主二级结构序列三联体为参数 ,利用 Mahalanobis距离方法对上述四种结构型进行预测 ,预测的总体准确率为 81 .1 % .聚类结果和利用 Mahalanobis距离分类结果充分展示了蛋白质二级结构序列对结构型的特殊作用 ,但由于冗余的影响使得二级结构序列的信息并未充分显示出来 .
- 李晓琴王守源罗辽复
- 关键词：二级结构序列信息聚类冗余结构蛋白质
- 氨基酸分类与蛋白质二级结构的相关性和规则结构特征字的研究
- 氨基酸的分类问题一直是人们关注的问题.论文第二章试图换一种思考方式,把信息论方法应用到氨基酸的分类当中.论文第三章首先考虑了氨基酸序列和蛋白质二级结构的关系,给出四联体结构的分类以及四联体置信度的定义,在此基础上提出了结...
- 王守源
- 关键词：氨基酸序列蛋白质二级结构置信度
- 文献传递
- 氨基酸分类与蛋白质二级结构相关性被引量：11
- 2002年
- 从氨基酸序列和蛋白质二级结构相关性出发 ,定义信息剩余度 ,通过信息剩余度极大化 ,推导出从 2 0组到 2组的氨基酸分类结果 ,同时也得到了信息剩余度极大值 (RMAX)
- 王守源李晓琴罗辽复
- 关键词：氨基酸序列蛋白质二级结构
- 氨基酸分类与蛋白质二级结构相关性
- ＜正＞ 氨基酸的分类主要受氨基酸的亲——疏水性、极性、体积等氨基酸理化性质的影响,现在从氨基酸序列和蛋白质二级结构相关性出发,定义信息剩余度:
- 王守源李晓琴罗辽复
- 文献传递
